Summary

Génération d’organoïdes rétiniens à partir de cellules souches pluripotentes saines et spécifiques à une maladie rétinienne

Published: December 09, 2022
doi:

Summary

Ce protocole décrit une méthode efficace pour différencier les CSPhi en groupes de champs oculaires et générer des organoïdes neuro-rétiniens en utilisant des conditions de culture simplifiées impliquant à la fois des systèmes de culture adhérents et en suspension. D’autres types de cellules oculaires, telles que l’EPR et l’épithélium cornéen, peuvent également être isolés à partir de champs oculaires matures dans des cultures rétiniennes.

Abstract

Les cellules souches pluripotentes peuvent générer des organoïdes tissulaires complexes qui sont utiles pour les études de modélisation in vitro des maladies et pour le développement de thérapies régénératives. Ce protocole décrit une méthode plus simple, robuste et progressive de génération d’organoïdes rétiniens dans un système de culture hybride composé de cultures monocouches adhérentes pendant les 4 premières semaines de différenciation rétinienne jusqu’à l’émergence d’amas primordiaux (EFP) distincts et auto-organisés. De plus, les îlots neuro-rétiniens circulaires et translucides en forme de beignet dans chaque EFP sont cueillis manuellement et cultivés sous suspension à l’aide de boîtes de culture non adhérentes dans un milieu de différenciation rétinienne pendant 1 à 2 semaines pour générer des ventouses optiques 3D multicouches (OC-1M). Ces organoïdes rétiniens immatures contiennent des précurseurs rétiniens multipotents proliférants PAX6+ et ChX10+. Les cellules précurseurs sont auto-assemblées linéairement dans les organoïdes et apparaissent comme des stries radiales distinctes. 4 semaines après la culture en suspension, les progéniteurs rétiniens subissent un arrêt post-mitotique et une différenciation de la lignée pour former des organoïdes rétiniens matures (OC-2M). La lignée photoréceptrice a commis des précurseurs dans les couches les plus externes des organoïdes rétiniens. Ces cellules photoréceptrices CRX+ et RCVRN+ mûrissent morphologiquement pour afficher des extensions de type segment interne. Cette méthode peut être adoptée pour générer des organoïdes rétiniens à l’aide de cellules souches embryonnaires humaines (CSEh) et de cellules souches pluripotentes induites (CSPi). Toutes les étapes et procédures sont clairement expliquées et démontrées pour assurer la reproductibilité et pour des applications plus larges en science fondamentale et en recherche translationnelle.

Introduction

La rétine est un tissu sensible à la lumière présent à l’arrière de l’œil des vertébrés qui convertit les signaux lumineux en impulsions nerveuses par un phénomène biochimique connu sous le nom de voie de photo-transduction. Les impulsions nerveuses initiales générées dans les cellules photoréceptrices de la rétine sont transduites à d’autres interneurones rétiniens et cellules ganglionnaires de la rétine (RGC) et atteignent le cortex visuel du cerveau, ce qui aide à la perception de l’image et à la réponse visuelle.

Selon l’Organisation mondiale de la santé (OMS), environ 1,5 million d’enfants sont aveugles, dont 1 million en Asie. La dystrophie rétinienne héréditaire (IRD) est une maladie cécitante majeure qui touche 1 personne sur 4 000 dans le monde 1,2,3, tandis que la prévalence de la cécité associée à la dégénérescence maculaire liée à l’âge (DMLA) varie de 0,6 % à 1,1 % dans les pays en développement 4. Les IRD sont causés par des défauts génétiques héréditaires dans plus de 300 gènes différents impliqués dans le développement et la fonction rétinienne5. De tels changements génétiques entraînent la perturbation des fonctions rétiniennes normales et la dégénérescence progressive des cellules rétiniennes, à savoir les cellules photoréceptrices et l’épithélium pigmenté rétinien (EPR), entraînant ainsi une perte de vision sévère et la cécité. D’énormes progrès ont été réalisés dans d’autres conditions de mise en aveugle impliquant la cornée, le cristallin, etc. Cependant, les dystrophies rétiniennes et les atrophies du nerf optique n’ont pas de traitement éprouvé à ce jour. Étant donné qu’une rétine humaine adulte n’a pas de cellules souches6, d’autres sources telles que les cellules souches embryonnaires (CSE) et les cellules souches pluripotentes induites (CSPi) dérivées de patients peuvent fournir un approvisionnement illimité de types cellulaires souhaités et sont très prometteuses pour le développement d’organoïdes tissulaires complexes nécessaires aux études de modélisation in vitro des maladies et au développement de thérapies régénératives7, 8,9,10.

