TGT surface – это инновационная платформа для изучения перекрестных помех фактор роста-интегрин. Гибкая конструкция зонда, специфичность лиганда адгезии и точная модуляция условий стимуляции позволяют проводить надежные количественные оценки взаимодействия EGFR-интегрин. Результаты выделяют EGFR как «механоорганизующую» механику настройки интегрина, влияющую на сборку фокальной адгезии и распространение клеток.
Многоклеточные организмы полагаются на взаимодействия между мембранными рецепторами и родственными лигандами в окружающем внеклеточном матриксе (ECM) для оркестровки нескольких функций, включая адгезию, пролиферацию, миграцию и дифференцировку. Механические силы могут передаваться от клетки через рецептор адгезии интегрин к лигандам в ECM. Количество и пространственная организация этих клеточных сил могут модулироваться рецепторами фактора роста, включая рецептор эпидермального фактора роста (EGFR). Инструменты, доступные в настоящее время для количественной оценки опосредованных перекрестными помехами изменений в клеточной механике и связывания их с фокальными спайками, клеточной морфологией и передачей сигналов, ограничены. Датчики молекулярной силы на основе ДНК, известные как тросы датчиков напряжения (TGT), были использованы для количественной оценки этих изменений. Зонды TGT уникальны своей способностью как модулировать базовый порог силы, так и сообщать о силах рецепторов масштаба пиконьютона по всей поверхности прилипшей клетки с дифракционным ограниченным пространственным разрешением. Используемые здесь зонды TGT основаны на необратимой диссоциации дуплекса ДНК силами рецептор-лиганд, которые генерируют флуоресцентный сигнал. Это позволяет количественно оценить кумулятивное напряжение интегрина (историю силы) клетки. В этой статье описывается протокол, использующий TGT для изучения влияния EGFR на механику интегрина и формирование адгезии. Сборка платформы механического зондирования TGT систематически детализируется, и описана процедура визуализации сил, фокальных спаек и распространения клеток. В целом, способность модулировать порог основной силы зонда, лиганд адгезии, а также тип и концентрацию фактора роста, используемого для стимуляции, делает его надежной платформой для изучения взаимодействия различных мембранных рецепторов в регуляции интегрин-опосредованных сил.
Клетки обладают внутренней способностью ощущать, генерировать и реагировать на механические силы, что приводит к изменениям клеточного фенотипа и ремоделированию местной микросреды 1,2. Силы играют решающую роль в регулировании многих аспектов поведения клеток, включая адгезию, миграцию, пролиферацию, дифференцировку и заживление ран 3,4. Аберрации в двунаправленном механическом обмене между клеткой и микросредой могут привести к болезненным состояниям, включая рак5. Многочисленные мембранные рецепторы участвуют в поддержании гомеостаза клеточного матрикса; из них интегрины и рецептор эпидермального фактора роста (EGFR) имеют надежную синергию 6,7. Классически, интегрины устанавливают механическую связь между микроокружением и внутриклеточным цитоскелетом, в то время как EGFR регулирует рост, пролиферацию и выживаемость клеток 8,9. EGFR является высокоизученной терапевтической мишенью, ориентированной на внешнюю регуляцию, облегчающую внутриклеточную сигнализацию. Перекрестные помехи EGFR-интегрин были установлены генетически и биохимически для регулирования прогрессирования нескольких заболеваний, включая рак10,11. Хотя исследования указывают на существование взаимодействия EGFR-интегрина, результаты объясняются сигнальными путями от плазматической мембраны 7,12,13,14. Влияние EGFR или других факторов роста на клеточную механику остается в значительной степени неисследованным отчасти из-за отсутствия инструментов для измерения клеточных сил и сигнальных результатов. Задача заключается в определении соответствующих инструментов для изучения связи между этими парадигмами параллельной сигнализации и количественной оценки их конкретного вклада в клеточную механику.
