В этой статье представлены подробные протоколы нанесения проникающей черепно-мозговой травмы (PTBI) взрослой дрозофиле и изучения результирующего нейрогенеза.
Молекулярные и клеточные механизмы, лежащие в основе нейрогенеза в ответ на болезнь или травму, не совсем понятны. Тем не менее, понимание этих механизмов имеет решающее значение для разработки нейронной регенеративной терапии. Drosophila melanogaster является ведущей моделью для исследований развития нейронов, но исторически не использовалась для исследования регенерации мозга взрослых. Это в первую очередь связано с тем, что взрослый мозг проявляет очень низкую митотическую активность. Тем не менее, проникающая черепно-мозговая травма (PTBI) в центральный мозг взрослой дрозофилы вызывает генерацию новых нейронов и новой глии. Мощные генетические инструменты, доступные у дрозофилы , в сочетании с простым, но строгим протоколом травмы, описанным здесь, теперь делают мозг взрослой дрозофилы надежной моделью для исследований нейронной регенерации. Здесь приведены подробные инструкции для (1) проникающих повреждений центрального мозга взрослого человека и (2) рассечения, иммуногистохимии и визуализации после травмы. Эти протоколы дают высоковоспроизводимые результаты и облегчат дополнительные исследования для препарирования механизмов, лежащих в основе нейронной регенерации.
Повреждение мозга и нервной системы является основной причиной смерти и инвалидности во всем мире. Примерно 1,5 миллиона американцев страдают черепно-мозговыми травмами (ЧМТ) каждый год1, в то время как, по оценкам, 6 миллионов человек только в Соединенных Штатах страдают от нейродегенеративных заболеваний, таких как болезнь Паркинсона и Альцгеймера2. Как заболевание, так и повреждение головного мозга могут вызвать нервную дегенерацию, приводящую к сенсорным, когнитивным и двигательным дефектам3. Разработка терапевтических стратегий восстановления человеческого мозга была затруднена из-за сложной физиологии мозга. Модельные организмы, такие как Drosophila melanogaster, обеспечивают простую систему для идентификации фундаментальных механизмов, лежащих в основе нейродегенерации и потенциальных терапевтических целей4.
Плодовая муха Drosophila melanogaster уже более века является мощным модельным организмом, продвигая области генетики, биологии развития и неврологии5,6. Мозг дрозофилы содержит всего ~ 90 000 нейронов7, что в миллион раз меньше, чем средний человеческий мозг8, но они имеют много общего. Как человеческий, так и мышиный мозг используют нейротрансмиттеры ГАМК, глутамат, ацетилхолин и биогенные амины дофамин и серотонин9. Дрозофила и нейроны человека также функционируют аналогично, с общей синаптической архитектурой и аналогичными типами нейронных клеток10. Меньший размер мозга дрозофилы и наличие передовых методов генетики в сочетании с сохранением молекулярных, клеточных и физиологических механизмов между дрозофилой и млекопитающими позволяет исследователям дрозофилы задавать вопросы, на которые непрактично или трудно ответить в моделях млекопитающих.
Наше нынешнее понимание нейрогенеза взрослых у дрозофилы, как во время гомеостаза, так и после травмы, остается ограниченным. Больше известно о нейрогенезе при нормальном развитии. Например, нейроны и глия создаются во время развития из клеток-предшественников, называемых нейробластами10,11. По крайней мере, три различных типа нейробластов были выделены в центральном мозге. Нейробласты линии I и II типа выходят из клеточного цикла через ~20-30 ч после образования пупариума12. Напротив, нейробласты грибного тела являются последними, кто прекращает деление клеток и делает это через Жнец-зависимый апоптоз ~ 85-90 ч после образования пупариума13. После эклозии мозг взрослой дрозофилы имеет несколько делящихся клеток (~ 1 клетка / мозг), преимущественно glia14. Взрослые зрительные доли обладают медленно циклическими нейробластами, способными к нейрогенезу15, в то время как взрослый центральный мозг не имеет известных нейробластов. Дефицит нейронных предшественников и ограниченная пролиферация клеток сильно напоминают ситуацию в мозге взрослых млекопитающих, подчеркивая потенциальную актуальность механизмов взрослого нейрогенеза у дрозофилы для человека.
