Summary

Generasjon Integrerings--frie Utførte Pluripotent stamceller fra menneskelige perifere mononukleære blodceller Bruke episomale vektorer

Published: January 01, 2017
doi:

Summary

This protocol describes a detailed method for efficient generation of integration-free iPSCs from human adult peripheral blood cells. With the use of four oriP/EBNA-based episomal vectors to express the reprogramming factors, KLF4, MYC, BCL-XL, or OCT4 and SOX2, thousands of iPSC colonies can be obtained from 1 mL of peripheral blood.

Abstract

Indusert Pluripotent stamceller (iPSCs) holder store løftet for sykdom modellering og regenerativ behandling. Vi har tidligere rapportert ved bruk av episomale vektorer (EV) for å generere integrasjonsfrie iPSCs fra perifert blod mononukleære celler (MNC) PB. De episomale vektorer som anvendes er DNA-plasmider innlemmet med oriP og EBNA1 elementer fra Epstein-Barr (EB) virus, som gir mulighet for replikasjon og langvarig bibeholdelse av plasmider i pattedyrceller, respektivt. Med ytterligere optimalisering, kan tusenvis av IPSC kolonier oppnås fra 1 ml av perifert blod. To viktige faktorer for å oppnå høy effektivitet omprogrammering er: 1) bruk av et 2A "selv-spaltning" peptid for å koble OCT4 og SOX2, og dermed oppnå ekvimolar ekspresjon av de to faktorer; 2) bruk av to vektorer for å uttrykke MYC og KLF4 individuelt. Her beskriver vi en steg-for-steg-protokollen for å generere integrering fritt iPSC'er fra voksne perifere blodprøver. De genererte iPSCs er integrering fritt som rest episomale plasmider er umulig å oppdage etter fem passasjer. Selv om omprogrammering effektivitet er sammenlignbar med Sendai-virus (SV) vektorer, EV plasmider er betydelig mer økonomisk enn de kommersielt tilgjengelige SV vektorer. Denne rimelige EV omprogrammering system har potensial for kliniske applikasjoner i regenerativ medisin og gir en tilnærming for direkte omprogrammering av PB MNCs til integrering fritt stamceller, nevrale stamceller, osv.

Introduction

Etter tvunget uttrykk for flere transkripsjonsfaktorer (Dvs. OCT4, SOX2, MYC og KLF4), kan somatiske celler omprogrammeres til indusert Pluripotent stamceller (iPSCs), som holder store løftet for applikasjoner i regenerativ medisin og celle replacement therapy 1-3. Hittil har ulike metoder blitt utviklet for å øke suksessraten for omprogrammering 4-7. Virale vektorer-indusert omprogrammering er mye brukt for effektiv generering av iPSCs, fordi viral integrering fører til et høyt nivå, stabil ekspresjon av de reprogrammerings-faktorer. Imidlertid kan permanent integrering av vektor DNA i cellegenomet indusere insertional mutagenese 5. I tillegg kan utilstrekkelig inaktivering av reprogrammerings faktorer forstyrrer iPSCs differensiering 8. Som sådan, er bruken av iPSCs uten integrering av reprogrammerings faktorer avgjørende, spesielt for bruk i celleterapi anvendelser.

<p class="jove_content"> Episomale vektorer (elbiler) er mye brukt i produksjon av integrasjonsfritt iPSCs. Den mest brukte EV er et plasmid inneholdende to elementer, opprinnelse på viral replikasjon (oriP) og EB Nuclear antigen 1 (EBNA1), fra Epstein-Barr (EB) virus 9. Den oriP element fremmer plasmid replikasjon i pattedyrceller, mens den EBNA1 element platformer den oriP-inneholdende plasmid-DNA til kromosomalt DNA som gjør det mulig for oppdeling av episom under delingen av vertscellen. I forhold til andre integrasjonsfrie tilnærminger, inkludert Sendai Virus (SV) og RNA transfeksjon, elbiler har flere fordeler 5,6,10. Som plasmid DNA, kan elbiler lett produsert og endret i huset, noe som gjør dem svært rimelig. I tillegg omprogrammering med EV er en mindre arbeidskrevende prosess, siden en enkelt transfeksjon med el-biler er tilstrekkelig for IPSC generasjon, mens flere RNA-transfeksjoner er nødvendig for vellykket omprogrammering.

