Dit artikel beschrijft de procedure voor de vorming en visualisatie van een bacteriële biofilm gegroeid binnen een 8-well kamer slide
Het chronische karakter van veel ziekten wordt toegeschreven aan de vorming van bacteriële biofilms die recalcitrant de traditionele behandeling met antibiotica. Biofilms zijn community-geassocieerde bacteriën gehecht aan een oppervlak en ingekapseld in een matrix. De rol van de extracellulaire matrix is veelzijdig, waaronder het faciliteren van voedingsstoffen verwerving, en biedt aanzienlijke bescherming tegen milieu-invloeden (bijv. gastheer immuunreacties). In een poging om een beter inzicht te verwerven over hoe de bacteriën in een biofilm te reageren op milieu-invloeden hebben we gebruik gemaakt van een protocol waarin we visualiseren bacteriële biofilms, die zijn gevormd in een 8-well kamer schuiven. De biofilms werden gekleurd met de BacLight Live / Dead vlek en onderzocht met behulp van een confocale microscoop om de relatieve biofilm omvang en structuur karakteriseren onder verschillende incubatie-omstandigheden. Z-stack beelden werden verzameld via confocale microscopie en geanalyseerd door COMSTAT. Dit protocol kan worden gebruikt om opheldering van het mechanisme en de kinetiek waardoor biofilms vormen, evenals de bestanddelen die belangrijk zijn voor biofilm structuur en stabiliteit.
Het begrijpen van het mechanisme waarmee biofilms vormen, evenals kenmerkend hun matrix componenten, is een gebied van intense belangstelling. Dit protocol kan worden gebruikt om te helpen identificeren eiwitten of andere bestanddelen die bijdragen aan de structurele integriteit van de biofilm, maar ook helpen bij het identificeren en doeleiwitten die zich kunnen lenen voor een therapeutische toepassing.
De incubatie tijden en verdunningen in de hierboven beschreven protocol zijn vastgesteld voor een optimale biofilmvorming door nontypeable Haemophilus influenzae (NTHI). Wat voorbereidend werk kan nodig zijn om deze stappen voor andere bacteriesoorten te optimaliseren (dat wil zeggen de eerste verdunning en incubatie tijd die nodig is om mid-log-fase groei te realiseren). De 1:2500 verdunning voor de eerste zaaien van de kamers werd opgericht om ervoor te zorgen dat een robuuste biofilm zich zou ontwikkelen in de kamer dia's veroorzaakt door dit organisme en binnen de incubatietijden verklaard, zonder dat de biofilm begroeiing de kamer en / of vermoeiende beschikbare voedingsstoffen . Bijgevolg kan de initiële verdunning en of incubatie tijden moeten worden aangepast voor andere bacteriële soorten.
The authors have nothing to disclose.
Het werk werd gefinancierd door het NIDCD, toont / NIH R01DC003915 naar LO Bakaletz.
Material Name | Tipo | Company | Catalogue Number | Comment |
---|---|---|---|---|
Chocolate II agar | Fisher | B21267X | ||
8-well chamber slides | Fisher | 12-656-18 | ||
BacLight Live/Dead bacterial viability kit | Fisher | NC9439023 | ||
BHI | Fisher | 211059 | ||
Hemin | Sigma | H5533 | ||
β-NAD | Sigma | N7004 | ||
Permaslip mounting media | Fisher | NC9693613 |