Открытие низких уровней взрослого нейрогенеза в зрительных долях взрослой дрозофилы после травмы15 привело к гипотезе о том, что центральный мозг взрослой дрозофилы также может быть способен к взрослому нейрогенезу16. Этот протокол описывает создание строгой, воспроизводимой модели центральной черепно-мозговой травмы у взрослых дрозофил , которая может быть использована для исследования нейрогенеза в центральном мозге взрослого человека. Учитывая сходство между архитектурой и функцией мозга человека и дрозофилы , эти открытия могут привести к выявлению критических целей для терапевтического нейрогенеза в поврежденном и больном человеческом мозге.
Хотя проникающие повреждения мозга взрослых дрозофил были описаны ранее15,17,18, эти травмы были сосредоточены на зрительных долях, а не на центральном мозге. Кроме того, подробные инструкции о том, как проводить травмы, до сих пор отсутствуют. Этот протокол описывает модель проникающего повреждения центрального мозга взрослой дрозофилы, которая воспроизводит статистически значимые доказательства нейрогенеза взрослых после PTBI.
Воспроизводимость этого протокола PTBI частично обусловлена телом гриба как целевой областью повреждения. Тело гриба большое, состоящее из ~2200 нейронов со сложными дендрритными и аксонными беседками в больших и сильно стереотипных массивах18. Клеточные тела нейронов грибного тела лежат вблизи поверхности мозга и могут быть визуализированы через головную кутикулу с использованием экспрессии зеленого флуоресцентного белка (GFP) (рисунок 1C). Предшественники грибного тела являются последними нервными стволовыми клетками, подвергшимися апоптозу во время развития13,12,19. Таким образом, многие нейроны грибного тела довольно молоды на момент эклозии. Это привело к гипотезе о том, что грибное тело может иметь больший митотический потенциал, чем другие области мозга16. Кроме того, грибное тело имеет решающее значение для обучения и памяти18. Это позволяет задаться вопросом, приводит ли нейрогенез, вызванный PTBI, к функциональному восстановлению.
Другие факторы, которые способствуют воспроизводимости результатов, включают использование скрещенных мух с последовательными генотипами, выполнение скрещиваний в одном и том же направлении каждый раз, точный контроль температур выращивания и старения и анализ самцов и самок отдельно. Использование мух F1 из ауткросса снижает вероятность гомозиготного анализа мозга на предмет спонтанных мутаций. Стандартный крест y[1] w[1]; UAS-mCD8-GFP;; OK107-GAL4 взрослых самок к y[1] w[1] взрослым самцам мух приводит к F1 потомству генотипа y[1] w[1]; UAS-mCD8-GFP/+;; OK107-GAL4/+. OK107-GAL4 экспрессируется во всех внутренних нейронах тела гриба и управляет экспрессией мембранно-связанного репортера UAS-mCD8-GFP, позволяя визуализировать грибные тела и их проекции. Для перма-близнецовых крестов кресты должны постоянно оставаться при 17 °C, чтобы система отслеживания линий была отключена. Это гарантирует, что во время развития не будут помечены делящиеся клетки и что будут помечены только взрослые нейроны и глия. С этой целью летное отделение также может поддерживаться при температуре 17 °C. Хотя первоначальное описание системы perma-twin15 рекомендовало взращивать мух при 18 °C, это может привести к значительной фоновой маркировке.
