Мы описываем методологию, основанную на диверсификации последовательностей, для оценки аминокислотных предпочтений мультиспецифических сайтов связывания в белок-белковых взаимодействиях (ИПП). В рамках этой стратегии тысячи потенциальных пептидных лигандов генерируются и экранируются in silico, тем самым преодолевая некоторые ограничения доступных экспериментальных методов.