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High-throughput Identification des séquences régulatrices du gène à l’aide de prochaine génération séquençage du Chromosome circulaire Conformation Capture (4C-seq)
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Genética
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JoVE Journal Genética
High-throughput Identification of Gene Regulatory Sequences Using Next-generation Sequencing of Circular Chromosome Conformation Capture (4C-seq)
DOI:

09:06 min

October 05, 2018

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Capítulos

  • 00:04Título
  • 00:45Formaldehyde Cross-linking and Cell Lysis
  • 01:59First Restriction Digestion and First Ligation
  • 05:07Cross-linking Reversion, Chromatin Isolation, and Further Analyses
  • 07:42Results: Representative Genomic Track of 4C-seq Read Coverage
  • 08:29Conclusion

Summary

Tadução automática

L’identification des interactions physiques entre les gènes et les éléments de régulation est difficile, mais a été facilitée par les méthodes de capture de conformation du chromosome. Cette modification du protocole 4C-seq atténue la partialité de la PCR en réduisant au minimum l’amplification excessive des modèles PCR et maximise la mappability se lit en y incorporant une étape digest d’enzyme de restriction addition.

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