Journal
/
Genética
/
Identifiering av spår av RNA: protein komplex via RNA immunoprecipitation i tandem följt av sekvensering (RIPiT-SEQ)
JoVE Journal
Genética
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Genética
Identification of Footprints of RNA:Protein Complexes via RNA Immunoprecipitation in Tandem Followed by Sequencing (RIPiT-Seq)
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Identifiering av spår av RNA: protein komplex via RNA immunoprecipitation i tandem följt av sekvensering (RIPiT-SEQ)

DOI:
10.3791/59913-v

•

09:26 min

•

July 10, 2019

•

, ,
1Department of Molecular Genetics, Center for RNA Biology,The Ohio State University

Capítulos

  • 00:04Título
  • 01:40Cell Harvesting and Formaldehyde Treatment
  • 02:50FLAG Immunoprecipitation and RNase I Digestion
  • 04:09Affinity Elution and Magnetic Bead-antibody Conjugation
  • 05:14Second Immunoprecipitation
  • 06:12RNA Extraction and Analysis
  • 07:51Results: RNA and Protein Yields
  • 08:38Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Här presenterar vi ett protokoll för att berika endogena RNA bindningsställen eller "fotavtryck" av RNA: protein (RNP) komplex från däggdjursceller. Detta tillvägagångssätt innebär två immunoprecipitations av RNP subenheter och är därför dubbat RNA immunoprecipitation i tandem (ripit).

Tags

RNA ImmunoprecipitationRIPiT-SeqRNA-protein ComplexesEpitope-tagged ProteinCRISPRImmunoprecipitationRNA ExtractionHEK293 CellsRNA Binding ProteinsRNA ProcessingDiseasesNeuropathiesCancer

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

Generation av infödda kromatin Immunoprecipitation sekvensering bibliotek för Nucleosome densitet analys

Utredning av RNA-syntes med 5-Bromouridine märkning och Immunoprecipitation

Detektion av sällsynta händelser med fel-korrigerade DNA och RNA-sekvensering

Konstgjorda RNA-polymeras II förlängning komplex för dissekera Co-transkriptionella RNA bearbetning händelser

Enkelcellig RNA-sekvensering och analys av humana Pankreasöar

Identifiering av cirkulär RNAs med RNA-sekvensering

Tomat rotomvandling följt av inokulering med Ralstonia Solanacearum för enkel genetisk analys av bakteriell vissna sjukdom

Screening och identifiering av RNA-ljuddämpningssuppressorer från utsöndrade effektdämpare av växtpatogener

Transkriptom-Wide Profilering av protein-RNA interaktioner genom cross-linking och immunoprecipitation medierad av FLAG-Biotin Tandem Rening

Upptäcka CsgD regulatoriska mål i salmonella biofilm med kromatin immunoprecipitation och högt dataflöde sekvensering (chip-SEQ)

Read Article