Здесь мы представляем автоматизированный метод пищеварения белка плазмы для количественного протеомического анализа на основе масс-спектрометрии. В этом протоколе, жидкости передачи и инкубации шаги для денатурации белка, сокращение, алкилирование, и трипсин пищеварения реакции упорядочены и автоматизированы. Подготовка 96-хорошей пластины с желаемой точностью занимает около пяти часов.