Открытие CsgD нормативных целей в сальмонеллы Biofilm Использование хроматина иммунопреципатации и высокой пропускной способности секвенирования (ChIP-seq)
Открытие CsgD нормативных целей в сальмонеллы Biofilm Использование хроматина иммунопреципатации и высокой пропускной способности секвенирования (ChIP-seq)
Хроматин иммунопрецитификации в сочетании с следующего поколения секвенирования (ChIP-seq) является метод, используемый для установления взаимодействия между транскрипционными факторами и геномных последовательностей они контролируют. Этот протокол излагаются методы для выполнения CHIP-seq с бактериальными биопленками, используя Salmonella enterica serovar Typhimurium бактериальной биопленки в качестве примера.
Palmer, M. B., Wang, Y., White, A. P. Discovering CsgD Regulatory Targets in Salmonella Biofilm Using Chromatin Immunoprecipitation and High-Throughput Sequencing (ChIP-seq). J. Vis. Exp. (155), e60736, doi:10.3791/60736 (2020).