Для согласованности также рекомендуется держать контроль неповрежденных мух на площадке CO2 , когда один выполняет PTBI. Это гарантирует, что оба набора мух имеют одинаковую анестезирующую экспозицию. Кроме того, желательно для воспроизводимости полностью проникнуть в голову. Тем не менее, необходимо соблюдать осторожность, чтобы не согнуть кончик штифта против колодки, что сделает его непригодным для будущих травм. Для опытных практиков существует небольшой непреднамеренный вред для мух PTBI. Тем не менее, слишком сильное давление на грудную клетку, чтобы стабилизировать муху во время травмы, может быть смертельным. Одним из способов оценки степени непреднамеренной травмы является количественная оценка смертности мух PTBI через 24 часа после травмы. Для односторонне травмированных мух это может быть 50% и выше для начинающих. Поэтому, чтобы гарантировать, что наблюдаемые результаты связаны с PTBI, а не с непреднамеренной травмой, рекомендуется, чтобы новички практиковали введение PTBI на ~ 20 мух ежедневно в течение нескольких недель и не анализировали полученный мозг до тех пор, пока 24-часовая смертность не будет последовательно <10%.
Для количественной оценки количества пролиферации, стимулируемой центральным ПТБИ головного мозга, можно использовать как иммуноокрашивание антифосфогистона H3 (PH3), так и включение 5-этинил-2′-дезоксиуридина (EdU). Anti-PH3 маркирует клетки до и на протяжении всей метафазы, ограничивая обнаружение только частью активно делящихся клеток. Таким образом, окрашивание анти-PH3 обеспечивает лишь частичное проблеск пролиферации. EdU является аналогом тимидина, который может быть включен во вновь синтезированную ДНК. Кормя мух EdU до и после травмы, можно получить более полную картину клеток, которые либо делятся, либо разделились после травмы. Тот факт, что любые клетки, которые делятся, постоянно маркируются, полезен как для идентификации медленно циклических клеток, так и для анализа выживаемости клеток после первоначальной пролиферации. По неясным причинам, но, возможно, из-за ограниченной проницаемости гематоэнцефалического барьера, маркировка EdU неэффективна и недостаточно сообщает о пролиферации клеток во взрослом мозге. Об этом свидетельствует сходное количество клеток PH3+ и EdU+ как в контрольном, так и в экспериментальном мозге через 24 ч после PTBI и наблюдение, что только подмножество новых клеток в клонах перма-близнецов включает EdU16. Для максимальной маркировки важно предварительно кормить мух EdU, потому что травмированные мухи не возобновляют кормление в течение нескольких часов после PTBI. Кормление оценивали путем добавления пищевого красителя в раствор EdU и мониторинга количества красителя в кишечнике через брюшную кутикулу16.
Следует отметить, что, хотя мы предоставили протокол вскрытия мозга на этапе 4, могут быть использованы альтернативные методы. Некоторые из них доступны в ранее опубликованных протоколах20,21,22. Drosophila melanogaster предлагает недорогую модель с мощными генетическими и молекулярными инструментами, которые могут быть использованы для изучения механизмов, лежащих в основе регенерации нескольких тканей, включая кишечник и компоненты нервной системы. Здесь изложена новая и воспроизводимая модель травмы, которая может быть использована для изучения реакции на черепно-мозговую травму. Данные, полученные с использованием этих протоколов, подтверждают идею о том, что центральный мозг взрослой дрозофилы сохраняет пролиферативную способность, генерируя новые нейроны в ответ на травму. Эти наблюдения требуют дальнейшего изучения как степени взрослого нейрогенеза, так и лежащих в его основе молекулярных механизмов. Как только компоненты, участвующие в нейронной регенерации, будут идентифицированы в этой системе, мы сможем преобразовать наши знания о нейрогенезе взрослых дрозофилы к людям.
The authors have nothing to disclose.
Мы благодарны Стейси Римкус и Бекки Катценбергер за техническую помощь и Эдуардо Морено за совместное использование акций перма-близнецов. Мы хотели бы поблагодарить Барри Ганецки и Дэвида Вассармана за оживленные дискуссии, которые, несомненно, улучшили науку, а также Кента Мока, Кайлу Герру и Бейли Шпигельберга за их вклад в лабораторию. Антитела FasII были разработаны Кори Гудманом и получены из Банка исследований развития hybridoma, созданного NICHD NIH и поддерживаемого в Университете Айовы, Департамент биологии, Айова-Сити, IA 52242. Большинство штаммов дрозофилы , используемых в этом исследовании, были получены из Bloomington Drosophila Stock Center (BDSC; NIH P40OD018537). Эта работа была поддержана NIH T32 GM007133 (KLC); NIH NS090190 (GBF); NIH NS102698 (GBF); Высшая школа Висконсинского университета (GBF); и Институт лидерства женщин в науке и технике UW-Madison (WISELI) (GBF).
