Journal
/
Genética
/
Sjælden begivenhed registrering ved hjælp af fejl-korrigeret DNA og RNA sekventering
JoVE Journal
Genética
This content is Free Access.
JoVE Journal Genética
Rare Event Detection Using Error-corrected DNA and RNA Sequencing

Sjælden begivenhed registrering ved hjælp af fejl-korrigeret DNA og RNA sekventering

DOI:
10.3791/57509-v

•

10:36 min

•

August 03, 2018

•

, , ,
1Department of Pediatrics, Division of Hematology and Oncology,Washington University School of Medicine, 2Center for Genome Sciences and Systems Biology,Washington University School of Medicine

Capítulos

  • 00:04Título
  • 00:33Incorporating i5 and i7 Adapters onto Error-corrected Sequencing Libraries
  • 03:36Quantifying the Libraries with QX200 Digital Droplet PCR (ddPCR)
  • 06:14Amplifying and Normalizing the Libraries for Sequencing
  • 07:37Results: Mutation-calling with Error-corrected Sequencing (ECS)
  • 09:14Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Next generation sequencing (NGS) er et stærkt værktøj for genomisk karakterisering, der er begrænset af den høje fejlrate af platform (~0.5–2.0%). Vi beskriver vores metoder til fejl-korrigeret sekventering, der tillader os at imødegå NGS fejlprocent og påvise mutationer på variant allel brøker så sjældne som 0,0001.

Tags

Rare Event DetectionError-corrected DNA SequencingError-corrected RNA SequencingClonal Single-nucleotide VariantsSmall IndelsUnique Molecular IdentifiersQ5 Master MixPCRMagnetic Bead CleanupIllumina ChemistryGene Panels

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

Methyl-bindende DNA capture sekventering for Patient Væv

Påvisning af Copy Number Ændringer Brug Single Cell Sequencing

Kortlægning af RNA-RNA-interaktioner globalt ved anvendelse af biotinyleret psoralen

Vurdering af DNA forurening i RNA prøver baseret på ribosomale DNA

Robust DNA isoleret og høj overførselshastighed sekventering bibliotek konstruktion til Herbarium prøver

Semi-kvantitative opdagelse af RNA-afhængige RNA Polymerase aktivitet af menneskelige Telomerase Reverse transkriptase Protein

Retrospektiv mikroRNA sekventering: Supplerende DNA bibliotek forberedelse protokollen ved hjælp af Formalin-fast Paraffin-embedded RNA prøver

Metoder til nøjagtig detektering af mitokondrie-DNA methylering

Sekvensering af mRNA fra fuldblod ved hjælp af Nanopmalm sekvensering

In vivo funktionel undersøgelse af sygdoms associerede sjældne humane varianter ved hjælp af Drosophila

Read Article