John M. Coffin Department of Molecular Biology and Microbiology Tuffts University Biography Publications Institution JoVE Articles John M. Coffin has not added a biography. If you are John M. Coffin and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications ピグテールマカクにおける異種指向性マウス白血病ウイルス関連ウイルスの制限付きのレプリケーション Journal of Virology. Jan, 2012 | Pubmed ID: 22238316 二XMRV親プロウイルスの特性、マッピング、およびディストリビューション Journal of Virology. Jan, 2012 | Pubmed ID: 22031947 内因性マウス白血病ウイルス:ヒトDNAサンプルから検出されたXMRVと関連した配列との関係 Advances in Virology. 2011 | Pubmed ID: 22312358 短期コースは、単回投与ネビラピン後コンビビルは減りますが、女性のネビラピン耐性の出現がなくなるわけではありません Antiviral Therapy. Nov, 2011 | Pubmed ID: 22293443 2つ以上のTva800分子の結合はASLVエントリが必要です Retrovirology. 2011 | Pubmed ID: 22099981 同定、キャラクタリゼーション、およびヒト内在性レトロウイルスのHERV-K(HML-2)グループの比較ゲノム分布 Retrovirology. 2011 | Pubmed ID: 22067224 慢性疲労症候群の患者の血液中のXMRV / MLVのを確認するための障害:マルチ実験的研究 Science (New York, N.Y.). Nov, 2011 | Pubmed ID: 21940862 CD4の大半+ HIV-1感染者の末梢血からT細胞は、オンリーワンのHIV DNA分子を含む Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jul, 2011 | Pubmed ID: 21690402 レトロウイルスXMRVの組換え起源 Science (New York, N.Y.). Jul, 2011 | Pubmed ID: 21628392 以前は単回投与ネビラピンに曝露した女性のネビラピンを含む抗ウイルス療法の失敗の低周波HIV-1変異体の役割 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. May, 2011 | Pubmed ID: 21576473 効果的な再結合率と慢性感染症におけるHIVの平均選択係数の推定値 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2011 | Pubmed ID: 21436045 残留HIV-1ウイルス血症の激化抗レトロウイルス治療を受けている患者からの血漿から回収したクローンの配列は、安静時のCD4の循環から回収したウイルスRNA + T細胞の複製と同じです。 Journal of Virology. May, 2011 | Pubmed ID: 21367910 ブラッド·異種指向マウス白血病ウイルス関連ウイルス科学研究ワーキンググループ:ミッション、進歩、および計画 Transfusion. Mar, 2011 | Pubmed ID: 21366602 サル免疫不全ウイルスエンコーディングHIV-1逆転写酵素の遺伝的多様性は、抗レトロウイルス療法にもかかわらず、マカクに固執 Journal of Virology. Jan, 2011 | Pubmed ID: 21084490 マウスのDNAとヒトDNAサンプルの汚染はXMRVのようなシーケンスの誤検出を招くことがある Retrovirology. 2010 | Pubmed ID: 21171973 XMRVのためにテストされたヒト組織におけるマウスのDNAコンタミ Retrovirology. 2010 | Pubmed ID: 21171966 HIV-1は、HIV感染の自然のコントロール患者では複製と進化を続けて Journal of Virology. Dec, 2010 | Pubmed ID: 20926564 抗レトロウイルス療法でHIV感染患者における低レベルの残留ウイルス血症におけるラルテグラビル激化の影響:無作為化比較試験 PLoS Medicine. 2010 | Pubmed ID: 20711481 ヒト免疫不全ウイルス1型組換えex Vivoでのパターンは、レプリケーション中にIntersubtype組換え体の選択を精製することになり、遠隔部位の共適応のために証拠を提供する Journal of Virology. Aug, 2010 | Pubmed ID: 20504919 HIV-1集団の分析のための単一ゲノム配列への標準的なPCR /クローニングの比較 Journal of Virological Methods. Sep, 2010 | Pubmed ID: 20451557 活性化されたH-rasおよびc-Mycの両方を発現するプラスミドDNAの直接接種によるマウスにおける誘発腫瘍 International Journal of Biological Sciences. 2010 | Pubmed ID: 20376206 HIV-1の核輸入経路の柔軟な使用 Cell Host & Microbe. Mar, 2010 | Pubmed ID: 20227665 抗レトロウイルス薬激化とバルプロ酸の不足は残留HIV-1ウイルス血症または安静時のCD4 +細胞の感染に影響を持続 PloS One. 2010 | Pubmed ID: 20186346 まれ組換えの存在下でのマルチサイトの適応 Theoretical Population Biology. May, 2010 | Pubmed ID: 20149814 低周波非ヌクレオシド系逆転写酵素阻害剤耐性変異体は、治療経験のある患者にエファビレンツを含むレジメンの失敗への貢献 The Journal of Infectious Diseases. Mar, 2010 | Pubmed ID: 20102272 哺乳動物ゲノムにおける内因性の非レトロウイルスのRNAウイルスの要素 Nature. Jan, 2010 | Pubmed ID: 20054395 プライマー設計のために患者固有のHIVコンセンサス配列を用いたアレル特異的PCRの最適化 Journal of Virological Methods. Mar, 2010 | Pubmed ID: 19948190 抗HIV療法中に感染マカクにおけるRT-SHIVの集団力学 Retrovirology. 