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Une plate-forme de méthyl-Seq de Rat pour identifier les changements épigénétiques liés à l’exposition de Stress
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A Rat Methyl-Seq Platform to Identify Epigenetic Changes Associated with Stress Exposure
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Une plate-forme de méthyl-Seq de Rat pour identifier les changements épigénétiques liés à l’exposition de Stress

DOI:
10.3791/58617-v

•

09:06 min

•

October 24, 2018

•

, , , , , , ,
1Departments of Psychiatry and Behavioral Sciences,Johns Hopkins School of Medicine, 2Department of Medicine,Johns Hopkins School of Medicine, 3Department of Mental Health,Johns Hopkins School of Public Health

Capítulos

  • 00:04Título
  • 01:04Sample Preparation
  • 01:54Hybridization
  • 04:16Bisulfite Conversion
  • 05:29Indexing
  • 06:06Validation by Bisulfite Pyrosequencing
  • 07:18Results: Stress-associated DNA Methylation Changes are verified by Bisulfite Pyrosequencing
  • 08:03Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Nous décrivons ici le protocole et la mise en œuvre du méthyl-Seq, une plate-forme épigénomique, utilisant un modèle de rat pour identifier les changements épigénétiques liés à l’exposition de stress chronique. Les résultats démontrent que la plate-forme de méthyl-Seq de rat est capable de détecter des différences de méthylation que résultent d’une exposition de stress chez les rats.

Tags

Keywords: Rat Methyl-SeqDNA MethylationEpigenomicsEnvironmental FactorsPhysiological ProcessesStress ExposureSequencing-based ToolArray-based PlatformsDNA ShearingMagnetic BeadsDNA-bindingAdapter LigationMethyl-Seq Block MixCapture Library Hybridization MixStreptavidin Magnetic Beads

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