Dermal fibroblaster er blitt anvendt i mange studier omprogrammering. Imidlertid er huden biopsi ikke bare en invasiv og smertefull prosess, men også tidkrevende for å utvide cellene til tilstrekkelige mengder for omprogrammering. Av større interesse er det hudceller hos voksne givere ofte vært utsatt for langvarig UV-lysstråling, som kan føre til mutasjoner assosiert med tumorer, og dermed begrense søknadene for iPSCs avledet fra hudfibroblaster 11,12. Nylig har det blitt rapportert at normale menneskelige hudceller samle somatiske mutasjoner og flere kreftgener, inkludert de fleste av de viktigste driverne av kutane plateepitelkarsinom, er under sterk positiv seleksjon 13.

I motsetning til hudfibroblaster, perifert blod (PB) -celler er en foretrukket kilde for celler for omprogrammering fordi 1) blodlegemer kan lett oppnås ved en minimalt invasiv prosess, 2) perifere blodceller er avkommet av hematopoetiske stamcellerbosatt i benmargen, og dermed beskyttet mot skadelig stråling. Perifere blod mononukleære celler (MNC) PB kan samles i en time fra buffy coat-lag etter en enkel sentrifugering ved hjelp av Ficoll-Hypaque (1,077 g / ml). De oppnådde PB MNCer er sammensatt av lymfocytter, monocytter og noen Hematopoetiske progenitorceller (HPCS) 14. Selv om humane T-lymfocytter er en av de store celletyper i PB, modne T-celler inneholder rearrangementer av T-cellereseptoren (TCR) gener og mangler et intakt genom og dermed begrense deres muligheter for anvendelser 15,16. Imidlertid kan foryngelse av T-celler via IPSC generasjon har potensielle bruksområder i kimære antigen reseptor (CAR) T-cellen terapi 17-19. Til sammenligning HPCS har en intakt genom og er lett reprogrammable. Selv om bare 0,01 til 0,1% celler i perifer sirkulasjon er HPCS, kan disse cellene bli utvidet ex vivo i erytroide medium som favoriserer spredning av erythrOID stamceller 14.

I vår forrige undersøkelse, brukte vi den faktoren BCL-XL i tillegg til de Yamanaka faktorer (OCT4, SOX2, MYC og KLF4), noe som resulterte i en 10x økning i PB omprogrammering effektivitet 20. BCL-XL, også kjent som BCL2L1, er en potent hemmer av celledød, ved å inhibere aktivering av kaspaser 21,22. Men, kan BCL-XL også spille en viktig rolle i å opprettholde pluripotency 21,22. Nylig har vi ytterligere optimalisert vårt EV omprogrammering system ved separat å uttrykke MYC og KLF4 med to vektorer, noe som fører til en tilnærmet 100 ganger økning i effektivitet omprogrammering 23. Ved hjelp av denne metoden, omprogrammering effektivitet, definert ved koloni-nummer delt av startcellenummer ved transfeksjon, er 0,2 til 0,5% fra friske donorer. Som følger, beskriver vi den detaljerte eksperimentelle prosedyren for å generere integrering fritt iPSCs fra PB.

Protocol

Alle de menneskelige PB prøver ble innhentet fra anonyme voksne donorer uten identifikasjon informasjon fra Tianjin Blood Center med godkjenning av den lokale forskningsetisk komité. 1. Endo-free Plasmid Forberedelse Bruk en kommersiell Plasmid Rensing Maxi Kit for å trekke episomale vektorer fra E. coli i henhold til produsentens protokoll. For det avsluttende trinn, til erstatning TE-buffer med endotoksin-fri sterilt vann oppløse den DNA-pelleten. Mål-DNA…

Representative Results

Ved hjelp av denne protokollen, kan vi skaffe hundrevis av kolonier fra 1 x 10 5 nucleofected PB MNCs (figur 1A og 1B). Den omprogrammering effektivitet er ca 0,2 til 0,5% og koloniene uttrykker pluripotency markører (Tall 1C og 1D). iPSCs generert ved hjelp av den beskrevne protokollen er integrering fritt og har evnen til å danne teratom komponere de 3 bakterie lag (Tall 1E og 1F)….