2009 | Pubmed ID: 19889213 ウイルス学。古くからある病気のための新しいウイルス? Science (New York, N.Y.). Oct, 2009 | Pubmed ID: 19815721 HIV-1エリートコントローラおよび免疫学的パラメーターとの関係の持続的な低レベルのウイルス血症 The Journal of Infectious Diseases. Sep, 2009 | Pubmed ID: 19656066 単一ビリオンの分析によって明らかにされたHIV-1ゲノムRNAのパッケージングおよびヘテロ接合体形成の高効率 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Aug, 2009 | Pubmed ID: 19628694 APOBEC3G媒介G-へのHIV-1の進化と薬剤耐性の変異の可能性の役割 PLoS Pathogens. Apr, 2009 | Pubmed ID: 19343218 最終的な48週間の臨床的およびウイルス学的転帰:メンテナンス抗レトロウイルス療法として単独でアタザナビル、リトナビルにレジメンの簡略化 The Journal of Infectious Diseases. Mar, 2009 | Pubmed ID: 19191590 CD8 + T細胞の溶解性顆粒の読み込みは、免疫コントロールに関連付けられているHIV-感染細胞の除去が必要です Immunity. Dec, 2008 | Pubmed ID: 19062316 千カットによる減衰 The New England Journal of Medicine. Nov, 2008 | Pubmed ID: 19020330 ホストベースのレトロウイルスの軍拡競争:予算のトリミング Cell Host & Microbe. Sep, 2008 | Pubmed ID: 18779045 宿主ゲノム機能に関するレトロウイルスの影響 Annual Review of Genetics. 2008 | Pubmed ID: 18694346 HIV-1逆転写酵素の接続サブドメインの変異は、テンプレートRNAの分解を削減し、AZTの切除を強化 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Aug, 2008 | Pubmed ID: 18667707 激化抗ウイルス療法がなければバルプロ酸は、安静時のCD4永続HIV感染+ T細胞上の限られた影響を与えている AIDS (London, England). Jun, 2008 | Pubmed ID: 18525258 マウス白血病ウイルスによるマウスAPOBEC3と人間APOBEC3Gの相互作用 Journal of Virology. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18448535 低レベルのウイルス血症が抑制抗レトロウイルス治療を受けている患者では少なくとも7年間持続する Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18332425 HIV-1プロテアーゼと逆転写酵素の薬剤抵抗性のサイトで頻繁に多型 AIDS (London, England). Feb, 2008 | Pubmed ID: 18301062 生体内のDNAの発癌性:活性H-rasおよびc-Mycのための発現プラスミドで腫瘍誘導 Biologicals : Journal of the International Association of Biological Standardization. May, 2008 | Pubmed ID: 18218323 内因性マウス白血病ウイルス間の遺伝的多様性の中のAPOBEC3の役割 PLoS Genetics. Oct, 2007 | Pubmed ID: 17967065 HIV-特異的CD4 + T細胞によるCTLA-4のアップレギュレーションは、病気の進行と相関すると可逆免疫機能障害を定義します。 Nature Immunology. Nov, 2007 | Pubmed ID: 17906628 抗レトロウイルス療法のためのニホンザルモデルにおけるヒト免疫不全ウイルス1型薬剤耐性のウイルス血症と進化の抑制 Journal of Virology. Nov, 2007 | Pubmed ID: 17855539 ARTはPretherapyウイルス血症により予測される安定したセットポイントに血漿中HIV-1 RNAを抑制 PLoS Pathogens. Apr, 2007 | Pubmed ID: 17411338 HIV-1逆転写酵素の増加3'-アジド-3'-デオキシチミジン抵抗の接続ドメインの変異 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jan, 2007 | Pubmed ID: 17179211 低周波でヒト免疫不全ウイルス1型の薬剤耐性変異を検出する方法の盲検、多施設比較 Journal of Clinical Microbiology. Jul, 2006 | Pubmed ID: 16825395 非ヌクレオシド系逆転写酵素阻害剤耐性の非ヌクレオシド療法の開始と停止患者におけるHIV-1の選択と持続性 AIDS (London, England). Mar, 2006 | Pubmed ID: 16514300 レトロウイルスの広い宿主範囲の進化は非常に細胞変性変異による細胞死を媒介に導く Journal of Virology. Jan, 2006 | Pubmed ID: 16378958 霊長類ゲノムにおける異所性組換え事象の指標として、人間の内在性レトロウイルスの要素 