Summary

Генерация интеграции свободных индуцированные плюрипотентные стволовые клетки из человеческих мононуклеарных клеток периферической крови с помощью эписомальные векторы

Published: January 01, 2017
doi:

Summary

This protocol describes a detailed method for efficient generation of integration-free iPSCs from human adult peripheral blood cells. With the use of four oriP/EBNA-based episomal vectors to express the reprogramming factors, KLF4, MYC, BCL-XL, or OCT4 and SOX2, thousands of iPSC colonies can be obtained from 1 mL of peripheral blood.

Abstract

Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки (ИПСК) весьма перспективны для моделирования заболеваний и регенеративной терапии. Ранее мы сообщали об использовании эписомальные векторы (EV), чтобы генерировать интеграции свободных ИПСК из мононуклеарных клеток периферической крови (PB МНК). В эписомальные векторы используются ДНК – плазмиды с включенным oriP и EBNA1 элементов из вируса Эпштейна-Барр (EB), которые позволяют репликации и долгосрочной retainment плазмид в клетках млекопитающих, соответственно. При дальнейшей оптимизации тысячи Ipsc колоний могут быть получены из 1 мл периферической крови. Два критических факторов для достижения высокой эффективности перепрограммирования являются: 1) использование 2А "саморасщепления" пептид связать OCT4 и SOX2, таким образом достигая эквимолярную экспрессию двух факторов; 2) использование двух векторов для выражения Myc и Klf4 в индивидуальном порядке. Здесь мы опишем протокол шаг за шагом для формирования интеграции свободных IpСтволовые из взрослых образцов периферической крови. Сформированные иПСК являются интеграция свободной как остаточные эписомные плазмиды незаметного после пяти проходов. Хотя эффективность перепрограммирование сравнима с таковой вируса Сендай (SV) векторов, Е. В. Плазмиды значительно более экономичным, чем коммерчески доступные векторы Sv. Эта доступная система EV перепрограммирование имеет потенциал для клинического применения в регенеративной медицине и обеспечивает подход для прямого перепрограммирования PB МНК к интеграции свободных мезенхимальных стволовых клеток, нервных стволовых клеток и др.

Introduction

После принудительного экспрессии некоторых факторов транскрипции (Т.е. Oct4, Sox2, MYC и KLF4), соматические клетки могут быть перепрограммированы в индуцированные плюрипотентные стволовые клетки (ИПСК), которые держат большие перспективы для применения в регенеративной медицине и клеточной заместительной терапии 1-3. На сегодняшний день различные методы были разработаны , чтобы увеличить вероятность успеха перепрограммирования 4-7. Вирусные векторы-индуцированные перепрограммирование широко используется для эффективной генерации ИПСК, так как вирусная интеграция приводит к высокого уровня, стабильной экспрессии факторов перепрограммирования. Тем не менее, постоянная интеграции вектора ДНК в геном клетки может индуцировать инсерционного мутагенеза 5. Кроме того, недостаточная инактивация факторов перепрограммирования может нарушить ИПСК дифференциации 8. Таким образом, использование ИПСК без интеграции факторов перепрограммирования крайне важно, особенно для использования в приложениях клеточной терапии.

<p class="jove_content"> Эписомальные векторы (электромобили) широко используются при генерации интеграции свободных ИПСК. Наиболее часто используемым EV представляет собой плазмиду , содержащую два элемента, происхождения вирусной репликации (oriP) и EB ядерному антигену 1 (EBNA1) из вируса 9 Эпштейна-Барр (EB). Элемент oriP способствует репликации плазмиды в клетках млекопитающих, в то время как элемент EBNA1 в oriP тросов, содержащих ДНК плазмиды к хромосомной ДНК, что позволяет для разбиения эписома во время деления клетки-хозяина. По сравнению с другими интеграционными свободные подходы, в том числе вирус Сендай (SV) и РНК – трансфекции, электромобили обладают множеством преимуществ 5,6,10. Как ДНК плазмиды, электромобили могут быть легко получены и модифицированы в доме, что делает их чрезвычайно доступным. Кроме того, перепрограммирование с EV является менее трудоемким процессом, так как одна трансфекция электромобили достаточна для генерации иПСК, в то время как несколько РНК трансфекцию необходимы для успешного перепрограммирования.

