Summary

Generation Integrations-fria inducerade pluripotenta stamceller från humant perifert blod mononukleära celler med användning av episomala vektorer

Published: January 01, 2017
doi:

Summary

This protocol describes a detailed method for efficient generation of integration-free iPSCs from human adult peripheral blood cells. With the use of four oriP/EBNA-based episomal vectors to express the reprogramming factors, KLF4, MYC, BCL-XL, or OCT4 and SOX2, thousands of iPSC colonies can be obtained from 1 mL of peripheral blood.

Abstract

Inducerade pluripotenta stamceller (iPSCs) är mycket lovande för sjukdom modellering och regenerativ behandlingar. Vi har tidigare rapporterat användning av episomala vektorer (EV) för att generera integrationsfria iPSCs från perifera mononukleära blodceller (PB MNC). De episomala vektorer som används är DNA-plasmider införlivas med oriP och EBNA1 element från Epstein-Barr (EB) -virus, som möjliggör replikation och långsiktiga kvarhållande av plasmider i däggdjursceller, respektive. Med ytterligare optimering, kan tusentals IPSC kolonier erhållas från 1 ml perifert blod. Två kritiska faktorer för att uppnå hög omprogrammering effektivitet är: 1) användningen av en 2A "självklyvning" peptid att länka Oct4 och Sox2 på så sätt åstadkomma ekvimolär uttryck av de två faktorerna; 2) användningen av två vektorer för att uttrycka MYC och Klf4 individuellt. Här beskriver vi en steg-för-steg-protokoll för att generera integration fritt iPSC från vuxna perifera blodprover. Den genererade iPSCs är integration fritt som rest episomala plasmider är omätbara efter fem passager. Även om omprogrammering effektivitet är jämförbar med den för Sendai-virus (SV) vektorer, EV plasmider är betydligt mer ekonomiskt än de kommersiellt tillgängliga SV vektorer. Detta prisvärda EV omprogrammering systemet har potential för kliniska tillämpningar inom regenerativ medicin och ger en metod för direkt omprogrammering av PB multinationella till integrationsfria mesenkymala stamceller, neurala stamceller, osv.

Introduction

Efter tvångs uttrycket av flera transkriptionsfaktorer (Dvs. Oct4, Sox2, MYC och Klf4), somatiska celler kan omprogrammeras till inducerade pluripotenta stamceller (iPSCs), som är mycket lovande för tillämpningar inom regenerativ medicin och cellersättningsterapi 1-3. Hittills har olika metoder utvecklats för att öka andelen framgångsrika omprogrammering 4-7. Virala vektorer-inducerade omprogrammering är allmänt används för effektiv generering av iPSCs, eftersom viral integration leder till en hög nivå och stabil expression av de omprogrammering faktorer. Emellertid kan permanent integrering av vektor-DNA i cellgenomet inducera insertionsmutationer 5. Dessutom kan otillräcklig inaktivering av omprogrammering faktorer störa iPSCs differentiering 8. Som sådan, är användningen av iPSCs utan integration av omprogrammering faktorer viktigt, speciellt för användning i cellterapi applikationer.

<p class="jove_content"> Episomala vektorer (EO) används i stor utsträckning i generering av integrationsfria iPSCs. Det mest använda EV är en plasmid som innehåller två element, beskärning av viral replikation (oriP) och EB Nuclear Antigen 1 (EBNA1), från Epstein-Barr (EB) -virus 9. Den oriP elementet främjar plasmid replikation i däggdjursceller, medan EBNA1 elementet binda den oriP-innehållande plasmid DNA till kromosomalt DNA som möjliggör en uppdelning av episom under uppdelningen av värdcellen. I jämförelse med andra integrationsfria metoder, inklusive Sendai-virus (SV) och RNA-transfektion, elbilar har flera fördelar 5,6,10. Som plasmid-DNA, kan elfordon lätt framställas och modifieras i huset, vilket gör dem extremt prisvärd. Dessutom omprogrammering med EV är en mindre arbetsintensiv process eftersom en enda transfektion med elbilar är tillräcklig för iPSC generation, medan flera RNA-transfektioner är nödvändiga för framgångsrik omprogrammering.

