L'imagerie spectrale est devenue une solution fiable pour l'identification et la séparation des signaux de fluorescence multiples dans un seul échantillon et peut facilement distinguer les signaux d'intérêt du fond ou de l'autofluorescence. L'imagerie hyperspectrale à balayage d'excitation améliore cette technique en diminuant le temps d'acquisition d'image nécessaire tout en augmentant simultanément le rapport signal-bruit.