Este artigo descreve o procedimento para a formação e visualização de um biofilme bacteriano cresceu dentro de uma câmara de corrediça de 8 poços
A natureza crônica de muitas doenças é atribuído à formação de biofilme bacteriano que são recalcitrantes ao tratamento com antibióticos tradicionais. Biofilmes são comunidades associadas bactérias ligado a uma superfície e envolto em uma matriz. O papel da matriz extracelular é multifacetado, incluindo a facilitação de aquisição de nutrientes, e oferece proteção significativa contra estresses ambientais (por exemplo, respostas imune do hospedeiro). Em um esforço para adquirir uma melhor compreensão de como as bactérias dentro de um biofilme responder às pressões ambientais que temos utilizado um protocolo em que nós visualizamos biofilme bacteriano que se formaram em um slide de câmara de 8 poços. Os biofilmes foram coradas com o BacLight Live / Morto mancha e examinadas com um microscópio confocal para caracterizar o tamanho relativo do biofilme, e estrutura sob diferentes condições de incubação. Z-stack imagens foram coletados por meio de microscopia confocal e analisados por COMSTAT. Este protocolo pode ser usado para ajudar a elucidar o mecanismo e cinética por que formam biofilmes, bem como identificar os componentes que são importantes para a estrutura do biofilme e estabilidade.
Compreensão do mecanismo pelo qual os biofilmes formulário, bem como caracterizar seus componentes de matriz, é uma área de intenso interesse. Este protocolo pode ser usado para ajudar a identificar proteínas ou outros componentes que contribuem para a integridade estrutural do biofilme, bem como ajudar a identificar e alvo proteínas que podem se prestam a uma aplicação terapêutica.
Os tempos de incubação e diluições no protocolo acima descrito foram estabelecidas para a formação de biofilme ideal por Haemophilus influenzae não tipáveis (NTHi). Algum trabalho preliminar pode ser necessária para otimizar estes passos para outras espécies de bactérias (ou seja, diluição inicial e tempo de incubação necessário para atingir meados de log fase de crescimento). A diluição 1:2.500 para a semeadura inicial das câmaras foi estabelecido para assegurar que um biofilme robusta iria desenvolver na câmara de slides como induzido por este organismo e dentro do período de incubação afirmou, sem o biofilme overgrowing da câmara e / ou esgotar nutrientes disponíveis . Assim, a diluição inicial e tempos de incubação, ou podem precisar de ser ajustado para outras espécies de bactérias.
The authors have nothing to disclose.
O trabalho foi financiado pela NIDCD / NIH R01DC003915 a LO Bakaletz.
Material Name | Tipo | Company | Catalogue Number | Comment |
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Chocolate II agar | Fisher | B21267X | ||
8-well chamber slides | Fisher | 12-656-18 | ||
BacLight Live/Dead bacterial viability kit | Fisher | NC9439023 | ||
BHI | Fisher | 211059 | ||
Hemin | Sigma | H5533 | ||
β-NAD | Sigma | N7004 | ||
Permaslip mounting media | Fisher | NC9693613 |