DErmal фибробласты были использованы во многих исследованиях перепрограммирования. Тем не менее, биопсия кожи является не только инвазивные и болезненный процесс, но и отнимает много времени для расширения клеток в количествах, достаточных для перепрограммирования. Еще большее беспокойство, клетки кожи взрослых доноров часто подвергаются длительному УФ светового излучения, что может привести к мутациям , связанных с опухолями, ограничивая таким образом приложения для ИПСК , полученных из фибробластов кожи 11,12. В последнее время , было сообщено , что нормальные клетки кожи человека накапливаются соматические мутации и множественные гены рака, в том числе большинство из ключевых факторов кожными плоскоклеточного рака, находятся под сильным положительным 13 выбора.

В отличие от фибробластов кожи, периферической крови (PB) клетки являются предпочтительным источником клеток для перепрограммирования, так как 1) клетки крови могут быть легко получены с помощью минимально инвазивного процесса, 2) клеток периферической крови являются потомством гемопоэтических стволовых клетокпроживающих в костном мозге, таким образом, защищен от вредного излучения. Мононуклеарные клетки периферической крови (PB МНК) могут быть собраны в часе езды от охристо слоя покрытия следующим простым градиентного центрифугирования с использованием Ficoll-Hypaque (1,077 г / мл). Полученные МНК PB состоят из лимфоцитов, моноцитов и нескольких гемопоэтических клеток – предшественников (HPCS) 14. Хотя человеческие Т – лимфоциты являются одним из основных типов клеток в ПБ, зрелые Т – клетки содержат перегруппировок клеточного рецептора Т (TCR) генов и не имеют неповрежденный геном , таким образом ограничивая их потенциал для применения 15,16. Тем не менее, омоложение Т – клеток с помощью генерации иПСК может иметь потенциальное применение в химерный антиген рецептор (CAR) Т-клеточной терапии 17-19. Для сравнения, HPCS имеют неповрежденный геном и легко перепрограммируемой. Хотя только 0,01 – 0,1% клеток в периферическом кровотоке являются HPCS, эти клетки можно размножить в естественных условиях ех эритроидного среде , что способствует пролиферации erythrOID клетки – предшественники 14.

В нашем предыдущем исследовании мы использовали фактор Bcl-XL в дополнение к факторам Яманака (Oct4, Sox2, MYC и Klf4), что привело к 10 – кратным увеличением PB перепрограммирования Efficency 20. BCL-XL, также известный как BCL2L1, является мощным ингибитором гибели клеток, путем ингибирования активации каспазы 21,22. Но, BCL-XL также может играть важную роль в поддержании плюрипотентности 21,22. В последнее время мы дополнительно оптимизировать нашу систему EV перепрограммирования путем раздельного выражения MYC и Klf4 с двумя векторами, что приводит к приблизительно 100x повышению эффективности перепрограммирования 23. С помощью этого метода, эффективность перепрограммирования, определяется числом колоний, деленной на число клеток, начиная при трансфекции, составляет 0,2 – 0,5% от здоровых доноров. Как следует, мы опишем подробную экспериментальную процедуру для генерации интеграции свободных ИПСК из PB.