DErmal fibroblaster har använts i många omprogrammering studier. Emellertid är hudbiopsi inte bara en invasiv och smärtsam process, men också tidskrävande för att expandera celler till tillräckliga mängder för omprogrammering. Av större betydelse, har hudceller av vuxna donatorer ofta utsatts för långsiktig UV-strålning, vilket kan leda till mutationer associerade med tumörer, vilket begränsar ansökningarna om iPSCs härrör från hudfibroblaster 11,12. Nyligen har det rapporterats att normala humana hudceller ansamlas somatiska mutationer och flera cancergener, inklusive de flesta av de viktigaste drivkrafterna för kutan skivepitelcancer, är under stark positiv selektion 13.

I motsats till hudfibroblaster, perifert blod (PB) celler är en föredragen källa av celler för omprogrammering eftersom 1) blodkroppar kan lätt erhållas genom en minimalt invasiv process, 2) perifera blodceller är avkomman av hematopoietiska stamcellerbosatt i benmärgen, vilket skyddas från skadlig strålning. Perifera mononukleära blodceller (PB MNC) kan samlas i en timme från koncentratskiktet följa en enkel gradient centrifugering med användning av Ficoll-Hypaque (1,077 g / ml). De erhållna PB multinationella består av lymfocyter, monocyter och några hematopoetiska progenitorceller (HPC) 14. Även om humana T-lymfocyter är en av de huvudsakliga celltyperna i PB, mogna T-celler innehåller omlagringar av T-cellreceptorn (TCR) -gener och saknar en intakt genomet vilket sålunda begränsar deras potential för tillämpningar 15,16. Emellertid kan föryngring av T-celler via iPSC generation har potentiella tillämpningar inom chimär Antigen Receptor (CAR) T-cellterapi 17-19. I jämförelse, HPC har en intakt genom och är lätt omprogrammerbara. Även om endast 0,01-0,1% celler i perifera cirkulationen är HPC, kan dessa celler utökas ex vivo i erytroid medium som gynnar spridningen av erythrOID progenitorceller 14.

I vår tidigare studie använde vi faktor BCL-XL utöver Yamanaka faktorer (Oct4, Sox2, MYC och Klf4), vilket resulterade i en ökning av PB omprogrammering verkningsgrad 20 10x. BCL-XL, även känd som BCL2L1, är en potent hämmare av celldöd, genom att hämma aktivering av caspaser 21,22. Men, kan BCL-XL också spela en viktig roll för att upprätthålla pluripotens 21,22. Nyligen har vi ytterligare optimerat vår EV omprogrammering systemet genom att separat uttrycka MYC och Klf4 med två vektorer, vilket leder till en ungefär 100x ökning av omprogrammering effektivitet 23. Med användning av denna metod, omprogrammeringen effektivitet, definierat av koloniantal dividerat med utgångscellantalet vid transfektion, är från 0,2 till 0,5% från friska donatorer. Enligt följande, beskriver vi den detaljerade experimentella förfarandet för generering av integrationsfria iPSCs från PB.

Protocol

Alla humana PB samplar erhölls från anonyma vuxna givare utan identifieringsinformation tillgänglig från Tianjin Blood Center med godkännande av den lokala forskningsetiska kommittén. 1. Endo-free Plasmidberedning Använda ett kommersiellt Plasmid Purification Maxi Kit för att extrahera episomala vektorer från E. coli enligt tillverkarens protokoll. För det sista steget, för att ersätta TE-buffert med endotoxinfritt sterilt vatten upplösa DNA-pelleten. <l…

Representative Results

Med hjälp av detta protokoll, kan vi få hundratals kolonier från 1 x 10 5 nucleofected PB MNC (figurerna 1A och 1B). Omprogrammering effektivitet är cirka 0,2 till 0,5% och kolonierna uttrycker pluripotens markörer (figurerna 1C och 1D). iPSCs fram med hjälp av den beskrivna protokollet är integration fria och har förmågan att bilda teratom komponera 3 germinallager (figurerna 1E och …

Discussion

Förvärva blodprov från friska donatorer eller patienter är bekvämt och icke-invasivt, vilket gör det till en attraktiv cellkälla för grundforskning och klinisk cellterapi. Här har vi beskrivit ett protokoll för effektiv generering av integrationsfria iPSCs från perifera blodprover. Detta reproducerbar och prisvärd strategi bör gynna iPSC fältet.

