Journal
/
Génétique
/
Formaldehyd-assisted isolering av reglerande element till åtgärd kromatin tillgänglighet i däggdjursceller
Journal JoVE
Génétique
This content is Free Access.
Journal JoVE Génétique
Formaldehyde-assisted Isolation of Regulatory Elements to Measure Chromatin Accessibility in Mammalian Cells
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Formaldehyd-assisted isolering av reglerande element till åtgärd kromatin tillgänglighet i däggdjursceller

DOI:
10.3791/57272-v

•

08:08 min

•

April 02, 2018

•

, , , ,
1Department of Oncohematology and Genetics. Institute of Biomedicine of Seville (IBiS),University Hospital Virgen del Rocío, 2Institute of Biochemistry, Medical Faculty, Friedrichstrasse 24, Member of the German Center for Lung Research,Justus-Liebig-University

Chapitres

  • 00:04Titre
  • 01:03Formaldehyde Crosslinking and Cell Harvesting
  • 02:18Cell Lysis and Chromatin Fragmentation
  • 03:25De-crosslinking of Control DNA
  • 04:04Phenol: Chloroform Purification of DNA
  • 06:44Results: Chromatin Accessibility Quantified
  • 07:29Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Plasticitet i nukleära arkitekturen styrs av dynamiska epigenetiska mekanismer, inklusive icke-kodande RNAs, DNA metylering, nukleosomens ompositionering och Histon sammansättning samt modifiering. Här beskriver vi en Formaldehyde-Assisted isolering av reglerande element (FAIRE) protokoll som möjliggör bestämning av kromatin tillgänglighet i en reproducerbar, Billigt och enkelt sätt.

Tags

Chromatin AccessibilityFormaldehyde-assisted IsolationRegulatory ElementsMammalian CellsDNA-protein Cross-linkingChromatin RemodelingFAIRESonicationChromatin Fragmentation

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

Sekventiell Salt extraktioner för analys av Bulk kromatin bindande egenskaper av kromatin ändra komplex

Urval-beroende och oberoende generering av CRISPR / Cas9-medierade genknockouts i däggdjursceller

Kromatinimmunutfällning (ChIP) i mus-T-celllinjer

Retroviral Scanning: Kartläggning av MLV-integrationswebbplatser för att definiera cellspecifika reglerande regioner

Kromatin Immunoprecipitation (ChIP) protokoll för låg-överflöd embryonala prover

Anpassning av hybridisering fånga av kromatin-associerade proteiner för proteomik för att däggdjursceller

En enkel, snabb och kvantitativa analysen till åtgärd reparation av DNA-protein antipyridinantikropp på plasmider transfekterade i däggdjursceller

CRISPR-medierad omorganiseringen av kromatin Loop struktur

Kromatin immunoprecipitation analys med hjälp av Micrococcal nukleaser i däggdjursceller

Utforska Sekvensutrymme för att identifiera bindnings platser för regulatoriska RNA-bindande proteiner

Read Article