Protocol

Все человеческие образцы PB были получены от анонимных взрослых доноров без опознавательных информации, доступной из Тяньцзиня Центра крови с согласия местного комитета по этике. 1. Эндо свободной Плазмида Подготовка Используйте коммерческий набор Плазмида очист…

Representative Results

Используя этот протокол, можно получить сотни колоний от 1 х 10 5 nucleofected РВ МНК (фигуры 1А и 1В). Эффективность перепрограммирования составляет приблизительно 0,2 – 0,5% и колонии выражают маркеры плюрипотентности (рис 1C и 1D). иПСК , сг…

Discussion

Получение образцов крови у здоровых доноров или пациентов, удобна и неинвазивный, что делает его привлекательным источником клеток для проведения фундаментальных исследований и клинической клеточной терапии. Здесь мы описали протокол для высокоэффективной генерации интеграции сво?…

Declarações

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

This work was supported by the Ministry of Science and Technology of China (2015CB964902, 2013CB966902 and 2012CB966601), the National Natural Science Foundation of China (81500148, 81570164 and 81421002), the Loma Linda University School of Medicine GCAT grant (2015), and Telemedicine and Advanced Technology Research Center (W81XWH-08-1-0697).

Materials

Hematopoietic Stem Cell Expansion Medium Sigma S0192 Store at 4 °C
Human stem cell factor (SCF) Peprotech 300-07 Store at -20 or -80°C
Interleukin-3 (IL-3) Peprotech AF-200-03 Store at -20 or -80°C
Eryrthropoietin (EPO) Peprotech 100-64 Store at -20 or -80°C
Insulin growth factor-1 (IGF-1) Peprotech 100-11 Store at -20 or -80°C
Dexamethasone Sigma D4902 Store at -20 or -80°C
1-thioglycerol (MTG) Sigma M6145 Store at -20 or -80°C
DMEM/F12 medium Gibco 112660-012 Store at 4 °C
L-glutamine (100x) Gibco 25030-081 Store at -20 °C
Penicillin/Streptomycin (100x) Gibco 15140-122 Store at -20 °C
Non-essential amino acids solution (100x) Gibco 11140-050 Store at 4 °C
Fibroblast growth factor 2 (FGF2) Peprotech 100-18B Store at -20 or -80°C
ITS (100x) Gibco 41400-045 Store at 4 °C
Ascorbic acid Sigma 49752 Store at -20 °C
DMEM (high glucose) medium Thermo SH30243.01B Store at 4 °C
FBS Hyclone SV30087.01 Store at -40 °C
Ficoll GE Healthcare, SIGMA 17-5442-02 Store at RT
Trehalose  Sigma T9531 Store at 4 °C
DMSO Sigma D2650 Store at RT, protect from light
Endofree Plasmid Maxi Kit(10) Qiagen 12362 Store at RT
IMDM Gibco 21056-023 Store at 4 °C
Human CD34+ Cell Nucleofection Kit Lonza VPA-1003 Store at RT, nucleofection buffer and supplement buffer should be stored at 4 °C
Sodium butyrate Sigma B5887 Store at -20 or -80°C
ROCK inhibitor Y27632 STEMGENT 04-0012-10 Store at -20 °C
Essential 8 basal medium (E8) Gibco A15169-01 Store at 4 °C, the supplement should be stored at -20 or -80°C
Matrigel BD 354277 Store at -20 or -80°C
2x EasyTaq PCR SuperMix(+dye) TransGen Biotech AS111 Store at -20 °C
Cell detachment solution STEMGENT 01-0006 Store at -20 °C, Accutase as a cell detachment solution to obtain a single cell suspension
DAPI Sigma D9542-1MG Store at 4 °C or -20 °C
Anti-nanog-AF488 BD 560791 Store at 4 °C, primary antibody used for Immunofluorescence, dilute 1/100 when use
Anti-OCT4 abcam ab19857 Store at 4 °C, primary antibody used for Immunofluorescence, dilute 1/100 when use
AF488 donkey anti-mouse IgG Invitrogen A21202 Store at 4 °C, secondary antibody used for Immunofluorescence,  dilute 1/500 when use
PE anti-human TRA-1-60-R Antibody Biolegend 330610 Store at 4 °C, antibody used for flow cytometry
eFluor 570-conjugated anti-SSEA4 eBioscience 41-8843 Store at 4 °C, antibody used for flow cytometry
Isotype antibody eBioscience 11-4011 Store at 4 °C, antibody used for flow cytometry
Alkaline Phosphatase Detection Kit SiDanSai 1102-100 Store at 4 °C
Genomic DNA Extraction Kit TIANGEN DP304-02 Store at RT
Trypan Blue solution Sigma T8154 Store at RT
Flow cytometry cell analyzer BD LSRII for flow cytometry analysis
Spinning disk confocal microscope (SDC) PerkinElmer UltraVIEW VOX for confocal imaging
Nucleofection device Lonza Nucleofector 2b for the nucleofection of PB MNC
ImageQuant LAS-4010 GE take photo of AP staining in bulk