Vi har rapporterat att det finns två viktiga faktorer som ansvarar för effektiv PB omprogrammering 30. En är ekvimolär …

Declarações

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

This work was supported by the Ministry of Science and Technology of China (2015CB964902, 2013CB966902 and 2012CB966601), the National Natural Science Foundation of China (81500148, 81570164 and 81421002), the Loma Linda University School of Medicine GCAT grant (2015), and Telemedicine and Advanced Technology Research Center (W81XWH-08-1-0697).

Materials

Hematopoietic Stem Cell Expansion Medium Sigma S0192 Store at 4 °C
Human stem cell factor (SCF) Peprotech 300-07 Store at -20 or -80°C
Interleukin-3 (IL-3) Peprotech AF-200-03 Store at -20 or -80°C
Eryrthropoietin (EPO) Peprotech 100-64 Store at -20 or -80°C
Insulin growth factor-1 (IGF-1) Peprotech 100-11 Store at -20 or -80°C
Dexamethasone Sigma D4902 Store at -20 or -80°C
1-thioglycerol (MTG) Sigma M6145 Store at -20 or -80°C
DMEM/F12 medium Gibco 112660-012 Store at 4 °C
L-glutamine (100x) Gibco 25030-081 Store at -20 °C
Penicillin/Streptomycin (100x) Gibco 15140-122 Store at -20 °C
Non-essential amino acids solution (100x) Gibco 11140-050 Store at 4 °C
Fibroblast growth factor 2 (FGF2) Peprotech 100-18B Store at -20 or -80°C
ITS (100x) Gibco 41400-045 Store at 4 °C
Ascorbic acid Sigma 49752 Store at -20 °C
DMEM (high glucose) medium Thermo SH30243.01B Store at 4 °C
FBS Hyclone SV30087.01 Store at -40 °C
Ficoll GE Healthcare, SIGMA 17-5442-02 Store at RT
Trehalose  Sigma T9531 Store at 4 °C
DMSO Sigma D2650 Store at RT, protect from light
Endofree Plasmid Maxi Kit(10) Qiagen 12362 Store at RT
IMDM Gibco 21056-023 Store at 4 °C
Human CD34+ Cell Nucleofection Kit Lonza VPA-1003 Store at RT, nucleofection buffer and supplement buffer should be stored at 4 °C
Sodium butyrate Sigma B5887 Store at -20 or -80°C
ROCK inhibitor Y27632 STEMGENT 04-0012-10 Store at -20 °C
Essential 8 basal medium (E8) Gibco A15169-01 Store at 4 °C, the supplement should be stored at -20 or -80°C
Matrigel BD 354277 Store at -20 or -80°C
2x EasyTaq PCR SuperMix(+dye) TransGen Biotech AS111 Store at -20 °C
Cell detachment solution STEMGENT 01-0006 Store at -20 °C, Accutase as a cell detachment solution to obtain a single cell suspension
DAPI Sigma D9542-1MG Store at 4 °C or -20 °C
Anti-nanog-AF488 BD 560791 Store at 4 °C, primary antibody used for Immunofluorescence, dilute 1/100 when use
Anti-OCT4 abcam ab19857 Store at 4 °C, primary antibody used for Immunofluorescence, dilute 1/100 when use
AF488 donkey anti-mouse IgG Invitrogen A21202 Store at 4 °C, secondary antibody used for Immunofluorescence,  dilute 1/500 when use
PE anti-human TRA-1-60-R Antibody Biolegend 330610 Store at 4 °C, antibody used for flow cytometry
eFluor 570-conjugated anti-SSEA4 eBioscience 41-8843 Store at 4 °C, antibody used for flow cytometry
Isotype antibody eBioscience 11-4011 Store at 4 °C, antibody used for flow cytometry
Alkaline Phosphatase Detection Kit SiDanSai 1102-100 Store at 4 °C
Genomic DNA Extraction Kit TIANGEN DP304-02 Store at RT
Trypan Blue solution Sigma T8154 Store at RT
Flow cytometry cell analyzer BD LSRII for flow cytometry analysis
Spinning disk confocal microscope (SDC) PerkinElmer UltraVIEW VOX for confocal imaging
Nucleofection device Lonza Nucleofector 2b for the nucleofection of PB MNC
ImageQuant LAS-4010 GE take photo of AP staining in bulk

