식물 형태 유전자는 반발성 유전자형의 유전적 변형을 개선하는 데 사용될 수 있다. 여기에 설명된 것은 3개의 중요한 공공 옥수수 근친선에 대한 아그로박테리움-매개유전형형(QuickCorn) 프로토콜이다.
여기서 입증된 아그로박테리움-매개된 유전자 변형을 사용하여 옥수수 근친 선의 매개 유전 적 변형에 대한 상세한 프로토콜이 있다 [베이비 붐(Bbm)] 및 Wuschel2 (Wus2). Bbm은 옥수수 인지질 전이유전자(Pltp)프로모터에 의해 조절되고, Wus2는 옥수수 보조 유도성(Axig1) 프로모터의 제어하에 있다. 전사 DNA (T-DNA)와 아그로박테리움 독성(vir)유전자의 추가 사본에 이 형태 유전자를 운반하는 농업 박테리움 균주는 옥수수 미성숙 배아 이식을 감염시키기 위하여 이용됩니다. 체세포 배아는 감염된 배아의 scutella에 형성하고 제초제 저항에 의해 선택되고 식물로 발아될 수 있습니다. DNA 구조에 내장된 열 활성화 cre/loxP 재조합 시스템은 변환 과정의 초기 단계에서 옥수수 게놈에서 형태 유전자를 제거할 수 있게 합니다. 이 프로토콜을 사용하여 W22, B73 및 Mo17에 대해 각각 약 14%, 4%, 4%(감염된 배아 100개당 독립적인 형질전환 이벤트 수)의 변환 주파수를 달성할 수 있습니다.
변환은 옥수수에서 외국 유전자 발현을 평가하고 연구 및 상업적 목적을 위해 유전자 변형 옥수수 라인을 생산하기위한 기본 도구입니다. 높은 처리량 변환에 대한 액세스는 옥수수 분자 및 세포 생물학 연구에 대한 증가 된 필요성을 용이하게 할 수 있습니다1. 작물 종을 유전적으로 변형시키는 능력은 공공 및 민간 실험실 모두에게 매우 중요합니다. 이것은 유전자 조절 기계장치의 근본적인 이해뿐만 아니라 끊임없이 증가하는 인구를 지원하기 위하여 글로벌 규모에 작물 개선을 허용합니다.
옥수수에서 미성숙한 배아가 1975 년2에서유래 된 반응성 캘러스의 생산에 사용될 수 있다는 발견. 이 계시 이후, 대부분의 확장 가능한 옥수수 변환 프로토콜은 재생 하기 전에 캘러스 형성 및 선택 필요3. 유전 형질전환 의 과정에서, 아그로박테리움-감염 또는 생물학적 포격 미성숙 배아는 배아 캘러스 유도를 위해 배지에 배양된다. 유도된 칼리는 선택적 매체(예를 들어, 제초제를 함유)에서 배양하여 변형된 캘러스 조각만이 살아남을 수 있도록 합니다. 이 제초제 내성 형질전환 칼리는 벌크업되어 식물로 재생됩니다. 이 방법은 효과적이지만 이 과정은 길고 노동 집약적이며4를완료하는 데 3 개월 이상이 걸릴 수 있습니다. 더 중요한 것은, 종래의 옥수수 변환 프로토콜은 훨씬 더 큰 한계를 가지고, 즉, 옥수수 유전자형의 제한된 수만이5,6을형질전환할 수 있다.
Lowe et al.7,8이전에는 변환 과정의 지속 기간을 크게 줄일 뿐만 아니라 변형 가능한 유전자형 목록을 확장한 “QuickCorn” 변환 방법을 보고했습니다. 퀵콘 방법은 애기장전 전사인 베이비붐(BBM)9와 WUS(WUS)10의옥수수 직교(Zm-Bbm 및 Zm-Wus2)를활용한다. 형질전환 벡터 시스템에 통합될 때, 이들 유전자는 배아성장7을자극하기 위해 상승적으로 작용한다.