Было разработано несколько подходов для измерения сил, генерируемых рецепторами клеточной адгезии, и читатель направляется к углубленному обзору этих методов 15,16. Короче говоря, микроскопия силы тяги и обнаружение микростолповой решетки полагаются на деформацию подстилающей подложки для вывода сил наноньютона (nN), что на порядок больше, чем отдельные рецепторные силы17,18. Одномолекулярные методы, включая AFM и оптический пинцет, чувствительны к силам пиконьютона (pN) одного белка, но измеряют только один рецептор за раз и не предлагают хорошего (или любого) пространственного разрешения. Зонды молекулярного напряжения на основе ДНК и датчики напряжения (TGT) обеспечивают разрешение силы pN с дифракционным ограниченным (или лучшим) пространственным разрешением, что дает им уникальную роль в изучении одноклеточных сил19,20 из различных типов клеток, включая фибробласты, раковые клетки, тромбоциты и иммунные клетки 21,22,23,24 . В то время как молекулярные зонды напряжения имеют выдвижной «пружинный» элемент, идеально подходящий для визуализации в режиме реального времени, зонды TGT необратимо разрываются, оставляя после себя флуоресцентную «историю силы». ТГТ дополнительно модулируют порог натяжения подстилающей подложки; серия зондов с аналогичным химическим составом, но различными силами разрыва или допусками на растяжение (Т-тол), может бытьиспользована для количественной оценки минимального напряжения, необходимого для формирования фокальной адгезии и распространения клеток. Зонды TGT состоят из двух комплементарных нитей ДНК, одна из которых прикреплена к поверхности, а другая представляет лиганд клетке. Если рецептор связывает лиганд и оказывает силу, большую, чемТ-тол зонда, нити будут разделены. Ttol определяется как постоянная сила, необходимая для разрыва 50% зондов с интервалом 2 с в идеальных условиях. В «включенных» зондах TGT гаситель на верхней нити может быть отделен от флуорофора на нижней нити. Только в том случае, если зонд TGT был разорван, предположительно силами, превышающими или равными Ttol, будет генерироваться флуоресцентный сигнал. Зонды TGT также могут быть зафиксированы, что позволяет легко манипулировать биологическими системами и тестировать несколько условий. По этим причинам в этой работе использовались зонды TGT.
Зонды TGT были использованы для изучения того, как интегрин-зависимая клеточная адгезия и механические силы модулируются активированным EGFR21. Эта работа утвердила EGFR в качестве «механоорганизатора», настраивающего координационную адгезионную организацию и генерацию напряжения. Кроме того, было обнаружено, что стимуляция EGF влияет на распределение и зрелость очаговых спаек и усиливает распространение клеток. Этот подход может быть использован в будущих исследованиях для изучения того, как факторы роста влияют на механические силы в прогрессировании и динамике опухоли. В то время как роль перекрестных помех EGFR-интегрина в регуляции эпителиального в мезенхимальный переход установлена, роль механических сил в этом процессе остается недостаточно изученной10.
Здесь представлен подробный протокол для этих экспериментов, охватывающий синтез и сборку 56 pN TGT зондов, генерацию поверхностей TGT на стеклянных крышках, нанесение клеток Cos-7 на поверхность TGT и стимуляцию eGF, фиксацию и окрашивание клеток фаллоидином, а также анти-паксиллиновое антитело, визуализацию полной внутренней флуоресценции внутреннего отражения высокого разрешения (TIRF) и интерференционной контрастной микроскопии отражения (RICM), и количественная оценка изображений. Этот протокол, хотя и написан для исследования стимуляции EGF клеток Cos-7, легко адаптируется для многих экспериментов на основе TGT. Различные лиганды,Т-тол, типы клеток, параметры стимуляции, белки, помеченные после фиксации, и количественный анализ могут быть легко заменены, что делает этот протокол надежным и широко полезным.
С помощью подробной пошаговой процедуры, описанной выше, можно подготовить поверхности TGT для количественной оценки морфологии клеток и напряжения интегрина, создаваемого адгезивными клетками во время прикрепления клеток и распространения после обработки EGF. Простая конструкция зонда, синтез и подготовка поверхности вместе с простой экспериментальной установкой обеспечили стабильную платформу для изучения взаимодействия EGFR и интегринов. В целом, результаты подтверждают, что лиганд-зависимая активация EGFR усиливает распространение клеток, настраивает силоносящие свойства рецепторов интегрина и способствует организации и созреванию фокальной адгезии. Результаты, полученные с использованием зондов TGT, подтверждают всеобъемлющую гипотезу о том, что факторы роста, такие как EGFR, действуют как «механоорганизаторы», увеличивая величину и пространственную организацию напряжения интегрина и регулируя ориентацию и механику фокальных спаек.