Referências

  1. Takahashi, K., Yamanaka, S. Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic and adult fibroblast cultures by defined factors. Cell. 126, 663-676 (2006).
  2. Takahashi, K., et al. Induction of pluripotent stem cells from adult human fibroblasts by defined factors. Cell. 131, 861-872 (2007).
  3. Trounson, A., McDonald, C. Stem Cell Therapies in Clinical Trials: Progress and Challenges. Cell Stem Cell. 17, 11-22 (2015).
  4. Hayes, M., Zavazava, N. Strategies to generate induced pluripotent stem cells. Methods Mol Biol. 1029, 77-92 (2013).
  5. Zhang, X. B. Cellular reprogramming of human peripheral blood cells. Genomics Proteomics Bioinformatics. 11, 264-274 (2013).
  6. Schlaeger, T. M., et al. A comparison of non-integrating reprogramming methods. Nat Biotechnol. 33, 58-63 (2015).
  7. Okita, K., et al. An efficient nonviral method to generate integration-free human-induced pluripotent stem cells from cord blood and peripheral blood cells. Stem Cells. 31, 458-466 (2013).
  8. Carey, B. W., et al. Reprogramming factor stoichiometry influences the epigenetic state and biological properties of induced pluripotent stem cells. Cell Stem Cell. 9, 588-598 (2011).
  9. Dorigo, O., et al. Development of a novel helper-dependent adenovirus-Epstein-Barr virus hybrid system for the stable transformation of mammalian cells. J Virol. 78, 6556-6566 (2004).
  10. Dowey, S. N., Huang, X., Chou, B. K., Ye, Z., Cheng, L. Generation of integration-free human induced pluripotent stem cells from postnatal blood mononuclear cells by plasmid vector expression. Nat Protoc. 7, 2013-2021 (2012).
  11. Harms, P. W., et al. Next generation sequencing of Cytokeratin 20-negative Merkel cell carcinoma reveals ultraviolet-signature mutations and recurrent TP53 and RB1 inactivation. Mod Pathol. 29, 240-248 (2016).
  12. Abyzov, A., et al. Somatic copy number mosaicism in human skin revealed by induced pluripotent stem cells. Nature. 492, 438-442 (2012).
  13. Martincorena, I., et al. Tumor evolution. High burden and pervasive positive selection of somatic mutations in normal human skin. Science. 348, 880-886 (2015).
  14. Su, R. J., Neises, A., Zhang, X. B. Generation of iPS Cells from Human Peripheral Blood Mononuclear Cells Using Episomal Vectors. Methods Mol Biol. 1357, 57-69 (2016).
  15. Seki, T., et al. Generation of induced pluripotent stem cells from human terminally differentiated circulating T cells. Cell Stem Cell. 7, 11-14 (2010).
  16. Loh, Y. H., et al. Reprogramming of T cells from human peripheral blood. Cell Stem Cell. 7, 15-19 (2010).
  17. Kishino, Y., Seki, T., Yuasa, S., Fujita, J., Fukuda, K. Generation of Induced Pluripotent Stem Cells from Human Peripheral T Cells Using Sendai Virus in Feeder-free Conditions. J Vis Exp. , (2015).
  18. Seki, T., Yuasa, S., Fukuda, K. Generation of induced pluripotent stem cells from a small amount of human peripheral blood using a combination of activated T cells and Sendai virus. Nat Protoc. 7, 718-728 (2012).
  19. Gill, S., June, C. H. Going viral: chimeric antigen receptor T-cell therapy for hematological malignancies. Immunological reviews. 263, 68-89 (2015).
  20. Su, R. J., et al. Efficient generation of integration-free ips cells from human adult peripheral blood using BCL-XL together with Yamanaka factors. PLoS One. 8, e64496 (2013).