Discussion

Anskaffelse av blodprøver fra friske donorer eller pasienter er praktisk og ikke-invasiv, noe som gjør det til et attraktivt celle kilde for grunnforskning og klinisk celleterapi. Her har vi beskrevet en protokoll for svært effektiv generasjon av integrasjonsfritt iPSCs fra perifere blodprøver. Dette reproduserbar og rimelig tilnærming bør gagne IPSC feltet.

Vi har rapportert at det er to viktige faktorer ansvarlig for svært effektiv PB omprogrammering 30. En er ekvimolar e…

Declarações

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

This work was supported by the Ministry of Science and Technology of China (2015CB964902, 2013CB966902 and 2012CB966601), the National Natural Science Foundation of China (81500148, 81570164 and 81421002), the Loma Linda University School of Medicine GCAT grant (2015), and Telemedicine and Advanced Technology Research Center (W81XWH-08-1-0697).

Materials

Hematopoietic Stem Cell Expansion Medium Sigma S0192 Store at 4 °C
Human stem cell factor (SCF) Peprotech 300-07 Store at -20 or -80°C
Interleukin-3 (IL-3) Peprotech AF-200-03 Store at -20 or -80°C
Eryrthropoietin (EPO) Peprotech 100-64 Store at -20 or -80°C
Insulin growth factor-1 (IGF-1) Peprotech 100-11 Store at -20 or -80°C
Dexamethasone Sigma D4902 Store at -20 or -80°C
1-thioglycerol (MTG) Sigma M6145 Store at -20 or -80°C
DMEM/F12 medium Gibco 112660-012 Store at 4 °C
L-glutamine (100x) Gibco 25030-081 Store at -20 °C
Penicillin/Streptomycin (100x) Gibco 15140-122 Store at -20 °C
Non-essential amino acids solution (100x) Gibco 11140-050 Store at 4 °C
Fibroblast growth factor 2 (FGF2) Peprotech 100-18B Store at -20 or -80°C
ITS (100x) Gibco 41400-045 Store at 4 °C
Ascorbic acid Sigma 49752 Store at -20 °C
DMEM (high glucose) medium Thermo SH30243.01B Store at 4 °C
FBS Hyclone SV30087.01 Store at -40 °C
Ficoll GE Healthcare, SIGMA 17-5442-02 Store at RT
Trehalose  Sigma T9531 Store at 4 °C
DMSO Sigma D2650 Store at RT, protect from light
Endofree Plasmid Maxi Kit(10) Qiagen 12362 Store at RT
IMDM Gibco 21056-023 Store at 4 °C
Human CD34+ Cell Nucleofection Kit Lonza VPA-1003 Store at RT, nucleofection buffer and supplement buffer should be stored at 4 °C
Sodium butyrate Sigma B5887 Store at -20 or -80°C
ROCK inhibitor Y27632 STEMGENT 04-0012-10 Store at -20 °C
Essential 8 basal medium (E8) Gibco A15169-01 Store at 4 °C, the supplement should be stored at -20 or -80°C
Matrigel BD 354277 Store at -20 or -80°C
2x EasyTaq PCR SuperMix(+dye) TransGen Biotech AS111 Store at -20 °C
Cell detachment solution STEMGENT 01-0006 Store at -20 °C, Accutase as a cell detachment solution to obtain a single cell suspension
DAPI Sigma D9542-1MG Store at 4 °C or -20 °C
Anti-nanog-AF488 BD 560791 Store at 4 °C, primary antibody used for Immunofluorescence, dilute 1/100 when use
Anti-OCT4 abcam ab19857 Store at 4 °C, primary antibody used for Immunofluorescence, dilute 1/100 when use
AF488 donkey anti-mouse IgG Invitrogen A21202 Store at 4 °C, secondary antibody used for Immunofluorescence,  dilute 1/500 when use
PE anti-human TRA-1-60-R Antibody Biolegend 330610 Store at 4 °C, antibody used for flow cytometry
eFluor 570-conjugated anti-SSEA4 eBioscience 41-8843 Store at 4 °C, antibody used for flow cytometry
Isotype antibody eBioscience 11-4011 Store at 4 °C, antibody used for flow cytometry
Alkaline Phosphatase Detection Kit SiDanSai 1102-100 Store at 4 °C
Genomic DNA Extraction Kit TIANGEN DP304-02 Store at RT
Trypan Blue solution Sigma T8154 Store at RT
Flow cytometry cell analyzer BD LSRII for flow cytometry analysis
Spinning disk confocal microscope (SDC) PerkinElmer UltraVIEW VOX for confocal imaging
Nucleofection device Lonza Nucleofector 2b for the nucleofection of PB MNC
ImageQuant LAS-4010 GE take photo of AP staining in bulk