Plusieurs années de recherche rétinienne ont permis de mieux comprendre les événements moléculaires qui orchestrent le développement rétinien précoce. La plupart des protocoles de génération de cellules rétiniennes et d’organoïdes 3D à partir de CSP visent à récapituler ces événements de développement in vitro, en cultivant les cellules dans un cocktail complexe de facteurs de croissance et de petites molécules pour moduler les processus biologiques connus de manière progressive. Les organoïdes rétiniens ainsi générés sont composés de cellules rétiniennes majeures : cellules ganglionnaires de la rétine (CGR), interneurones, photorécepteurs et épithélium pigmenté rétinien (EPR)11,12,13,14,15,16,17,18,19 . Malgré des tentatives réussies de modélisation des IRD à l’aide d’organoïdes rétiniens, l’exigence du cocktail complexe de facteurs de croissance et de petites molécules lors de la différenciation et l’efficacité relativement faible de la génération d’organoïdes rétiniens posent un défi majeur avec la plupart des protocoles. Ils comprennent principalement la formation de corps embryoïdes, suivie de leur différenciation progressive en lignées rétiniennes en utilisant des conditions de culture complexes à différents stades de développement in vitro 20,21,22.

Ici, une méthode simplifiée et robuste de développement d’organoïdes neuro-rétiniens 3D complexes à partir d’un contrôle sain et de CSPh spécifiques à une maladie rétinienne est rapportée. Le protocole décrit ici utilise la différenciation directe des cultures de CSPhi quasi confluentes sans avoir besoin de formation de corps embryoïdes. En outre, la complexité du milieu de culture est simplifiée, ce qui en fait une technique rentable et reproductible qui peut être facilement adoptée par les nouveaux chercheurs. Il s’agit d’un système de culture hybride constitué de cultures monocouches adhérentes pendant les 4 premières semaines de différenciation rétinienne jusqu’à l’émergence d’amas primordiaux (EFP) distincts et auto-organisés. De plus, les îlots neuro-rétiniens circulaires de chaque EFP sont cueillis manuellement et cultivés dans des cultures en suspension pendant 1 à 2 semaines pour préparer des coupes rétiniennes 3D multicouches ou des organoïdes constitués de précurseurs neuro-rétiniens proliférants PAX6+ et CHX10+. Une culture prolongée d’organoïdes rétiniens dans un milieu contenant de la taurine de 100 μM pendant 4 semaines supplémentaires a entraîné l’émergence de précurseurs de photorécepteurs RCVRN+ et CRX+ et de cellules matures avec des extensions rudimentaires en forme de segment interne.

Protocol

Toutes les expériences impliquant des CSPh ont été réalisées de manière aseptique, conformément aux pratiques de laboratoire standard, aux lignes directrices en matière d’éthique et de biosécurité, et avec l’approbation d’organismes de réglementation tels que le Comité d’éthique institutionnel (CEI), le Comité institutionnel pour la recherche sur les cellules souches (IC-SCR) et le Comité institutionnel de biosécurité (IBSC). 1. Préparation de la culture iPSC e…

Representative Results

La différenciation des CSPh en lignées oculaires est obtenue en cultivant les cellules dans différents cocktails de milieu de culture contenant des suppléments et des facteurs de croissance par étapes séquentielles à différents moments, comme décrit à la figure 1. Les cultures hiPSC sont maintenues dans le milieu Essential 8, le milieu de maintien des cellules souches pluripotentes. Une fois qu’ils atteignent une confluence de 70 % à 80 % (Figure 2A…

Discussion

Les CSPhi sont un outil puissant pour étudier le développement des organes et des tissus in vitro. Récapituler le phénotype de la maladie en différenciant les CSPh saines des CSP spécifiques à la maladie vers la lignée rétinienne peut aider à mieux comprendre la physiopathologie des différentes formes de dystrophies rétiniennes héréditaires. Plusieurs protocoles ont été décrits et adoptés pour la différenciation in vitro des CSP en types de cellules rétiniennes. La plupart d’entre …

Declarações

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Les auteurs remercient la Dre Chitra Kannabiran, généticienne, pour son soutien scientifique et technique; Dr Subhadra Jalali, consultant en rétine; Dr Milind Naik, chirurgien oculoplastique; et le Dr Swathi Kaliki, oncologue oculaire au LV Prasad Eye Institute, Hyderabad, vers la génération de lignées iPSC normales et spécifiques au patient. Les auteurs remercient les subventions de R&D du Science and Engineering Research Board, Department of Science and Technology (IM), (SB/SO/HS/177/2013), Department of Biotechnology (IM), (BT/PR32404/MED/30/2136/2019) et les bourses de recherche senior de l’ICMR (S.M., D.P.), UGC (T.A.) et CSIR (V.K.P.), gouvernement de l’Inde.

