2.9:

Нековалентные взаимодействия в биомолекулах

JoVE Core
Biologia Molecular
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Core Biologia Molecular
Noncovalent Attractions in Biomolecules

33,632 Views

02:35 min

November 23, 2020

Нековалентное притяжение – это ассоциации внутри и между молекулами, которые влияют на форму и структурную стабильность комплексов. Эти взаимодействия отличаются от ковалентных связей тем, что они не связаны с разделением электронов.

Четыре типа нековалентных взаимодействий это водородные связи, силы ван-дер-Ваальса, ионные связи и гидрофобные взаимодействия.

Водородная связь возникает в результате электростатического притяжения атома водорода, ковалентно связанного с сильно электроотрицательным атомом, например кислородом, азотом или фтором, другим электроотрицательным атомом. Атом водорода развивает частичный положительный заряд, поскольку электроотрицательный атом, с которым он связан, притягивает к себе электронное облако. В результате происходит слабое взаимодействие между зарядом δ+ водорода и зарядом δ на соседнем электроотрицательном атоме. Этот тип взаимодействия регулярно образуется между молекулами воды. Независимые водородные связи легко разрываются, однако в воде и органических полимерах они встречаются в большом количестве, создавая совместно значительную силу.

Второй тип взаимодействия, называемый ван-дер-Ваальсовым, обусловлен временным притяжением между областями, богатыми электронами, и электрон-бедными областями двух или более атомов (или молекул), которые находятся рядом друг с другом. Эти взаимодействия могут способствовать созданию трехмерных структур белков, необходимых для их функционирования.

Другим типом взаимодействия является ионная связь, которая возникает между противоположно заряженными ионами. В биологических системах ионные взаимодействия, возникающие из-за разноименно заряженных ионов, также могут помочь стабилизировать структуру биомолекул. Ионы металлов, например, магния, взаимодействуют с отрицательно заряженными биомолекулами, такими как ДНК. Ион магния связывается с отрицательными фосфатными группами, нейтрализуя заряд и помогая упаковать длинный полимер ДНК в соленоидные или тороидные структуры.

И наконец, гидрофобный эффект представляет собой нековалентное взаимодействие, при котором гидрофобные молекулы объединяются, чтобы минимизировать контакт с водой в водной среде. Как следствие, гидрофобные области полипептида оказываются скрытыми внутри структуры во время сворачивания белка.