이 작업에 설명된 QuickCorn 프로토콜은 Jones et al11의프로토콜을 기반으로 했으며, 이는 Lowe etal7,8에의해 보고된 방법의 추가 개선이었습니다. 본 연구에서, 아그로박테리움 균주 LBA4404(Thy-)는 PHP81430(도1)및 부속 플라스미드 PHP71539(12)를 이진 벡터 컨스트럭션을 포수하는 변형을 위해 사용된다. PHP81430의 T-DNA는 다음과 같은 분자 성분을 함유하고 있다. (1) 변형 선택적 마커 유전자 Hra 발현 카세트. 옥수수 Hra (Zm-Hra)유전자는 설포닐우레아 및 이미다졸리노네스13,14와같은 ALS 억제 제초제에 내성이 있는 변형된 아세톨락타아제 신타제(ALS) 유전자이다. Zm-Hra 유전자는 수수 ALS 프로모터8 및 감자 단백질효소 억제제II(핀II) 터미네이터(15)에 의해 조절된다. T-DNA는 또한 (2) 형질전환 가시적인 마커 유전자 ZsGreen을소유하는 발현 카세트를 함유하고 있다. 이 녹색 형광 단백질 유전자 ZsGreen 에서 Zoanthus sp. 산호초16 는 사탕수수 유비퀴틴 프로모터/인트론 및 쌀 유비퀴틴 터미네이터에 의해 조절된다.
부가적으로, T-DNA는 (3) 형태유전자 Bbm 발현 카세트를 함유한다. Bbm은 배아발달과관련된 전사 인자9,17. Bbm은 옥수수 인지질 트랜스퍼라제단백질(Pltp)프로모터8 및 쌀 T28 터미네이터(18)에 의해 조절된다. Zm-Pltp는 배아 scutellar 상피, 실크 털 및 잎 보조 세포 (가드 세포를 측면으로) 및 생식 기관에서 낮은 발현, 및 뿌리에서 발현이 없는 배아에서 강한 발현을 가진 유전자8. 또한 (4) 형태유전자 Wus2 발현 카세트를 함유한다. Wus2는 정점메리스템(19)의유지관리와 관련된 또 다른 전사 인자이다. Zm-Wus2는 옥수수 보조 유도프로모터(Zm-Axig1)20 및 옥수수 In2-1 터미네이터21의제어하에 있다. 마지막으로, T-DNA는 (5) cre-loxP 재조합 시스템을 함유한다. cre 재조합유전자(22)는 옥수수 열 충격 단백질 17.7(Hsp17.7)23 프로모터 및 감자 핀II 터미네이터의 제어하에 있다. 2개의 loxP 사이트 (동일한 방향)24 측면 ZsGreen, cre, Bbm 및 Wus2를포함하는 4개의 유전자 발현 카세트.
형태 유전자의 존재는 식물 성숙 및 후속 자손에 대한 바람직하지 않기 때문에, 열 유도 cre-loxP 재조합 시스템은 정상적인 캘러스 재생 및 식물 개발을 허용하기 위해 옥수수 게놈에서 형태 유전자를 제거하기 위해 T-DNA에 내장되었다. 열처리 시, CRE 단백질의 발현은 Hra 선택 유전자를 제외한 모든 유전자를 제거한다. 성공적인 변형제는 제초제에 강하지만 ZsGreen-부정적이어야합니다. 형질전환 빈도를 더욱 강화하기 위해, 아그로박테리움 균주는 또한 아그로박테리움 독성(vir) 유전자12의추가 사본을가지고 있는 추가액세서리 플라스미드(PHP71539)를 보유하고 있다.
