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Methyl-binding DNA capture Sequencing for Patient Tissues

Sequenciamento de captura de DNA de ligação de metilo em tecidos de pacientes

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•

08:40 min

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October 31, 2016

DOI:

10.3791/54131-v

DOI:
10.3791/54131-v

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08:40 min
October 31, 2016

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1Department of Molecular Medicine,University of Texas Health Science Center at San Antonio, 2Greehey Children’s Cancer Research Institute,University of Texas Health Science Center at San Antonio

Summary

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Aqui apresentamos um protocolo para investigar a metilação do DNA do genoma ampla em grande escala estudos de triagem de pacientes clínicos utilizando o Metil-Binding tecnologia de sequenciamento de DNA Captura (MBDCap-seq ou MBD-seq) eo gasoduto análise bioinformática subsequentes.

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DNA MethylationEpigeneticsPatient CohortsBiomarkersMethyl-binding DNA CaptureSequencingGenome-wide AnalysisCost-effectiveSonicationFragment SizeElutionMagnetic Beads

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Jadhav, R. R., Wang, Y. V., Hsu, Y., Liu, J., Garcia, D., Lai, Z., Huang, T. H. M., Jin, V. X. Methyl-binding DNA capture Sequencing for Patient Tissues. J. Vis. Exp. (116), e54131, doi:10.3791/54131 (2016).

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