ジャーナル
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Um procedimento de ChIP-Seq semiautônomo para estudos epigenéticos em larga escala
JoVE Journal
生物学
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JoVE Journal 生物学
A Semiautomated ChIP-Seq Procedure for Large-scale Epigenetic Studies

Um procedimento de ChIP-Seq semiautônomo para estudos epigenéticos em larga escala

DOI:

08:04 min

August 13, 2020

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  • 00:05Introduction
  • 00:26Chromatin Shearing
  • 01:28Automated Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-Seq)
  • 03:03Library Adaptor Transposase Integration
  • 03:49Tagmented DNA Fragment Purification
  • 04:46Purified Sample Amplification and Size-Selection
  • 05:44Results: Representative Semiautomated ChIP-Seq
  • 07:27Conclusion

概要

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Este artigo descreve um protocolo chip-seq semiautomado e microescalado de regiões de DNA associadas a uma modificação de histona específica (H3K27ac) usando uma plataforma de manipulador de líquidos ChIP, seguido de preparação da biblioteca usando tagmentação. O procedimento inclui avaliação de controle para fins de qualidade e quantidade e pode ser adotado para outras modificações de histona ou fatores de transcrição.

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