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Tomografia de coerência óptica 3D automatizada para elucidar a morfogênese do biofilme sobre grandes escalas espaciais
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00:09 min
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August 21, 2019
DOI:
1Stream Biofilm and Ecosystem Research Laboratory, School of Architecture, Civil and Environmental Engineering,Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, 2Plateforme technique, School of Architecture, Civil and Environmental Engineering,Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, 3Water Chemistry and Water Technology, Engler-Bunte-Institut,Karlsruhe Institute of Technology, 4Thorlabs GmbH
Summary
Automatically generated
Os biofilmes microbianos formam arquiteturas complexas em interfases e se desenvolvem em padrões espaciais altamente dependentes de escala. Aqui, apresentamos um sistema experimental (Hard-e software) para a aquisição automatizada de conjuntos de dados de tomografia de coerência óptica 3D (OCT). Este conjunto de ferramentas permite a caracterização não invasiva e em várias escalas da morfogênese do biofilme no espaço e no tempo.
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3D Optical Coherence TomographyBiofilm MorphogenesisAutomated SystemLarge Spatial ScalesExtended Time PeriodsEcosystem ProcessesNatural SystemsEngineered EnvironmentsPrecision Positioning DevicePlexiglass FlumeGRBL ServerMicrofluidic DevicesFlow ChambersFlumesFiltration SystemsOCT SystemImage AcquisitionPositioning DeviceDovetail HolderImmersion Adapter
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Depetris, A., Wiedmer, A., Wagner, M., Schäfer, S., Battin, T. J., Peter, H. Automated 3D Optical Coherence Tomography to Elucidate Biofilm Morphogenesis Over Large Spatial Scales. J. Vis. Exp. (150), e59356, doi:10.3791/59356 (2019).
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