QuickCorn 방법은 변환 중에 캘러스 유도 단계를 포함하지 않으므로 기존의 옥수수 변환 프로토콜과 다릅니다. Agrobacterium에감염 된 후 첫 주 동안, 체세포 배아는 감염된 미숙한 배아의 scutellar 상피에 개발. 배아는 그 때 배아 성숙을 격려하고 포이를 촬영하는 호르몬을 가진 매체로 옮겨질 것입니다. 체세포 배아를 성숙/촬영 형성 배지로 빠르게 이송하면 이전에 옥수수 변환에 사용되었던 전통적인 캘러스 단계를건너뛰고 T0 식물8의 직접 생성을 허용한다. 이전에 발표된 옥수수 변환 방법6에비해 QuickCorn 방법은 더 빠르고 효율적이며 유전자형의존도가 낮습니다. 이 방법을 사용하여, 뿌리 식물은 일반적으로 단지 5-7 주에 토양으로 전송 할 준비가되어, 오히려 기존의 프로토콜에 필요한 3 개월 이상보다. 이 문서의 목적은 방법의 심층적인 설명과 데모를 제공하여 대부분의 교육 기관에서 일반적으로 발견되는 실험실 환경에서 보다 쉽게 복제할 수 있도록 하는 것입니다.
옥수수 변환을위한 전통적인 프로토콜은 비옥한 식물로 재생되는 형질 전환 캘러스 조직을 생산하기 위해 미성숙 한 종단 배아를 분리하는 패러다임을 따릅니다4,6. 이것이 효과적이지만 캘러스 기반 프로토콜은 시간이 많이 소요될 수 있으며, 식물을 생산하는 조직 배양 과정에는 최대 3개월이 소요됩니다. 여기에 제시 된 방법을 중요하게 만드는 것은 캘러스가없고 효율적이며 빠르며 대략 절반의 기간 내에 T0 식물을 재생 할 수 있다는 것입니다. 또한 유전자형 의존도가 낮고 따라서 대부분의 공개적으로 이용 가능한 근친8,11에효과적일 수있다.
모든 단계를 효과적으로 따라야 하지만 올바른 성장 미디어 준비는 필수적입니다. 성장 매체 성분은 식물 재료가 화학 물질의 적절한 농도를 수신할 수 있도록 사전 및 사후 오토클레이브 모두에서 올바른 단계에 추가되어야 합니다. 이것은 항생제 같이 민감한 화합물이 분해하지 않는 것을 보장할 것입니다. 또한 식물 재료는 프로토콜에 표시된 대로 각 단계에서 올바른 성장 매체에 배치하는 것이 중요합니다. 적절한 성장 매체에 물질을 배치하지 않으면 물질적 사망을 초래할 수 있습니다. 또한, 너무 많은 배아를 배치하거나 플레이트에 조직을 개발하는 것은 피해야한다. 두 배 많은 조직 조각을 배치하는 동안 화학 물질과 페트리 접시의 비용을 절약 할 수 있습니다 (심지어 인큐베이터 공간), 과밀 플레이트에서 조직의 성장을 심각하게 억제 할 수있다. 감염을 수행하는 동안, 아그로박테리움 현탁액의 광학 밀도가 적절하다는 것을 보장해야 한다. 세균 현탁액 밀도가 너무 낮으면 적절한 감염이 발생하지 않을 수 있습니다.
시작 재료의 품질은 변환 프로토콜의 성공을 위해 필수적입니다. 배아 해부에 사용되는 귀는 건강해야하며, 이는 이를 생산하는 식물이 건강하다는 것을 의미합니다. 그(것)들은 또한 적당한 종자 세트를 소유하고 해충 과 질병 자유로운 이어야 합니다. 또한, 오래 된 아그로 박테리움을 사용 하지 않아야 합니다. “어머니”접시는 2 주 이상이어야합니다. 이 시점 이후에는 새로운 실험을 시작하기 위해 새로운 “어머니”접시를 줄무늬로 만들어야합니다.
이 방법은 유전자형 의존도가 낮지만 모든 라인이 동등하게 성공할 것이라고 가정할 수는 없습니다. 사용 중인 구문에 따라 성공의 차이뿐만 아니라 줄 사이에 는 여전히 차이가 있을 수 있습니다. 미성숙 한 배아로 작업 할 때 귀대 귀 가변성도 피할 수 없으므로 이상적으로 실험은 이를 설명하기 위해 여러 귀를 사용해야합니다. 이 작품에서 근친 W22는 B73과 Mo17 (각 ~ 4 %)이 그 뒤를 이어 ~ 14 % 이상의 변환 빈도로 가장 잘 수행되었습니다. Lowe et al.8은 B73 및 Mo17 변환을 위한 QuickCorn 프로토콜을 사용하여 보고되었습니다. 이 작업에서 변환 주파수는 B73의 경우 9%-50%, Mo17의 경우 15%-35%에 이했습니다.