Referências

  1. Takahashi, K., Yamanaka, S. Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic and adult fibroblast cultures by defined factors. Cell. 126, 663-676 (2006).
  2. Takahashi, K., et al. Induction of pluripotent stem cells from adult human fibroblasts by defined factors. Cell. 131, 861-872 (2007).
  3. Trounson, A., McDonald, C. Stem Cell Therapies in Clinical Trials: Progress and Challenges. Cell Stem Cell. 17, 11-22 (2015).
  4. Hayes, M., Zavazava, N. Strategies to generate induced pluripotent stem cells. Methods Mol Biol. 1029, 77-92 (2013).
  5. Zhang, X. B. Cellular reprogramming of human peripheral blood cells. Genomics Proteomics Bioinformatics. 11, 264-274 (2013).
  6. Schlaeger, T. M., et al. A comparison of non-integrating reprogramming methods. Nat Biotechnol. 33, 58-63 (2015).
  7. Okita, K., et al. An efficient nonviral method to generate integration-free human-induced pluripotent stem cells from cord blood and peripheral blood cells. Stem Cells. 31, 458-466 (2013).
  8. Carey, B. W., et al. Reprogramming factor stoichiometry influences the epigenetic state and biological properties of induced pluripotent stem cells. Cell Stem Cell. 9, 588-598 (2011).
  9. Dorigo, O., et al. Development of a novel helper-dependent adenovirus-Epstein-Barr virus hybrid system for the stable transformation of mammalian cells. J Virol. 78, 6556-6566 (2004).
  10. Dowey, S. N., Huang, X., Chou, B. K., Ye, Z., Cheng, L. Generation of integration-free human induced pluripotent stem cells from postnatal blood mononuclear cells by plasmid vector expression. Nat Protoc. 7, 2013-2021 (2012).
  11. Harms, P. W., et al. Next generation sequencing of Cytokeratin 20-negative Merkel cell carcinoma reveals ultraviolet-signature mutations and recurrent TP53 and RB1 inactivation. Mod Pathol. 29, 240-248 (2016).
  12. Abyzov, A., et al. Somatic copy number mosaicism in human skin revealed by induced pluripotent stem cells. Nature. 492, 438-442 (2012).
  13. Martincorena, I., et al. Tumor evolution. High burden and pervasive positive selection of somatic mutations in normal human skin. Science. 348, 880-886 (2015).
  14. Su, R. J., Neises, A., Zhang, X. B. Generation of iPS Cells from Human Peripheral Blood Mononuclear Cells Using Episomal Vectors. Methods Mol Biol. 1357, 57-69 (2016).
  15. Seki, T., et al. Generation of induced pluripotent stem cells from human terminally differentiated circulating T cells. Cell Stem Cell. 7, 11-14 (2010).
  16. Loh, Y. H., et al. Reprogramming of T cells from human peripheral blood. Cell Stem Cell. 7, 15-19 (2010).
  17. Kishino, Y., Seki, T., Yuasa, S., Fujita, J., Fukuda, K. Generation of Induced Pluripotent Stem Cells from Human Peripheral T Cells Using Sendai Virus in Feeder-free Conditions. J Vis Exp. , (2015).
  18. Seki, T., Yuasa, S., Fukuda, K. Generation of induced pluripotent stem cells from a small amount of human peripheral blood using a combination of activated T cells and Sendai virus. Nat Protoc. 7, 718-728 (2012).
  19. Gill, S., June, C. H. Going viral: chimeric antigen receptor T-cell therapy for hematological malignancies. Immunological reviews. 263, 68-89 (2015).
  20. Su, R. J., et al. Efficient generation of integration-free ips cells from human adult peripheral blood using BCL-XL together with Yamanaka factors. PLoS One. 8, e64496 (2013).
