Synthesizing Amino Acids Modified with Reactive Carbonyls in Silico to Assess Structural Effects Using Molecular Dynamics Simulations

Rafael Pineda-Alem&#225;n; Camila Cabarcas-Herrera; Antistio Alviz-Amador; Humberto P&#233;rez-Gonzalez; Erika Rodr&#237;guez-Cavallo; Dar&#237;o M&#233;ndez-Cuadro

doi:10.3791/66605

In Silico Structural Analysis of Protein Carbonylation by Lipid Derivatives

April 26, 2024

סינתזה של חומצות אמינו שהותאמו עם קרבונילים תגובתיים בסיליקו להערכת השפעות מבניות באמצעות סימולציות דינמיקה מולקולרית

01:55 min

•

Rafael Pineda-Alemán, Camila Cabarcas-Herrera, Antistio Alviz-Amador, Humberto Pérez-Gonzalez, Erika Rodríguez-Cavallo, Darío Méndez-Cuadro

¹Analytical Chemistry and Biomedicine Group, Exact and Natural Sciences Faculty,University of Cartagena, ²Analytical Chemistry and Biomedicine Group, Pharmaceutical Sciences Faculty,University of Cartagena, ³Pharmacology and Therapeutics Research Group,University of Cartagena

Summary

במאמר זה אנו מתארים פרוטוקול לאופטימיזציה ופרמטריזציה של שאריות חומצות אמינו שהשתנו עם מיני קרבוניל תגובתי, הניתנים להתאמה למערכות חלבון. שלבי הפרוטוקול כוללים תכנון ואופטימיזציה של מבנה, הקצאות מטען, בניית פרמטרים והכנת מערכות חלבונים.

In Silico Structural Analysis of Protein Carbonylation by Lipid Derivatives

סינתזה של חומצות אמינו שהותאמו עם קרבונילים תגובתיים בסיליקו להערכת השפעות מבניות באמצעות סימולציות דינמיקה מולקולרית

Summary

Article