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グラム陽性菌におけるRNAシーケンシングと結合したMS2-アフィニティ精製

JoVE Journal
Bioquímica

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MS2-Affinity Purification Coupled with RNA Sequencing in Gram-Positive Bacteria

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グラム陽性菌におけるRNAシーケンシングと結合したMS2-アフィニティ精製

DOI:

10.3791/61731-v

•

08:34 min

•

February 23, 2021

•

Noémie Mercier, Karine Prévost, Eric Massé, Pascale Romby, Isabelle Caldelari, David Lalaouna

¹Université de Strasbourg, CNRS, ²Department of Biochemistry,Université de Sherbrooke

Capítulos

00:05Introduction
01:05Bacteria Harvesting and Lysis
02:52MS2-affinity Purification
03:55RNA Extraction of Collected Fractions (CE, FT, W and E)
05:24Results: Constructs Validation and MAPS Controls
07:49Conclusion

Summary

Tadução automática

MAPS技術は、生体内の特定の調節RNAの標的を精査するために開発されました。目的のsRNAは、そのRNAパートナーの共精製とRNAシーケンシングによるそれらの同定を可能にするMS2アプタマーでタグ付けされます。この改変プロトコルは、特にグラム陽性菌に適しています。

Tags

MS2-affinity Purification RNA Sequencing MAPS Gram-positive Bacteria SRNA Regulatory Networks Virulence Factors Biofilm Formation Staphylococcal Infections Cell Lysis Amylose Resin MBP-MS2 Protein Flow-through Fraction

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