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Mapping RNA-RNA Interactions Globally Using Biotinylated Psoralen

Mapeando as Interações RNA-ARN Globalmente Usando Psoraleno Biotinilado

DOI:
10.3791/55255-v

•

11:32 min

•

May 24, 2017

•

, , ,
1Stem Cell and Regenerative Biology, Genome Institute of Singapore,A*STAR, 2Computational and Systems Biology, Genome Institute of Singapore,A*STAR

Capítulos

  • 00:05Título
  • 01:12Treatment of HeLa Cells with Biotinylated Psoralen RNA Extraction, and Fragmentation
  • 02:25RNA Size Selection and Elution
  • 04:41Enrichment of RNA Crosslinking Regions
  • 05:57Proximity Ligation
  • 07:34Reverse Crosslinking of Biotinylated Psoralen, and Amplification of cDNA
  • 09:13The SPLASH Workflow and Representative Results
  • 10:50Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Aqui, detalhamos o método de equação de S de sorgo de P soralen reticulado, L igado e Híbridos H elegidos (SPLASH), que permite o mapeamento genômico de interações intramoleculares e intermoleculares RNA-RNA in vivo . SPLASH pode ser aplicado para estudar os interactomas de RNA de organismos, incluindo leveduras, bactérias e seres humanos.

Tags

RNA-RNA InteractionsSPLASHPsoralen CrosslinkingRNA InteractomeRNA GenomicsBiotinylated PsoralenUV CrosslinkingRNA IsolationGel ElectrophoresisSize Selection

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