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Volume di segmentazione e analisi dei materiali biologici utilizzando SuRVoS (Super regione Volume segmentazione) Workbench
JoVE Journal
Biologia
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JoVE Journal Biologia
Volume Segmentation and Analysis of Biological Materials Using SuRVoS (Super-region Volume Segmentation) Workbench

Volume di segmentazione e analisi dei materiali biologici utilizzando SuRVoS (Super regione Volume segmentazione) Workbench

DOI:

11:38 min

August 23, 2017

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Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 00:53Preparing the Workplace, Data Representation, and Generating Appropriate Super-regions
  • 03:19Introduction to Annotation
  • 04:12Segmentation Using Model Training
  • 05:41Segmentation Using Super-regions
  • 06:42Classifiction and Analysis of Data Objects Based on Inherent Characteristics
  • 09:00Results: Model Training, Super-region Segmentation, and Label Splitting Using the SuRVoS Workbench
  • 10:55Conclusion

Summary

Traduzione automatica

La segmentazione di dati tridimensionali da molte tecniche di imaging è un serio ostacolo nell'analisi dei sistemi biologici complessi. Qui, descriviamo l'uso di SuRVoS Workbench per semi-automaticamente i dati volumetrici del segmento a varie scale di lunghezza utilizzando i set di dati di esempio da cryo-elettrone tomografia, tomografia a raggi x molle cryo e tecniche di tomografia a raggi x di fase contrasto.

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