Nesta publicação, descrevemos protocolos para avaliação do desembaraço mucociliar das vias aéreas (MCC) em camundongos in vivo utilizando imagens de radionuclídeos de dupla modalidade. Este protocolo é projetado para uma tomografia computadorizada de emissão de fótons (SPECT) e um protocolo de aquisição de tomografia computadorizada (CT) usando collimadores de corpo inteiro de rato (MWB) em um sistema SPECT/CT duplo.