Referências

  1. Takahashi, K., Yamanaka, S. Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic and adult fibroblast cultures by defined factors. Cell. 126, 663-676 (2006).
  2. Takahashi, K., et al. Induction of pluripotent stem cells from adult human fibroblasts by defined factors. Cell. 131, 861-872 (2007).
  3. Trounson, A., McDonald, C. Stem Cell Therapies in Clinical Trials: Progress and Challenges. Cell Stem Cell. 17, 11-22 (2015).
  4. Hayes, M., Zavazava, N. Strategies to generate induced pluripotent stem cells. Methods Mol Biol. 1029, 77-92 (2013).
  5. Zhang, X. B. Cellular reprogramming of human peripheral blood cells. Genomics Proteomics Bioinformatics. 11, 264-274 (2013).
  6. Schlaeger, T. M., et al. A comparison of non-integrating reprogramming methods. Nat Biotechnol. 33, 58-63 (2015).
  7. Okita, K., et al. An efficient nonviral method to generate integration-free human-induced pluripotent stem cells from cord blood and peripheral blood cells. Stem Cells. 31, 458-466 (2013).
  8. Carey, B. W., et al. Reprogramming factor stoichiometry influences the epigenetic state and biological properties of induced pluripotent stem cells. Cell Stem Cell. 9, 588-598 (2011).
  9. Dorigo, O., et al. Development of a novel helper-dependent adenovirus-Epstein-Barr virus hybrid system for the stable transformation of mammalian cells. J Virol. 78, 6556-6566 (2004).
  10. Dowey, S. N., Huang, X., Chou, B. K., Ye, Z., Cheng, L. Generation of integration-free human induced pluripotent stem cells from postnatal blood mononuclear cells by plasmid vector expression. Nat Protoc. 7, 2013-2021 (2012).
  11. Harms, P. W., et al. Next generation sequencing of Cytokeratin 20-negative Merkel cell carcinoma reveals ultraviolet-signature mutations and recurrent TP53 and RB1 inactivation. Mod Pathol. 29, 240-248 (2016).
  12. Abyzov, A., et al. Somatic copy number mosaicism in human skin revealed by induced pluripotent stem cells. Nature. 492, 438-442 (2012).
  13. Martincorena, I., et al. Tumor evolution. High burden and pervasive positive selection of somatic mutations in normal human skin. Science. 348, 880-886 (2015).
  14. Su, R. J., Neises, A., Zhang, X. B. Generation of iPS Cells from Human Peripheral Blood Mononuclear Cells Using Episomal Vectors. Methods Mol Biol. 1357, 57-69 (2016).
  15. Seki, T., et al. Generation of induced pluripotent stem cells from human terminally differentiated circulating T cells. Cell Stem Cell. 7, 11-14 (2010).
  16. Loh, Y. H., et al. Reprogramming of T cells from human peripheral blood. Cell Stem Cell. 7, 15-19 (2010).
  17. Kishino, Y., Seki, T., Yuasa, S., Fujita, J., Fukuda, K. Generation of Induced Pluripotent Stem Cells from Human Peripheral T Cells Using Sendai Virus in Feeder-free Conditions. J Vis Exp. , (2015).
  18. Seki, T., Yuasa, S., Fukuda, K. Generation of induced pluripotent stem cells from a small amount of human peripheral blood using a combination of activated T cells and Sendai virus. Nat Protoc. 7, 718-728 (2012).
  19. Gill, S., June, C. H. Going viral: chimeric antigen receptor T-cell therapy for hematological malignancies. Immunological reviews. 263, 68-89 (2015).
  20. Su, R. J., et al. Efficient generation of integration-free ips cells from human adult peripheral blood using BCL-XL together with Yamanaka factors. PLoS One. 8, e64496 (2013).
