A Comprehensive Approach to Studying the Promoter Interactome in Scarce Cells

April 21, 2023

희소한 세포 집단에서 프로모터 중심의 시공간 게놈 구조를 연구하기 위한 통합 워크플로우An Integrated Workflow to Study the promoter-centic spatio-temporal genome architecture in Scarce Cell Populations

희소 세포의 용해 및 소화

희소 세포 DNA의 결찰 및 탈가교

희소 세포 DNA의 초음파 처리 및 비오틴 풀다운

희소 세포 DNA의 dATP-tailing, 어댑터 결찰 및 PCR 증폭

Library Capture, Biotin Pull-Down, and PCR Amplification Using Scarce Cell DNA Library

Llorenç Rovirosa*¹, Laureano Tomás-Daza*^1,2, Blanca Urmeneta, Alfonso Valencia³, Biola M. Javierre⁴

¹Josep Carreras Leukaemia Research Institute, ²Barcelona Supercomputing Center, ³Catalan Institution for Research and Advanced Studies (ICREA), ⁴Institute for Health Science Research Germans Trias i Pujol

Summary

유전자 발현은 유전자 프로모터와 원위 조절 요소의 상호작용에 의해 조절된다. 여기서는 낮은 입력 Capture Hi-C(liCHi-C)를 통해 이전에는 측정할 수 없었던 희귀 세포 유형에서 이러한 상호 작용을 식별할 수 있는 방법을 설명합니다.

Article