Die Kombination von DNA-Halo-Präparationen mit Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung ermöglicht eine hochauflösende Analyse genomischer Interaktionen mit dem Nukleoskelett. Das angehängte Genom führt zu hybridisierten Fluoreszenzsignalen, die sich in den verbleibenden extrahierten Kernen befinden, während sich das nicht angehängte Genom im Halo der DNA befindet, der die verbleibenden Kerne umgibt.