Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu. Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Chapitres
- 00:04Titre
- 01:24Preparation of S or M Phase-arrested Cells
- 02:19Formaldehyde Cross-linking
- 04:49Immunoprecipitation
- 07:32Results: Capturing and Analyzing PKR-interacting RNAs During the Cell Cycle Using qRT-PCR
- 08:45Conclusion
Wij presenteren experimentele benaderingen voor studeren RNA-interactors van double-stranded RNA bindend proteïne kinase RNA-geactiveerd (PKR) tijdens de zoogdieren celcyclus met behulp van HeLa cellen. Deze methode maakt gebruik van formaldehyde dwarslijn RNA-PKR complexen en immunoprecipitation te verrijken van PKR-gebonden RNAs. Deze RNAs kunnen verder worden geanalyseerd door middel van high-throughput sequencing of qRT-PCR.
Tags
RNA InteractorsProtein Kinase RNA-ActivatedMammalian Cell CycleCrosslinkingFormaldehydeImmunoprecipitationNeurodegenerative DiseaseParkinson’s DiseaseAlzheimer’s DiseaseDouble-stranded RNARNA-binding ProteinsPost-transcriptional RegulationGene ExpressionCell Cycle ArrestHeLa CellsThymidineNocodazole
