Journal
/
Environnement
/
Utveckling och testning av artspecifika kvantitativa PCR-analyser för dna-tillämpningar på miljö
Journal JoVE
Environnement
This content is Free Access.
Journal JoVE Environnement
Development and Testing of Species-specific Quantitative PCR Assays for Environmental DNA Applications
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Utveckling och testning av artspecifika kvantitativa PCR-analyser för dna-tillämpningar på miljö

DOI:
10.3791/61825-v

•

08:54 min

•

November 05, 2020

•

, , ,
1Columbia Environmental Research Center,U.S. Geological Survey

Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 01:18Generation of a Sequence Database of Mitochondrial DNA Sequences from Target and Non-target Species of Interest
  • 02:03Assay Design
  • 03:56Assay Screening and Optimization
  • 06:21Results: A. ligamentina qPCR Assay
  • 08:23Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Dna-analyser för miljön kräver rigorös design, testning, optimering och validering innan insamlingen av fältdata kan börja. Här presenterar vi ett protokoll för att ta användare genom varje steg för att utforma en artspecifik, sondbaserad qPCR-analys för detektion och kvantifiering av en målarts DNA från miljöprover.

Tags

Keywords: Environmental DNAEDNAQuantitative PCRQPCRSpecies-specific AssayAssay DesignSequence AlignmentNCBIGeneiousMUSCLEPrimer DesignProbe DesignContaminationConservationWildlife Management

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

check_url/fr/61825?article_type=v

Protokoll för Robust herbicidresistens Testning i olika ogräsarter
check_url/fr/61825?article_type=v

Framställning och testning av impedans-baserade fluid Biochips med RTgill-W1 celler för snabb utvärdering av dricksvatten Prover för toxicitet
check_url/fr/61825?article_type=v

Samtidig DNA-RNA-extraktion från kustsediment och kvantifiering av 16S rRNA gener och transkript av Real-time PCR
check_url/fr/61825?article_type=v

Användning av en filterpatron för filtrering av vattenprover och utvinning av miljö DNA
check_url/fr/61825?article_type=v

En genomströmningsExponerings system för att utvärdera suspenderat sediment Effekter på Vatten- liv
check_url/fr/61825?article_type=v

Utvärdera effekten av kemikalier i miljön på Honey Bee utveckling från individen till Colony nivå
check_url/fr/61825?article_type=v

Spridning av nanomaterial i vattenhaltigt medium: mot protokollet optimering
check_url/fr/61825?article_type=v

Beredning av DMMTAV och DMDTAV med DMAV för miljötillämpningar: syntes, rening och bekräftelse
check_url/fr/61825?article_type=v

Uppståndelsen av vilande Daphnia magna: protokoll och applikationer
check_url/fr/61825?article_type=v

Protokoll för akut och kronisk ekotoxicitet testning av den turkos Killifish Nothobranchius furzeri

Read Article