  21. Li, Y., et al. The p53-PUMA axis suppresses iPSC generation. Nat Commun. 4, 2174 (2013).
  22. Hardwick, J. M., Youle, R. J. SnapShot: BCL-2 proteins. Cell. 138, 404 (2009).
  23. Wen, W., et al. Enhanced Generation of Integration-free iPSCs from Human Adult Peripheral Blood Mononuclear Cells with an Optimal Combination of Episomal Vectors. Stem Cell Reports. 6, 873-884 (2016).
  24. Zhang, X. B., et al. Trehalose ameliorates the cryopreservation of cord blood in a preclinical system and increases the recovery of CFUs, long-term culture-initiating cells, and nonobese diabetic-SCID repopulating cells. Transfusion. 43, 265-272 (2003).
  25. Watanabe, K., et al. A ROCK inhibitor permits survival of dissociated human embryonic stem cells. Nat Biotechnol. 25, 681-686 (2007).
  26. Basu, S., Campbell, H. M., Dittel, B. N., Ray, A. Purification of specific cell population by fluorescence activated cell sorting (FACS). J Vis Exp. , (2010).
  27. Castiel, A., et al. Cell death associated with abnormal mitosis observed by confocal imaging in live cancer cells. J Vis Exp. , e50568 (2013).
  28. Peterson, S. E., et al. Teratoma generation in the testis capsule. J Vis Exp. , e3177 (2011).
  29. Ritner, C., Bernstein, H. S. Fate mapping of human embryonic stem cells by teratoma formation. J Vis Exp. , (2010).
  30. Wen, W., et al. Enhanced Generation of Integration-free iPSCs from Human Adult Peripheral Blood Mononuclear Cells with an Optimal Combination of Episomal Vectors. Stem Cell Reports. , (2016).
  31. Lo, C. A., et al. Quantification of Protein Levels in Single Living Cells. Cell Rep. 13, 2634-2644 (2015).
  32. Liu, S. P., et al. An improved method for generating integration-free human induced pluripotent stem cells. Zhongguo Shi Yan Xue Ye Xue Za Zhi. 22, 580-587 (2014).
  33. Luni, C., et al. High-efficiency cellular reprogramming with microfluidics. Nat Methods. 13, 446-452 (2016).
  34. Chou, B. K., et al. A facile method to establish human induced pluripotent stem cells from adult blood cells under feeder-free and xeno-free culture conditions: a clinically compliant approach. Stem Cells Transl Med. 4, 320-332 (2015).
  35. Nakagawa, M., et al. A novel efficient feeder-free culture system for the derivation of human induced pluripotent stem cells. Sci Rep. 4, 3594 (2014).
  36. Howden, S. E., et al. Simultaneous Reprogramming and Gene Correction of Patient Fibroblasts. Stem Cell Reports. 5, 1109-1118 (2015).
  37. Meng, X., et al. Rapid and efficient reprogramming of human fetal and adult blood CD34+ cells into mesenchymal stem cells with a single factor. Cell research. 23, 658-672 (2013).
  38. Liao, W., et al. Direct Conversion of Cord Blood CD34+ Cells Into Neural Stem Cells by OCT4. Stem cells translational medicine. 4, 755-763 (2015).
check_url/pt/55091?article_type=t

Play Video

Citar este artigo
Wen, W., Zhang, J., Chen, W., Arakaki, C., Li, X., Baylink, D., Botimer, G. D., Xu, J., Yuan, W., Cheng, T., Zhang, X. Generation of Integration-free Induced Pluripotent Stem Cells from Human Peripheral Blood Mononuclear Cells Using Episomal Vectors. J. Vis. Exp. (119), e55091, doi:10.3791/55091 (2017).

View Video