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Análisis de todo el genoma de la distribución de modificaciones de histonas utilizando el método de secuenciación de inmunoprecipitación de cromatina en Magnaporthe oryzae
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Genome-wide Analysis of Histone Modifications Distribution using the Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Method in Magnaporthe oryzae
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Análisis de todo el genoma de la distribución de modificaciones de histonas utilizando el método de secuenciación de inmunoprecipitación de cromatina en Magnaporthe oryzae

DOI:
10.3791/62423-v

•

09:25 min

•

June 02, 2021

•

, , , , , ,
1Beijing Key Laboratory of New Technology in Agricultural Application, National Demonstration Center for Experimental Plant Production Education, Department of Agronomy,Beijing University of Agriculture

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 00:39Preparation of Protoplasts from M. oryzae
  • 01:48In Vivo Crosslinking and Sonication
  • 03:22IP of Crosslinked Protein/DNA
  • 04:23Collecting and Rinsing the IP Products
  • 05:04Elution and Reverse Crosslinking of Protein/DNA Complexes
  • 05:56Purification and Recovery of DNA
  • 06:51DNA Repair and Solexa Library Construction
  • 08:23Results: Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Method for Genome-wide Histone Modification Analysi
  • 08:53Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Aquí, presentamos un protocolo para analizar la distribución de las modificaciones de histonas en todo el genoma, que puede identificar nuevos genes diana en la patogénesis de M. oryzae y otros hongos filamentosos.

Tags

Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)Histone ModificationsMagnaporthe OryzaeEpigenetic RegulationFungal PathogenesisGenome-wide AnalysisTranscription FactorsDNA-protein InteractionsProtoplast PreparationSonicationAgarose Gel Electrophoresis

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