בקהילות אקולוגיות רבות המגוון וההרכב של המינים הם השתנות מתמדת. הפרעות אקולוגיות אירועים המשפיעים על תצורת של מערכת אקולוגית תורמים לשינויים אלה על ידי הוספה או הסרה של אורגניזמים או שינוי ברמת המשאבים הזמינים. גורמים פיסים טבעיים, כמו בצורת, עלולים לגרום להפרעות אקולוגיות.גורמים ביולוגיים, כמו מחלות, מפריעים גם למערכת אקולוגית. פעילות אנושית, כגון כריתת יערות, גורמת להפרעות הגדולות ביותר כיום. לעוצמת ההפרעה יש השפעה מכרעת על מערכת אקולוגית.לדוגמה, סערה בעצימות נמוכה עלולה לפגוע בכמה עצים. שיטפון בעוצמה גבוהה עלול לחסל צמחים ובעלי חיים רבים. ההיקף הגיאוגרפי של ההפרעה משפיע גם הוא על מערכת אקולוגית לדוגמה, בעוד עץ שנופל גורם רק לנזק מקומי, שריפה עלולה לגרום לנזק שמשתרע על פני מאות קילומטרים.הגורם העיקרי השלישי להשפעה האקולוגית של הפרעה היא תדירות ההפרעה. בעוד שריפה יחידה יכולה להצעיר יער על ידי קידום צמיחה מחודשת, המגוון הביולוגי ולחידוש חומרים מזינים באדמה, שריפות חוזרות יכולות להשפיע לרעה על המערכת האקולוגית, תוך צמצום זמן הצמחים מקומיים להתאושש ולהגביל את פוריות האדמה. הפרעות אקולוגיות יכולות להשפיע על מגוון המינים בקהילה.על פי השערת ההפרעה הבינונית, רמות מתונות של הפרעה מעודדות גיוון רב יותר מאשר רמות גבוהות או נמוכות. רמות גבוהות של הפרעה יכולות להקטין את המגוון על ידי חריגה בזמני הסובלנות וההחלמה של מינים הגדלים או מתפשתים באטיות, ומאפשרים למינים הגדלים מהר יותר כדי מלא את החסר. רמות נמוכות של הפרעה יכולות גם להפחית את המגוון על ידי מתן אפשרות למין התחרותי ביותר לגרום למונופול על משאבים, מה שמונע מינים פחות דומיננטיים מלהתבסס.בין אם ההשפעה שלהם נמוכה, בינונית או גבוהה, להפרעות אקולוגיות יש מגוון רחב של גורמים ותופעות המעצבים ללא הרף מערכות אקולוגיות ברחבי העולם.