#11 disposable scalpels | Santa Cruz Biotechnology | sc-395923 | used for separating Drosophila heads from trunks prior to brain dissection |
150 mm diameter black Sylgard dishes | Dow | 1696157 | made in the laboratory with reagents from Dow; used for brain dissection |
18 mm coverslips | any | for mounting brains on microscope slides | |
4',6-Diamidino-2-Phenylindole, Dihydrochloride (DAPI) | ThermoFisher | D1306 | for immunohistochemistry |
70% Ethanol | made from 95% ethanol sourced variously | ||
anti-mouse Cy5 | Jackson ImmunoResearch | 715-175-151 | for immunohistochemistry |
anti-rabbit 568 | ThermoFisher | A11036 | for immunohistochemistry |
bovine serum albumin (BSA) | SIgma Aldrich | A7030 | for immunohistochemisty |
Clear nail polish | any | for sealing coverslips | |
Click-It EdU labeling kit | InVitrogen | C10640 | to detect newly synthesized DNA |
CO2 bubbler | Genesee Scientific | 59-181 | for anesthesia |
CO2 pad | Genesee Scientific | 59-114 | for anesthesia |
CO2 regulator and supply | any | for anesthesia | |
Confocal microscope | any | for imaging fixed, stained and mounted brains | |
cotton plugs | Genesee Scientific | 51-101 | for EdU labeling |
Drosophila vials | Genesee Scientific | 32-109 | for EdU labeling |
Fix buffer (Pipes, EGTA, Magnesium; PEM) | components sourced from various companies | for fixing adult brains; 100 mM piperazine-N,N’-bis(2-ethanesulfonic acid) [PIPES], 1 mM EGTA, 1 mM MgSO4, pH 7.0 | |
Formaldehyde | Sigma Aldrich | 252549 | for fixing adult brains, added to PEM |
Grade 3 round Whatman filters, 23 mm round | Tisch Scientific | 1003-323 | for EdU labeling |
Microfuge tubes | any | for fixing and staining reactions and for storing Minutien pins | |
Microscope slides | any | for mounting brains | |
Minutien pins | Fine Science Tools | 26002-10 | for brain injury; 12.5 μm diameter tip and 100 μm diameter rod |
mouse anti-Fasiclin II | Developmental Studies Hybridoma Bank | 1D4-s | for immunohistochemistry |
NIGHTSEA stereo microscope fluorescence adaptor | Electron Microscopy Sciences | SFA-GR | fluorescence setup for dissecting microscope |
P20, P200 and P1000 pipettors and tips | any | for measuring solutions | |
phosphate buffered saliine (PBS) | components sourced from various companies | for dissecting brains and making immunohistochemistry blocking and washing solutions; 100 mM of K2HPO4, 140 mM of NaCl, pH 7.0 | |
phosphate buffered saline with 0.1% Triton X-100 (PT) | components sourced from various companies | for washing dissected brains | |
phosphate buffered saline with 0.1% Triton X-100 + 2% bovine serum albumin (PBT) | components sourced from various companies | blocking solution for immunohistochemistry and for diluting antibodies | |
rabbit anti-PH3 | Santa Cruz Biotechnology, Inc | sc-8656-R | for immunohistochemistry |
Reinforcement labels | Avery | 5721 | to maintain space between the microscope slide and the coverslip |
Size 0 paintbrushes | any | to manipulate and stabilize adult Drosophila during injury | |
Triton X-100 | Sigma Aldrich | 93443 | |
Two pair of #5 watchmakers forceps | Fine Science Tools | 11255-20 | used to hold the Minutien pins and for brain dissections |
Vectashield | Vector Laboratories | H-1000 | mounting medium for microscope slides |