  21. Li, Y., et al. The p53-PUMA axis suppresses iPSC generation. Nat Commun. 4, 2174 (2013).
  22. Hardwick, J. M., Youle, R. J. SnapShot: BCL-2 proteins. Cell. 138, 404 (2009).
  23. Wen, W., et al. Enhanced Generation of Integration-free iPSCs from Human Adult Peripheral Blood Mononuclear Cells with an Optimal Combination of Episomal Vectors. Stem Cell Reports. 6, 873-884 (2016).
  24. Zhang, X. B., et al. Trehalose ameliorates the cryopreservation of cord blood in a preclinical system and increases the recovery of CFUs, long-term culture-initiating cells, and nonobese diabetic-SCID repopulating cells. Transfusion. 43, 265-272 (2003).
  25. Watanabe, K., et al. A ROCK inhibitor permits survival of dissociated human embryonic stem cells. Nat Biotechnol. 25, 681-686 (2007).
  26. Basu, S., Campbell, H. M., Dittel, B. N., Ray, A. Purification of specific cell population by fluorescence activated cell sorting (FACS). J Vis Exp. , (2010).
  27. Castiel, A., et al. Cell death associated with abnormal mitosis observed by confocal imaging in live cancer cells. J Vis Exp. , e50568 (2013).
  28. Peterson, S. E., et al. Teratoma generation in the testis capsule. J Vis Exp. , e3177 (2011).
  29. Ritner, C., Bernstein, H. S. Fate mapping of human embryonic stem cells by teratoma formation. J Vis Exp. , (2010).
  30. Wen, W., et al. Enhanced Generation of Integration-free iPSCs from Human Adult Peripheral Blood Mononuclear Cells with an Optimal Combination of Episomal Vectors. Stem Cell Reports. , (2016).
  31. Lo, C. A., et al. Quantification of Protein Levels in Single Living Cells. Cell Rep. 13, 2634-2644 (2015).
  32. Liu, S. P., et al. An improved method for generating integration-free human induced pluripotent stem cells. Zhongguo Shi Yan Xue Ye Xue Za Zhi. 22, 580-587 (2014).
  33. Luni, C., et al. High-efficiency cellular reprogramming with microfluidics. Nat Methods. 13, 446-452 (2016).
  34. Chou, B. K., et al. A facile method to establish human induced pluripotent stem cells from adult blood cells under feeder-free and xeno-free culture conditions: a clinically compliant approach. Stem Cells Transl Med. 4, 320-332 (2015).
  35. Nakagawa, M., et al. A novel efficient feeder-free culture system for the derivation of human induced pluripotent stem cells. Sci Rep. 4, 3594 (2014).
  36. Howden, S. E., et al. Simultaneous Reprogramming and Gene Correction of Patient Fibroblasts. Stem Cell Reports. 5, 1109-1118 (2015).
  37. Meng, X., et al. Rapid and efficient reprogramming of human fetal and adult blood CD34+ cells into mesenchymal stem cells with a single factor. Cell research. 23, 658-672 (2013).
  38. Liao, W., et al. Direct Conversion of Cord Blood CD34+ Cells Into Neural Stem Cells by OCT4. Stem cells translational medicine. 4, 755-763 (2015).
check_url/pt/55091?article_type=t

Play Video

Citar este artigo
Wen, W., Zhang, J., Chen, W., Arakaki, C., Li, X., Baylink, D., Botimer, G. D., Xu, J., Yuan, W., Cheng, T., Zhang, X. Generation of Integration-free Induced Pluripotent Stem Cells from Human Peripheral Blood Mononuclear Cells Using Episomal Vectors. J. Vis. Exp. (119), e55091, doi:10.3791/55091 (2017).

View Video