Journal
/
Genética
/
Transkription-wide profilering af Protein-RNA interaktioner ved cross-linking og immunoprecipation medieret af FLAG-Biotin Tandem Rensning
JoVE Journal
Genética
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Genética
Transcriptome-Wide Profiling of Protein-RNA Interactions by Cross-Linking and Immunoprecipitation Mediated by FLAG-Biotin Tandem Purification

Transkription-wide profilering af Protein-RNA interaktioner ved cross-linking og immunoprecipation medieret af FLAG-Biotin Tandem Rensning

DOI:
10.3791/60730-v

•

08:46 min

•

May 18, 2020

•

, ,
1Tsinghua-Peking Center for Life Sciences, School of Medicine and School of Life Sciences,Tsinghua University, 2Department of Molecular Biology,University of Texas Southwestern Medical Center

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 00:41Crosslinking
  • 02:44Immunoprecipitation
  • 05:31Dephosphorylation and PNK Treatment
  • 06:53Results: WDR43 and LIN28 FbioCLIP-seq
  • 08:17Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Her præsenterer vi en modificeret CLIP-seq protokol kaldet FbioCLIP-seq med FLAG-biotin tandem rensning for at bestemme RNA-målene for RNA-bindende proteiner (RBPs) i pattedyrceller.

Tags

Protein-RNA InteractionsCLIP-seqFLAG-BiotinTranscriptome-wide ProfilingRBPsMammalian CellsDirect Protein-bound RNAsIsotope-freeSDS-PAGEMembrane TransferMouse Embryonic Stem CellsUV Cross-linkingCell LysisDNase I TreatmentFLAG BeadsFLAG Peptide Elution

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

Analyse af c-KIT ligand-promotoren ved anvendelse af chromatinimmunpræcipitation

Undersøgelse af RNA syntese ved hjælp af 5-Bromouridine mærkning og Immunoprecipitation

Promotor Capture Hej-C: Høj opløsning, Genome-wide profilering af promotor interaktioner

Kromatin Immunoprecipitation af Murine brunt fedtvæv

Multi-locus variabel-tal tandem-Gentag analyse af den fisk-patogene bakterie Yersinia ruckeri ved MULTIPLEX PCR og kapillar elektroforese

CRISPR/Cas9 ribonucleoprotein-medieret præcis Genredigering ved Rørelektroporation

En analyse til kvantificering af protein-RNA-binding i bakterier

Identifikation af fodspor af RNA: protein komplekser via RNA Immunopræcipitation i tandem efterfulgt af sekventering (RIPiT-SEQ)

Omdanne, genomredigering og Phenotyping kvælstofbindende tropisk Cannabaceae træ Parasponia andersonii

Inducerende Hairy Roots af Agrobacterium rhizogenes-MedieretTransformation i Tartary Boghvede (Fagopyrum tataricum)

Read Article