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메타바코딩 분석을 통해 칠레의 유해한 조류 꽃을 모니터링하기 위한 표준화된 절차
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August 26, 2021
DOI:
1Office of Research and Academia-Government-Community Collaboration,Hiroshima University, 2Graduate School of Human and Environmental Studies,Kyoto University, 3Scientific and Biotechnological Bioresource Nucleus,Universidad de La Frontera, 4Centro de Estudios de Algas Nocivas,Instituto de Fomento Pesquero, 5Ciencias del Mar y Recursos Biologicos,Universidad de Antofagasta, 6Departamento de Ciencias Biológicas y Biodiversidad,Universidad de Los Lagos, 7Japan Fisheries Research and Education Agency,Fisheries Resources Institute
Summary
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이 프로토콜은 해수 샘플에서 유해한 조류 꽃과 관련 미생물군유전체를 모니터링하기 위해 16S rRNA 및 18S rRNA 유전자를 대상으로 메타바코딩 분석 단계를 소개합니다. 그것은 강력한 분자 기반 도구이지만 시각적으로 단계별로 여기에 설명되는 몇 가지 절차가 필요합니다.
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Yarimizu, K., Fujiyoshi, S., Kawai, M., Acuña, J. J., Rilling, J., Campos, M., Vilugrón, J., Cameron, H., Vergara, K., Gajardo, G., Espinoza-González, O., Guzmán, L., Nagai, S., Riquelme, C., Jorquera, M. A., Maruyama, F. A Standardized Procedure for Monitoring Harmful Algal Blooms in Chile by Metabarcoding Analysis. J. Vis. Exp. (174), e62967, doi:10.3791/62967 (2021).
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