При нанесении на поверхность TGT клетки приземляются, прикрепляются и распространяются, поскольку рецепторы интегрина (αVβ3) ощущают и связываются с лигандом cRGDfK. При этом зонды TGT могут быть механически разорваны, создавая флуоресценцию в месте вовлечения лиганда. Считывание — это кумулятивная «история силы» клетки, взаимодействующей с поверхностью. Есть некоторые общие проблемы с поверхностями TGT, которые могут присутствовать во время этих экспериментов. Высокая поверхностная фоновая флуоресценция (рисунок 6A,B), пятнистый внешний вид поверхности, неспособность ячеек генерировать сигнал натяжения (Рисунок 6C,D) и неспособность клеток распространяться (Фиг.6E,F) могут быть вызваны техническими недостатками с зондом TGT или поверхностным синтезом. Решения этих распространенных проблем представлены в таблице 1.
Простая конструкция зондов TGT предоставляет клеточным биологам мощный инструмент для изучения специфических сигнальных результатов фактора роста-интегрина в изоляции без вмешательства со стороны других рецепторов клеточной поверхности, предоставляя только специфические лиганды и стимуляции. Кроме того, зонды TGT позволяют исследовать порог напряжения, подчеркивающий отдельные рецепторы интегрина во время клеточной адгезии при чувствительности pN. Альтернативные подходы не сообщают о силах, оказываемых отдельными рецепторами с высоким пространственным разрешением в фиксированных образцах31. Микроскопия тяговой силы чувствительна только к силам nN, на порядок выше, чем силы, приложенные отдельными рецепторами интегрина15, а молекулярные зонды напряжения измеряют силы pN, но поскольку они обратимы, они не выдерживают фиксации. По этим причинам зонды TGT являются привлекательным инструментом для изучения механики взаимодействия фактор-интегрин роста.
Есть несколько технических нюансов, связанных с зондами TGT, которые следует учитывать перед проектированием эксперимента. Изображение напряжения представляет собой снимок во времени, представляющий историю силы, а не индикатор взаимодействия рецептор-лиганд в любой данный момент времени. Поскольку генерация сигнала зависит от разделения зондов, флуоресценция TGT возникает в результате открытых зондов, не находящихся под активным напряжением от взаимодействия рецептор-лиганд. Это означает, что показания для натяжения интегрина, полученные на поверхности TGT, являются историческими и кумулятивными по своей природе, представляя, где были силы, превышающие Ttol; о расположении токовых рецепторно-лигандных сил менееТ-тол не сообщается19,32. Поскольку разрыв TGT приводит к прекращению взаимодействия рецептор-лиганд, распространение клеток происходит из-за взаимодействий интегрин-лиганд, которые испытывают силы ниже, чем Ttol. Поэтому пользователь должен быть осторожен при определении времени после нанесения покрытия, чтобы оценить механические результаты, связанные с спайками на основе интегрина. Наконец, значение Ttol должно быть рассмотрено. Используемые здесь датчики TGT имеют Ttol 56 pN, где Ttol – постоянная сила, необходимая для разрыва 50% зондов при применении в течение 2 с. При рассмотрении сложных биологических систем ТГТ, вероятно, испытывают гетерогенную и разнообразную градацию сил с различными временными зависимостями. Если ТГТ разрываются силами, превышающимиТ-тол, флуоресценция будет недооценкой общего напряжения. В качестве альтернативы, силы ниже Ttol, приложенные для более длительных периодов времени, могут разорвать такое же количество зондов, как и высокие пороговые силы, применяемые для более короткого времени. Оба этих сценария могут привести к одинаковому показанию интенсивности флуоресценции, что затрудняет определение точной величины или динамики напряжения с помощью датчиков TGT33,34.
В целом, оценки напряженности интегрина при стимуляции фактора роста должны проводиться тщательно путем разработки экспериментов с внутренним контролем, сравнения профилей распространения на других поверхностях с матричным покрытием, параллельных оценок флуоресценции TGT в клетках при наличии или отсутствии стимуляции фактора роста и использования TGT с различным Ttol . ТГТ позволяют количественно оценить роль передачи сигналов фактора роста в регулировании механики рецепторов интегрина, динамике фокальной адгезии и распространении клеток. Этот протокол может быть использован в качестве шаблона для многих экспериментов на основе TGT с использованием зондов с различнымT-толом, различными лигандами, различными типами клеток или различными условиями стимуляции. Любые интересующие белки могут быть помечены после фиксации, и может быть реализован любой тип количественного анализа изображений. Таким образом, мы представляем шаблон для многочисленных экспериментов TGT.
