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Mappatura delle interazioni RNA-RNA globalmente utilizzando Psoralen biotinilato
Journal JoVE
Génétique
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Journal JoVE Génétique
Mapping RNA-RNA Interactions Globally Using Biotinylated Psoralen
DOI:

11:32 min

May 24, 2017

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Chapitres

  • 00:05Titre
  • 01:12Treatment of HeLa Cells with Biotinylated Psoralen RNA Extraction, and Fragmentation
  • 02:25RNA Size Selection and Elution
  • 04:41Enrichment of RNA Crosslinking Regions
  • 05:57Proximity Ligation
  • 07:34Reverse Crosslinking of Biotinylated Psoralen, and Amplification of cDNA
  • 09:13The SPLASH Workflow and Representative Results
  • 10:50Conclusion

Summary

Traduction automatique

Qui, abbiamo dettagliato il metodo di equilibrio di P soralen crosslinked, L igated e S elected H ybrids (SPLASH), che consente mapping a livello genomico delle interazioni RNA-RNA intramolecolari e intermolecolari in vivo . SPLASH può essere applicato per studiare interagenti RNA di organismi compresi lieviti, batteri e umani.

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