이 작업에서 관찰된 B73 및 Mo17의 낮은 변환 주파수에 대한 한 가지 가능성은 계절적 귀 품질 변동에 기인할 수 있습니다. 이 작업과 Lowe 등8의 또 다른 차이점은 다른 벡터 구문이 여기에 사용되었다는 것입니다. 로우의 작품에서, 형태 유전자는 변형 된 식물에서 제거되지 않고 오히려 개발 후반 단계에서 침묵했다. 이 작용에서, 형태 유전자는 감염 후 8일 후에 제거되었다. B73 및 Mo17은 체세포 배아의 발달을 위해 Bbm/Wus2의 더 긴 존재가 필요할 수 있습니다.
이 방법을 사용하여 비 형질전환 탈출 식물, 다중 삽입 및 비 소모성 전이 유전자를 얻을 가능성이 있습니다. 이 식물은 현저하게 다른 표현형을 갖지 않으므로 식물이 형질 전환인지 여부를 결정하기 위해 PCR에 의한 검출이 필요합니다. 이를 달성하기 위해, 절제된 영역 내의 PCR 프라이머 및 절제된 영역 측면의 프라이머를 사용할 수 있다. 다중 독립적인 변환은 또한 동일한 미성숙한 태아에서 식물을 생성할 수 있어 총 독립적인 형질전환회수율을 결정하는 것이 어렵다. 우리의 표준은 식물을 생산하고 감염된 배아의 수로 이것을 분할하는 각 미성숙 한 배아에서 1개의 식물을 샘플링에 근거를 둔 변환 비율을 계산하는 것입니다. 이 방법은 거의 확실히 식물로 복구 독립적 인 이벤트의 실제 수를 과소 평가. 동일한 배아에서 독립적 인 이벤트 사이의 차별은 트랜스 유전자 주위에 국경 영역을 시퀀싱해야하며, 이것은 대부분의 응용 프로그램에 대해 엄청나게 비싸고 시간이 많이 소요될 것입니다. 그러나 이러한 데이터가 유용한 경우가 있을 수 있습니다.
조직 배양 변환의 이 방법은 아주 효과적인 것으로 입증되었습니다, 그러나 문제는 아직도 생길 수 있습니다. 식물재료가 반응하지 않으면 특정 근친선에 문제가 있을 수 있으며, 이는 성장매체 조성 및 침구시기 와 같은 변수에 조정이 필요하다는 것을 시사한다. 또 다른 변수는 원래 벡터가 변경된 경우 적절한 벡터 설계와 정확한 벡터 생성입니다. 또한 일부 라인은 다른 라인보다 더 민감하기 때문에 imazapyr 감도 문제가있을 수 있으며, imazapyr의 농도는 성공적으로 변형 된 식물을 달성하기 위해 조정해야 할 수도 있습니다.
지난 30 년 동안, 옥수수 조직 배양 및 변환 프로토콜 변경 하 고 진행; 그리고 이 단축된 프로토콜이 이 진보를 더 진전시킬 것으로 믿어진다. 이 방법은 기존의 방법보다 시간이 덜 걸리기 때문에 학술 설정에 효과적입니다. 또한 고도로 숙련된 작업자를 요구하지 않으므로 기존 방법에 비해 광범위한 배포가 더 가능합니다. 미래에는 이 방법을 게놈 엔지니어링과 같은 새로운 기술과 결합할 수 있습니다.
The authors have nothing to disclose.
