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Cartographie à haute résolution des interactions protéine-ADN dans les neurones dérivés des cellules souches de souris à l’aide de l’immunoprécipitation-exonucléase chromatine (ChIP-Exo)
Capitoli
- 00:05Introduction
- 00:21Antibody Incubation with Beads
- 01:35Chromatin Immunoprecipitation (ChIP)
- 02:56Enzymatic Reactions on Beads
- 04:59Elution and Purification
- 05:43Library Preparation
- 06:50Results: ChIP-exo Produces High Mapping Resolution
- 08:04Conclusion
La détermination précise des emplacements liant les protéines dans l’ensemble du génome est importante pour comprendre la régulation des gènes. Ici nous décrivons une méthode génomique de cartographie qui traite l’ADN chromatin-immunoprécipité avec la digestion d’exonuclease (ChIP-exo) suivie du séquençage à haut débit. Cette méthode détecte les interactions protéine-ADN avec une résolution cartographique proche de la paire de base et un rapport signal-bruit élevé chez les neurones mammifères.