Materials

0.22 µm Syringe filters TPP 99722 
15 mL centrifuge tube TPP 91015
50 mL centrifuge tube TPP 91050
6 well plates TPP 92006
Anti-Chx10 Antibody; Mouse monoclonal Santa Cruz SC365519 1:50 dilution
Anti-CRX antibody; Rabbit monoclonal Abcam ab140603 1:300 dilution
Anti-MiTF antibody, Mouse monoclonal Abcam ab3201 1:250 dilution
Anti-Recoverin Antibody; Rabbit polyclonal      Millipore AB5585 1:300 dilution
B-27 Supplement (50x), serum free Thermo Fisher 17504044
Basic Fibroblast growth factor (bFGF) Sigma Aldrich F0291
Centrifuge 5810R Eppendorf
Coplin Jar (50 mL) Tarson
Corning Matrigel hESC-Qualified Matrix Corning 354277
CryoTubes Thermo Fisher V7884
DMEM/F-12, GlutaMAX supplement (basal medium) Thermo Fisher 10565-018
DreamTaq DNA polymerase Thermo Fisher EP0709
Dulbeco’s Phosphate Buffered Saline Thermo Fisher 14190144
Essential 8 medium kit Thermo Fisher A1517001
Ethylene diamine tetraaceticacid disodium salt dihydrate (EDTA) Sigma Aldrich E5134
Falcon Not TC-treated Treated Petri Dish, 60 mm  Corning 351007
Fetal Bovine Serum, qualified, United States  Gibco 26140079
GelDocXR+ with Image lab software BIO-RAD Agarose Gel documentation system 
GlutaMAX Supplement Thermo Fisher 35050061
Goat anti-Mouse IgG (H+L), Alexa Fluor 488 Invitrogen A11001 1:300 dilution
Goat anti-Mouse IgG (H+L), Alexa Fluor 546 Invitrogen A11030 1:300 dilution
Goat anti-Rabbit IgG (H+L), Alexa Fluo 546 Invitrogen A11035 1:300 dilution
Goat anti-Rabbit- IgG (H+L), Alexa Fluor 488 Invitrogen A11008 1:300 dilution
HistoCore MULTICUT Leica For sectioning
KnockOut Serum Replacement Thermo Fisher 10828028
L-Acsorbic acid Sigma Aldrich A92902
MEM Non-Essential Amino Acids Solution (100x) Thermo Fisher 11140-050
N2 supplement (100x) Thermo Fisher 17502048
NanoDrop 2000 Thermo Fisher To quantify RNA
Paraformaldehyde Qualigens 23995
Pasteur Pipets, 9 inch, Non-Sterile, Unplugged Corning 7095D-9
Penicillin-Streptomycin  Thermo Fisher 15140-122
Recombinant Anti-Otx2 antibody , Rabbit monoclonal Abcam ab183951 1:300 dilution
Recombinant Anti-PAX6 antibody; Rabbit Monoclonal Abcam ab195045 1:300 dilution
Recombinant Anti-RPE65 antibody, Rabbit Monoclonal Abcam ab231782 1:300 dilution
Recombinant Human Noggin Protein R&D Systems 6057-NG
SeaKem LE Agarose Lonza 50004
Serological pipettes 10 mL TPP 94010
Serological pipettes 5 mL TPP 94005
Sodium Chloride Sigma Aldrich S7653
Sodium Citrate Tribasic dihydrate Sigma Aldrich S4641
Starfrost (silane coated) microscopic slides Knittel
SuperScript III First-Strand Synthesis System Thermo Fisher 18080051
SuperScript III First-Strand Synthesis System for RT-PCR Invitrogen 18080051
Triton X-100 Sigma Aldrich T8787
TRIzol Reagent Invitrogen 15596026
UltraPure 0.5 M EDTA, pH 8.0 Thermo Fisher 15575020
VECTASHIELD Antifade Mounting Medium with DAPI  Vector laboratories H-1200 
Vitronectin Thermo Fisher A27940
Y-27632 dihydrochloride (Rho-kinase inhibitor) Sigma Aldrich Y0503
Zeiss LSM 880 Zeiss Confocal microscope

Referências

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Citar este artigo
Mahato, S., Agrawal, T., Pidishetty, D., Maddileti, S., Pulimamidi, V. K., Mariappan, I. Generation of Retinal Organoids from Healthy and Retinal Disease-Specific Human-Induced Pluripotent Stem Cells. J. Vis. Exp. (190), e64509, doi:10.3791/64509 (2022).

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