우리는 옥수수 미숙한 귀를 제공하는 코르테바 온실 팀, 미디어 제작에 도움을 제공하는 코르테바 미디어 준비 실험실, 아그로 박테리움 건설에 대한 도움을 코르테바에서 닝 왕, 도움을 아이오와 주립 대학에서 Keunsub 리 에게 감사드립니다. 이 프로젝트는 부분적으로 국립 과학 재단 식물 게놈 연구 프로그램 교부금 1725122 및 1917138 K.W.에 의해 지원되었다, 예측 식물 페노믹스 연구 연수생 프로그램 (국립 과학 재단 그랜트 DGE-1545453) J.Z.에, USDA NIFA 해치 프로젝트 #IOW04341 의해, 아이오와 주 기금에 의해, 아이오와 주립 대학.
2,4-D | Millipore Sigma | D7299 | |
6-Benzylaminopurine (BAP) | Millipore Sigma | B3408 | |
Acetosyringone | Millipore Sigma | D134406 | |
Agar | Millipore Sigma | A7921 | |
Aluminum foil | To cover the flask | ||
Ammonium Sulfate | Millipore Sigma | A4418 | |
Analytical balance | To weigh small quantities of chemicals | ||
Autocalve | Primus (Omaha, NE) | PSS5-K | To autoclave media and tools |
Bacterial culture loop (10 µl) | Fisher scientific | 22-363-597 | Collects Agrobacterium from plate to transfer to liquid |
Bactoagar | BD bioscience | 214030 | |
Beakers (1 L, 2 L, 4 L) | To mix the chemicals for media | ||
Benomyl | Millipore Sigma | #45339 | |
Bleach (8.25% Sodium Hypochlorite) | Clorox | For seed sterilization | |
Boric Acid | Millipore Sigma | B6768 | |
Calcium Chloride Dihydrate | Millipore Sigma | C7902 | |
Carbenicillin | Millipore Sigma | C3416 | |
Casein Hydrolysate | Phytotech | C184 | |
Cefotaxime | Phytotech | C380 | |
Conical tube (50 mL) | Fisher scientific | 06-443-19 | Contain liquid medium and Agro suspension |
Cuvette (Semi-micro) | Fisher scientific | 14955127 | To hold liquid for measuring OD |
Dicamba | Phytotech | D159 | |
Digital hygrometer | Checking temperature and humidity for heat treatment | ||
EDTA, Disodium Salt, Dihydrate | Millipore Sigma | 324503 | |
Eppendorf tube (2.0 mL) | ThermoFischer Scientific | AM12475 | |
Eriksson's Vitamins | Phytotech | E330 | 1000x in liquid |
Ethanol (70%) | Sterilizing tools and surfaces | ||
Ferrous Sulfate Heptahydrate | Millipore Sigma | F8263 | |
Fertilizer, Osmocote Plus 15-9-12 | ICL Specialty Fertilizers (Dublin, OH) | A903206 | Fertilizer |
Flask (2 L) | Pyrex | 10-090E | To autoclave media and tools |
Flats (Standard 1020, open w/holes, 11"W x 21.37"L x 2.44"D) | Hummert International (Earth City, Mo) | 11300000 | Tray to hold soil and pot insert, fits Humidome |
Forceps (fine-tipped and large) | Fine for handling embryos; larger for large plant materials and use as ear holders | ||
Gentamicin | Gold Biotechnologies | G-400 | |
Glass bottle (1 L) | Pyrex | 06-414-1D | To autoclave medium |
Graduated cylinder | To adjust volume of media | ||
Imazapyr | Millipore Sigma | 37877 | |
Incubator, 20 °C | Percival Scientific | Model I-36NL | To grow mother plate and incubate embryos during Agro infection |
Incubator, 27 °C | Percival Scientific | Model I-36NL | To grow co-cultivation plate and maize embryo culture |
Incubator, 45 °C | Heat shock treatment | ||
Insert TO Standard, pots | Hummert International (Earth City, Mo) | 11030000 | For transplanting plants from rooting to soil, fits flat and Humidome |
Laminar flow hood | Maintains sterile conditions | ||
L-proline | Phytotech | P698 | |
Magnesium Sulfate Heptahydrate | Millipore Sigma | M1880 | |
Maize inbred seed B73 | U.S National Plant Germplasm | id=47638 | |
Maize inbred seed Mo17 | U.S National Plant Germplasm | id=15785 | |
Maize inbred seed W22 | U.S National Plant Germplasm | id=61755 | |