Использование TGT-зондов не ограничивается изучением интегринов, но может быть распространено на разнообразный массив рецепторов клеточной мембраны в разных типах клеток путем модификации лиганда. Зонды TGT были использованы для исследования роли сил в регуляции различных сигнальных каскадов рецепторов, включая определение механической роли механики рецепторов Notch в эмбриональном развитии и нейрогенезе35, сил, опосредующих идентификацию и интернализацию антигенов рецепторамиВ-клеток 36, и механическую способность корректуры рецепторов поверхности Т-клеток обнаруживать изменения сил для повышения силы и специфичности передачи сигнала37. . Вместе эти результаты подчеркивают огромный потенциал зондов TGT в различных экспериментальных условиях.
The authors have nothing to disclose.
Авторы хотели бы поблагодарить членов лаборатории Маттейзеса за плодотворные дискуссии и критику. Мы подтверждаем финансирование A.L.M. от NSF CAREER 1832100 и NIH R01GM131099.
(3-Aminopropyl)triethoxysilane | Millipore Sigma | 440140 | Surface Preparation |
3-hydroxypicolinic acid (3-HPA) | Millipore Sigma | 56197 | Maldi-TOF-MS matrix |
Acetic Acid, Glacial | Fisher Scientific | A38S | Diluting EGF |
Acetonitrile (HPLC) | Fisher Scientific | A998SK | Oligonucleotide Preparation |
Alexa Fluor 488 Phalloidin | Cell Signaling Technology | 8878S | Immunocytochemistry |
Ammonium Chloride | Fisher Scientific | A687 | Immunocytochemistry |
Anti-Paxillin antibody [Y113] | Abcam | ab32084 | Immunocytochemistry |
BD Syringes only with Luer-Lok | BD bioscience | 309657 | Surface Preparation |
Bio-Gel P-2 | Bio-Rad | 1504118 | Oligonucleotide Preparation |
Bovine Serum Albumin (BSA) Protease-free Powder | Fisher Scientific | BP9703100 | Surface Preparation |
Cos-7 cells | ATCC | CRL-1651 | Cell Culture, Passage numbers 11-20 |
Coverslip Mini-Rack, for 8 coverslips | Fisher Scientific | C14784 | Surface Preparation |
c(RGDfK(PEG-PEG)), PEG=8-amino-3,6-dioxaoctanoic acid | Vivitide | PCI-3696-PI | Oligonucleotide Preparation |
Cy3B NHS ester | GE Healthcare | PA63101 | Oligonucleotide Preparation |
Dimethylformamide | Millipore Sigma | PHR1553 | Oligonucleotide Preparation |
DMEM with L-Glutamine, 4.5g/L Glucose and Sodium Pyruvate | Fisher Scientific | MT10013C | Cell Culture |
Epidermal Growth Factor human EGF | Millipore Sigma | E9644 | Cell Culture |
Ethanol, 200 proof (100%) | Fisher Scientific | 22032601 | Surface Preparation |
Falcon Standard Tissue Culture Dishes | Fisher Scientific | 08-772E | Surface Preparation |
Fetal Bovine Serum | Fisher Scientific | 10-438-026 | Cell Culture |
Flurobrite DMEM | Fisher Scientific | A1896701 | Cell Culture |
Goat anti-Rabbit IgG (H+L) Cross-Adsorbed Secondary Antibody, Alexa Fluor 647 | Invitrogen | A-21244 | Immunocytochemistry |
Goat Serum | Fisher Scientific | 16-210-064 | Immunocytochemistry |
Hank’s balanced salts (HBSS) | Fisher Scientific | 14-170-161 | Cell Culture |
Horse Serum | Fisher Scientific | 16050130 | Immunocytochemistry |
Hydrogen Peroxide | Fisher Scientific | H325-500 | Surface Preparation |
Nanosep MF centrifugal devices | Pall laboratory | ODM02C35 | Oligonucleotide Preparation |
