Островный анализ: метод высокой пропускной способности для оценки поведения дрозофилы Локомотива
Published: April 30, 2023
Abstract
Источник: Eidhof, I., et al. High-throughput Анализ поведения локомотива в анализе острова Дрозофила. J. Vis. Exp. (2017).
Это видео описывает остров анализа, поведенческий метод, используемый для изучения Drosophila передвижения. Протокол выборки имеет настройку для анализа, совместимую с полуавтоматическим анализом изображений.
Protocol
Этот протокол является выдержкой из Eidhof et al.,High-throughput Analysis of Locomotor Behavior in the Drosophila Island Assay, J. Vis. Exp. (2017). 1. Строительство острова Ассай Box Подготовьте лоток из прочного материала, такого как поли метилмахкрилат (PMMA), чтобы содержатьслой воды (т.е. ванну). ?…
Representative Results
Рисунок 1: Flowchart с изложением требований, экспериментальной процедуры и анализа острова анализа. (A)Остров анализа оборудования. (B)Экспериментальная установка для анализа острова. (C) Остров анализа. (D)<…
Materials
| 25 x 95 mm Drosophila vials | Flystuff | 32-116SB | – |
| Logitech C525 HD Webcam | Logitech | – | Any webcam with USB connection is suitable. |
| Stand to hold webcam | – | – | – |
| Lamp | – | – | 12 V LED lights are appropriate |
| Pounding pad | – | – | Any mouse pad works |
| Island Assay box | – | – | Dimensions 40x35x2.5 cm. Hole 20×30 cm. Transparent. |
| Island Assay bath | – | – | Dimensions 42x38x25 cm. Non white. |
| Island/platform | – | – | Dimensions 42x38x25 cm. Uniform white. |
| Soap | – | – | Standard dishwashing detergent is suitable. |
| Computer | – | – | Scripts run both on Windows and Mac |
| Image-recording software: HandiAvi® | AZcendant® | – | HandyAvi is only compatible with Windows and has been described throughout the manuscript. It can be downloaded from: http://www.azcendant.com/DownloadHandyAvi.html (version 5.0) |
| Image-recording software: WebcamCapture | – | – | Fiji/ImageJ plugin that can be used on Mac alternative to HandyAvi for image-recordings and can be downloaded from: https://imagej.nih.gov/ij/plugins/webcam-capture/ When using this method, the user has to use the same folder setup and image-recording settings indicated in this manuscript, with the exception that for each experimental replicate, the captured image stack should be exported as Stack.tiff to the corresponding experimental replicate folder. Upon running the "Drosophila Island Assay" macro on this data, no text should be present in the "First frame identifier" setting. |