Manganese Sulfate Monohydrate | Millipore Sigma | M7899 | |
Milli-Q Water purification systems | Millipore sigma | MILLIQ | For tissue culture grade water |
MS Basal Medium | Millipore Sigma | M5519 | |
MS Basal Salt Mixture | Millipore Sigma | M5524 | |
N6 Basal Salt Mixture | Millipore Sigma | C1416 | |
Paperclips, non-skid | Holding on tassel bags | ||
Peptone | BD bioscience | 211677 | |
Petri dish (100×15 mm) | Fisher scientific | FB0875713 | For bacteria culture medium |
Petri dish (100×25 mm) | Fisher scientific | FB0875711 | For the plant tissue culture medium |
pH meter | Fisher scientific | AB150 | To adjust pH of media |
Pipette (1 mL) | ThermoFischer Scientific | 4641100N | |
Plastic Boxes | The Container Store | 10048430 | For tissue culture storage and incubation |
Plastic humidy dome (Humi-Dome) | Hummert International (Earth City, Mo) | 14385100 | Plastic cover for soil flat |
Potassium Iodide | Millipore Sigma | 793582 | |
Potassium Nitrate | Millipore Sigma | P8291 | |
Potassium Phosphate Monobasic | Millipore Sigma | P5655 | |
Scale | To weigh chemicals for media | ||
Scalpel Blade (No. 11, 4 cm) | Thermo Scientific | 3120030 | remove the top of the kernel crowns for embryo dissection |
Scalpel handle | Holding scalpel blades | ||
Schenk & Hildebrandt Vitamin (S&H vitamin) | Phytotech | S826 | 100x powder |
Scissors | Cutting ear shoots | ||
Shoot bag (Canvasback- semi-transparent) | Seedburo (Des Plaines, IL) | S26 | Semi-transparent bag to cover ear shoots |
Silver Nitrate | Millipore Sigma | S7276 | |
Sodium Molybdate Dihydrate | Millipore Sigma | M1651 | |
Soiless substrate LC1 | SunGro Horticulture (Agawam, Ma) | #521 | For growing maize plants |
Spatula (Double Ended Micro-Tapered) | Fischer Scientific | 2140110 | Dissecting embryos from kernels |
Spatula (with spoon) | Fisher scientific | 14-375-10 | To measure chemicals for media |
Spectinomycin | Millipore Sigma | S4014 | |
Spectrophotometer (Genesys 10S UV-Vis) | Thermo Scientific | 840-300000 | Measure OD of Agro suspension |
Stirring bar | Fisher scientific | 14-513-67 | To mix media |
Stirring hotplates | To mix media | ||
Syringe (without needle, 60 mL) | Fisher scientific | 14-823-43 | For filter sterilization |
Syringe filter (0.22 µm) | Fisher scientific | 09-720-004 | For filter sterilization |
Tassel bag (Canvasback- brown) | Seedburo (Des Plaines, IL) | T514 | Bag to cover tassels of non-transgenic plants |
Tassel bag (Canvasback-green stripe) | Seedburo (Des Plaines, IL) | T514G | Bag to cover tassels of transgenic plants |
Thiamine HCl | Phytotech | T390 | |
Thidiazuron | Phytotech | T888 | |
Thymidine | Millipore Sigma | T1895 | |
Timentin | Phytotech | T869 | |
Tween 20 | Fisher Scientific | Cas #9005-64-5 | surfactant |
Vortex Genie 2 | Scientific Industries | SI0236 | Homogenizes liquids (Agro suspension) |
Water bath (large – Precision model 186) | Fisher scientific | any that can fit 4+ 2L flasks and reach 55 °C | Keeps autoclaved media at optimal temperature |
Weigh dish | Fisher scientific | 08-732-112 | To measure chemicals for media |
Weighing paper | Fisher scientific | 09-898-12A | To measure chemicals for media |
Yeast Extract | Fisher Scientific | BP14222 | |
Zeatin | Millipore Sigma | Z0164 |