섬 분석: 드로소필라 로코모터 동작을 평가하는 고처리량 방법
Published: April 30, 2023
Abstract
출처: Eidhof, I., 외. 드로소필라 섬 분석에서 운동 운동의 높은 처리량 분석. J. 비스 익스펙. (2017).
이 비디오는 드로소필라 운동을 연구하는 데 사용되는 행동 방법인 섬 분석법을 설명합니다. 샘플 프로토콜에는 반자동 이미지 분석과 호환되는 분석용 설정이 포함되어 있습니다.
Protocol
이 프로토콜은 Drosophila 섬 분석, J. Vis. Exp. (2017)에서 로코모터 행동의 높은 처리량 분석 에서 발췌. 1. 섬 분석 상자 의 건설 폴리 메틸 메타크릴레이트(PMMA)와 같은 견고한 소재로 만든 트레이를 준비하여물층(즉, 목욕)을 포함합니다. 재질이 흰색이 아닌지 확인합니다.참고: 40 x 35 x 2.5 cm3의 치수는 권장됩니다…
Representative Results
그림 1: 플로차트는 섬 분석의 요구 사항, 실험 절차 및 분석을 요약합니다. (A)섬 분석 장비. (B)섬 분석에 대한 실험 적 설정. (C)섬 분석. (D)”드로소필라 섬 분석” 매크로와 섬 분석 데이터의 처리. “Drosophila 섬 분석” 매크로는 3 개의 하위 매크로로 구성됩니다 …
Materials
| 25 x 95 mm Drosophila vials | Flystuff | 32-116SB | – |
| Logitech C525 HD Webcam | Logitech | – | Any webcam with USB connection is suitable. |
| Stand to hold webcam | – | – | – |
| Lamp | – | – | 12 V LED lights are appropriate |
| Pounding pad | – | – | Any mouse pad works |
| Island Assay box | – | – | Dimensions 40x35x2.5 cm. Hole 20×30 cm. Transparent. |
| Island Assay bath | – | – | Dimensions 42x38x25 cm. Non white. |
| Island/platform | – | – | Dimensions 42x38x25 cm. Uniform white. |
| Soap | – | – | Standard dishwashing detergent is suitable. |
| Computer | – | – | Scripts run both on Windows and Mac |
| Image-recording software: HandiAvi® | AZcendant® | – | HandyAvi is only compatible with Windows and has been described throughout the manuscript. It can be downloaded from: http://www.azcendant.com/DownloadHandyAvi.html (version 5.0) |
| Image-recording software: WebcamCapture | – | – | Fiji/ImageJ plugin that can be used on Mac alternative to HandyAvi for image-recordings and can be downloaded from: https://imagej.nih.gov/ij/plugins/webcam-capture/ When using this method, the user has to use the same folder setup and image-recording settings indicated in this manuscript, with the exception that for each experimental replicate, the captured image stack should be exported as Stack.tiff to the corresponding experimental replicate folder. Upon running the "Drosophila Island Assay" macro on this data, no text should be present in the "First frame identifier" setting. |
Citar este artigo
Island Assay: A High-Throughput Method to Evaluate Drosophila Locomotor Behavior. J. Vis. Exp. (Pending Publication), e20103, doi: (2023).