Genetics. Nov, 2005 | Pubmed ID: 16157677 Proof-of-concept試験:生体内における潜在的HIV-1感染の枯渇 Lancet. Aug 13-19, 2005 | Pubmed ID: 16099290 Hortulanus内因性マウス白血病ウイルスの特性、新規サブグループの感染マウス白血病ウイルスをエンコード内在性プロウイルス Journal of Virology. Jul, 2005 | Pubmed ID: 15956577 HIV-1を取り巻く対称基本設定、トリ肉腫/白血病ウイルス、およびマウス白血病ウイルスの統合サイト Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2005 | Pubmed ID: 15802467 HIV-1複製のヌクレオシドアナログ媒介廃止するためのメカニズム:RNase H活性とヌクレオチド除去のバランス Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Feb, 2005 | Pubmed ID: 15684061 レトロウイルスDNA-統合サイトの選択と宿主細胞の転写との関係 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Feb, 2005 | Pubmed ID: 15659548 治療経験のある患者では、複数のリンクされたヒト免疫不全ウイルス1型薬剤耐性変異が標準的な遺伝子型解析による見逃している Journal of Clinical Microbiology. Jan, 2005 | Pubmed ID: 15635002 ピグテール·マカクにウイルス抵抗性を研究するサル免疫不全ウイルス、ヒト免疫不全ウイルスのin Vitro評価(HIV)のキメラを発現HIVタイプ1逆転写酵素 Journal of Virology. Dec, 2004 | Pubmed ID: 15564466 レトロウイルスの進化:私たちのDNAの化石 Proceedings of the American Philosophical Society. Sep, 2004 | Pubmed ID: 15551500 HIVゲノムのマイナス鎖の脱アミノ化のためのAPOBEC3Gアカウントの一本鎖特異性 Nature Structural & Molecular Biology. May, 2004 | Pubmed ID: 15098018 ヒト内在性レトロウイルスKのソロ-LTR形成とた挿入多型:人間とウイルスの進化のための含意 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Feb, 2004 | Pubmed ID: 14757818 ダイレクトおよび細胞媒介性経路を介してランダムでHIV-1感染と二重感染 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jan, 2004 | Pubmed ID: 14707263 ヒト免疫不全ウイルスタイプのシングルコピーの感度を持つ新しいリアルタイム逆転写が開始したPCRアッセイプラズマ中の1 RNA Journal of Clinical Microbiology. Oct, 2003 | Pubmed ID: 14532178 ウイルス学。変異破壊兵器 Science (New York, N.Y.). Aug, 2003 | Pubmed ID: 12920286 鳥レトロウイルス宿主域拡張のメカニズム Journal of Virology. Jun, 2003 | Pubmed ID: 12767991 無性生殖の進化の孤立波 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jan, 2003 | Pubmed ID: 12525686 進化の関連についての証拠:ヒトゲノムにおける新規内在性レトロウイルス関連の要素は、DNAトランスポゾンに似? Genomics. Nov, 2002 | Pubmed ID: 12408960 抗HIV薬の使用のための提案された代替:それは適切ですか? Drug Resistance Updates : Reviews and Commentaries in Antimicrobial and Anticancer Chemotherapy. Feb, 1999 | Pubmed ID: 11504471 標準的な臨床アッセイによる検出限界以下のウイルス量とHIV感染個体におけるHIV - 1 RNAを増幅して定量化 Helene Mens1, Mary Kearney1, Ann Wiegand1, Jonathan Spindler1, Frank Maldarelli1, John W. Mellors2, John M. Coffin3 1The virology Core at the HIV Drug Resistance Program, NCI-Frederick, 2Division of Infectious Diseases, University of Pittsburgh, 3Department of Molecular Biology and Microbiology, Tuffts University JoVE 2960 Immunologia e infezioni
標準的な臨床アッセイによる検出限界以下のウイルス量とHIV感染個体におけるHIV - 1 RNAを増幅して定量化 Helene Mens1, Mary Kearney1, Ann Wiegand1, Jonathan Spindler1, Frank Maldarelli1, John W. Mellors2, John M. Coffin3 1The virology Core at the HIV Drug Resistance Program, NCI-Frederick, 2Division of Infectious Diseases, University of Pittsburgh, 3Department of Molecular Biology and Microbiology, Tuffts University JoVE 2960 Immunologia e infezioni