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Perfil proteómico de EPS-Urine a través de la Digestión FASP y análisis independiente de datos
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Proteomic Profile of EPS-Urine through FASP Digestion and Data-Independent Analysis
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Perfil proteómico de EPS-Urine a través de la Digestión FASP y análisis independiente de datos

DOI:
10.3791/62512-v

•

14:48 min

•

May 08, 2021

•

, , , , , , ,
1Research Centre for Advanced Biochemistry and Molecular Biology, Department of Experimental and Clinical Medicine,Magna Graecia University of Catanzaro, 2Department of Health Science,Magna Graecia University of Catanzaro, 3Romolo Hospital, 4Department of Experimental and Clinical Medicine,Magna Graecia University of Catanzaro

Chapitres

  • 00:00Introduction
  • 00:55Protocol
  • 01:25Protocol: FASP Digestion
  • 05:29Protocol: SCX Purification
  • 08:08Protocol: Protein Quantifcation by External Standard
  • 09:23Protocol: NanoLC-MS/MS and DIA Analysis
  • 11:31Protocol: High-pH C18 Fractionation for Spectral Library
  • 13:09Protocol: Data Analysis
  • 13:35Expected Results
  • 13:53Conclusion

Summary

Traduction automatique

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Aquí, presentamos un protocolo de digestión en filtro optimizado con información detallada sobre lo siguiente: digestión de proteínas, purificación de péptidos y análisis de adquisición independiente de datos. Esta estrategia se aplica al análisis de muestras de secreciones prostáticas-orina expresadas y permite una alta cobertura de proteoma y un perfil sin etiquetas de bajo valor del proteoma urinario.

Tags

Proteomic ProfileEPS-urineFASP DigestionData-independent AnalysisMass SpectrometryBiomarker DiscoveryProstate CancerCentrifugationSample PreparationProtein AlkylationUrea BufferIodoacetamide

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