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Chromatin Isolierung von RNA-Reinigung (Chirp)
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生物学
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JoVE Journal 生物学
Chromatin Isolation by RNA Purification (ChIRP)
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Chromatin Isolierung von RNA-Reinigung (Chirp)

DOI:
10.3791/3912-v

•

11:09 min

•

March 25, 2012

•

, ,
1Howard Hughes Medical Institute and Program in Epithelial Biology,Stanford University School of Medicine

章

  • 00:05標題
  • 01:25Cross-linking Cells to Preserve RNA-Chromatin Interactions
  • 02:58Cell Lysis
  • 03:37Shearing DNA by Sonication
  • 05:13Chromatin Isolation by RNA Purification (ChIRP)
  • 08:43Results: Enrichment of Target Long Noncoding RNAs by ChIRP
  • 10:34Conclusion

概要

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Chirp ist eine neuartige und schnelle Technik, um genomische Bindungsstellen der langen nicht-kodierenden RNAs (lncRNAs) abzubilden. Die Methode nutzt die Spezifität der anti-sense-Oligonukleotide Fliesen um die Auszählung von lncRNA-gebundene genomische Stellen zu ermöglichen.

タグ

Chromatin Isolation By RNA PurificationChIRPLong Noncoding RNAsChromatin StatesDosage CompensationImprintingDevelopmental Gene ExpressionLncRNAsChromatin Modification ComplexesPolycomb Repressive Complex 2Histone H3 Lysine 27 TrimethylationH3K27me3Gene-specific FashionCis RegulationTrans RegulationDrosophila LncRNAs RoX1RoX2X Chromosome Binding SitesHuman LncRNA HOTAIRPRC2 OccupancyGenome-wide EffectsModular ScaffoldsTERC RNATelomerase ComplexH3K4 Demethylase ComplexRNA Occupancy At Chromatin

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