यहां, हम बड़े पैमाने पर स्पेक्ट्रोमेट्री आधारित मात्रात्मक प्रोटेओमिक विश्लेषण के लिए एक स्वचालित प्लाज्मा प्रोटीन पाचन विधि प्रस्तुत करते हैं। इस प्रोटोकॉल में, प्रोटीन डेन्यूमेंटेशन, कमी, एल्किलेशन और ट्राइप्सिन पाचन प्रतिक्रियाओं के लिए तरल हस्तांतरण और ऊष्मायन कदम सुव्यवस्थित और स्वचालित होते हैं। वांछित परिशुद्धता के साथ 96-अच्छी तरह से प्लेट तैयार करने में लगभग पांच घंटे लगते हैं।