NHS-azide | Fisher Scientific | 88902 | Oligonucleotide Preparation |
Nitrogen Gas Cylinder | Airgas | Surface Preparation | |
No. 2 round glass coverslips – 25 mm | VWR | 48382-085 | Surface Preparation |
Parafilm M Laboratory Film | Fisher Scientific | 13-374-10 | Surface Preparation |
Paraformaldehyde 16% | Fisher Scientific | 50-980-487 | Immunocytochemistry |
PBS, 1X | Fisher Scientific | 21-030-CV | Surface Preparation/Immunocytochemistry |
Penicillin-Streptomycin (5,000 U/mL) | Fisher Scientific | 15-070-063 | Cell Culture |
PYREX Low Form Griffin Beakers | Fisher Scientific | 02-540G | Surface Preparation |
Sodium Ascorbate | Fisher Scientific | 18-606-310 | Oligonucleotide Preparation |
Sodium Bicarbonate | Fisher Scientific | S233 | Oligonucleotide Preparation |
Sodium Chloride | Fisher Scientific | BP358 | Surface Preparation |
Streptavidin | Fisher Scientific | 434301 | Surface Preparation |
Sulfo-NHS-LC-Biotin | Fisher Scientific | 21335 | Surface Preparation |
Sulfuric Acid | Fisher Scientific | A300-500 | Surface Preparation |
TEAA | Fisher Scientific | NC0322726 | Oligonucleotide Preparation |
Triethylamine | Millipore Sigma | 471283 | Oligonucleotide Preparation |
Trifluoroacetic Acid (TFA) | Fisher Scientific | PI28901 | Oligonucleotide Preparation |
THPTA | Fisher Scientific | NC1296293 | Oligonucleotide Preparation |
Triton X 100 Detergent Surfact Ams Solution | Fisher Scientific | 85111 | Immunocytochemistry |
Water, DNA Grade, DNASE, Protease free | Fisher Scientific | BP24701 | Oligonucleotide Preparation |
Equipment | |||
Agilent AdvanceBio Oligonucleotide C18 column, 4.6 x 150 mm, 2.7 μm | Agilent | 653950-702 | Oligonucleotide Preparation |
High-performance liquid chromatography | Agilent | 1100 | Oligonucleotide Preparation |
Low Speed Orbital Shaker | Fisher Scientific | 10-320-813 | Immunocytochemistry |
Matrix-assisted laser desorption/ ionization time-of-flight mass spectrometer (MALDI-TOF-MS) | Voyager STR | Oligonucleotide Preparation | |
Molecular Probes Attofluor Cell Chamber | Fisher Scientific | A7816 | Surface Preparation |
Nanodrop 2000 UV-Vis Spectrophotometer | Thermo Fisher | Oligonucleotide Preparation | |
Nikon Eclipse Ti inverted microscope | pe Nikon | Microscopy | |
Nikon Perfect Focus System | Nikon | Microscopy | |
NIS Elements software | Nikon | Microscopy | |
ORCA-Flash4.0 V3 Digital CMOS camera | Hamamatsu | Microscopy | |
Quad band TIRF 405/488/561/647 cube | CHROMA | Microscopy | |
RICM Cube | CHROMA | Microscopy | |
SOLA v-nIR Light Engine | Lumencor | Microscopy | |
Thermo Forma Steri Cycle 370 CO2 Incubator | Fisher Scientific | Cell Culture | |
VWR 75D Ultrasonic Cleaner | VWR | 13710 | Surface Preparation |
Data Analysis | Use | ||
Fiji (Image J) | https://imagej.net/software/fiji/downloads | Quantitative Analysis | |
Graph Pad Prism | Graph Pad | Statistical Analysis | |
Oligo name | 5'modification/ 3' modification | Sequence (5' to 3') | Use |
Alkyne-21-BHQ2 | 5' Hexynyl/ 3' BHQ_2 | GTGAAATACCGCACAGATGCG | Top strand TGT probe |
56 pN TGT | 5' Biosg/TTTTTT/iUniAmM | CGCATCTGTGCGGTATTTCACTTT | Bottom strand TGT probe |
12 pN TGT | 5' AmMC6/ 3' BioTEG | CGCATCTGTGCGGTATTTCACTTT | Bottom strand TGT probe |