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Desarrollo y pruebas de ensayos cuantitativos de PCR específicos de especies para aplicaciones de ADN ambiental
Journal JoVE
Environnement
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Journal JoVE Environnement
Development and Testing of Species-specific Quantitative PCR Assays for Environmental DNA Applications
DOI:

08:54 min

November 05, 2020

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Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 01:18Generation of a Sequence Database of Mitochondrial DNA Sequences from Target and Non-target Species of Interest
  • 02:03Assay Design
  • 03:56Assay Screening and Optimization
  • 06:21Results: A. ligamentina qPCR Assay
  • 08:23Conclusion

Summary

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Los ensayos de ADN ambiental requieren un diseño riguroso, pruebas, optimización y validación antes de que pueda comenzar la recopilación de datos de campo. Aquí, presentamos un protocolo para llevar a los usuarios a través de cada paso del diseño de un ensayo qPCR específico de la especie, basado en sondas para la detección y cuantificación de un ADN de especies objetivo a partir de muestras ambientales.

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