Strukturbestemmelse av makromolekylære komplekser ved hjelp av kryoEM har blitt rutine for visse klasser av proteiner og komplekser. Her oppsummeres denne rørledningen (prøvepreparering, screening, datainnsamling og prosessering), og leserne er rettet mot ytterligere detaljerte ressurser og variabler som kan endres ved mer utfordrende prøver.