  21. Li, Y., et al. The p53-PUMA axis suppresses iPSC generation. Nat Commun. 4, 2174 (2013).
  22. Hardwick, J. M., Youle, R. J. SnapShot: BCL-2 proteins. Cell. 138, 404 (2009).
  23. Wen, W., et al. Enhanced Generation of Integration-free iPSCs from Human Adult Peripheral Blood Mononuclear Cells with an Optimal Combination of Episomal Vectors. Stem Cell Reports. 6, 873-884 (2016).
  24. Zhang, X. B., et al. Trehalose ameliorates the cryopreservation of cord blood in a preclinical system and increases the recovery of CFUs, long-term culture-initiating cells, and nonobese diabetic-SCID repopulating cells. Transfusion. 43, 265-272 (2003).
  25. Watanabe, K., et al. A ROCK inhibitor permits survival of dissociated human embryonic stem cells. Nat Biotechnol. 25, 681-686 (2007).
  26. Basu, S., Campbell, H. M., Dittel, B. N., Ray, A. Purification of specific cell population by fluorescence activated cell sorting (FACS). J Vis Exp. , (2010).
  27. Castiel, A., et al. Cell death associated with abnormal mitosis observed by confocal imaging in live cancer cells. J Vis Exp. , e50568 (2013).
  28. Peterson, S. E., et al. Teratoma generation in the testis capsule. J Vis Exp. , e3177 (2011).
  29. Ritner, C., Bernstein, H. S. Fate mapping of human embryonic stem cells by teratoma formation. J Vis Exp. , (2010).
  30. Wen, W., et al. Enhanced Generation of Integration-free iPSCs from Human Adult Peripheral Blood Mononuclear Cells with an Optimal Combination of Episomal Vectors. Stem Cell Reports. , (2016).
  31. Lo, C. A., et al. Quantification of Protein Levels in Single Living Cells. Cell Rep. 13, 2634-2644 (2015).
  32. Liu, S. P., et al. An improved method for generating integration-free human induced pluripotent stem cells. Zhongguo Shi Yan Xue Ye Xue Za Zhi. 22, 580-587 (2014).
  33. Luni, C., et al. High-efficiency cellular reprogramming with microfluidics. Nat Methods. 13, 446-452 (2016).
  34. Chou, B. K., et al. A facile method to establish human induced pluripotent stem cells from adult blood cells under feeder-free and xeno-free culture conditions: a clinically compliant approach. Stem Cells Transl Med. 4, 320-332 (2015).
  35. Nakagawa, M., et al. A novel efficient feeder-free culture system for the derivation of human induced pluripotent stem cells. Sci Rep. 4, 3594 (2014).
  36. Howden, S. E., et al. Simultaneous Reprogramming and Gene Correction of Patient Fibroblasts. Stem Cell Reports. 5, 1109-1118 (2015).
  37. Meng, X., et al. Rapid and efficient reprogramming of human fetal and adult blood CD34+ cells into mesenchymal stem cells with a single factor. Cell research. 23, 658-672 (2013).
  38. Liao, W., et al. Direct Conversion of Cord Blood CD34+ Cells Into Neural Stem Cells by OCT4. Stem cells translational medicine. 4, 755-763 (2015).
check_url/pt/55091?article_type=t

Play Video

Citar este artigo
Wen, W., Zhang, J., Chen, W., Arakaki, C., Li, X., Baylink, D., Botimer, G. D., Xu, J., Yuan, W., Cheng, T., Zhang, X. Generation of Integration-free Induced Pluripotent Stem Cells from Human Peripheral Blood Mononuclear Cells Using Episomal Vectors. J. Vis. Exp. (119), e55091, doi:10.3791/55091 (2017).

View Video