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Una plataforma de metil-Seq de rata para identificar cambios epigenéticos asociados a la exposición de estrés
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JoVE Journal Bioquímica
A Rat Methyl-Seq Platform to Identify Epigenetic Changes Associated with Stress Exposure
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Una plataforma de metil-Seq de rata para identificar cambios epigenéticos asociados a la exposición de estrés

DOI:
10.3791/58617-v

•

09:06 min

•

October 24, 2018

•

, , , , , , ,
1Departments of Psychiatry and Behavioral Sciences,Johns Hopkins School of Medicine, 2Department of Medicine,Johns Hopkins School of Medicine, 3Department of Mental Health,Johns Hopkins School of Public Health

Capítulos

  • 00:04Título
  • 01:04Sample Preparation
  • 01:54Hybridization
  • 04:16Bisulfite Conversion
  • 05:29Indexing
  • 06:06Validation by Bisulfite Pyrosequencing
  • 07:18Results: Stress-associated DNA Methylation Changes are verified by Bisulfite Pyrosequencing
  • 08:03Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Aquí, describimos el protocolo y la implementación de metil-Seq, una plataforma de epigenómica, utilizando un modelo de rata para identificar cambios epigenéticos asociados a la exposición de estrés crónico. Los resultados demuestran que la plataforma de metil-Seq de la rata es capaz de detectar diferencias de metilación que surgen de la exposición del estrés en ratas.

Tags

Keywords: Rat Methyl-SeqDNA MethylationEpigenomicsEnvironmental FactorsPhysiological ProcessesStress ExposureSequencing-based ToolArray-based PlatformsDNA ShearingMagnetic BeadsDNA-bindingAdapter LigationMethyl-Seq Block MixCapture Library Hybridization MixStreptavidin Magnetic Beads

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