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Cartographie des interactions ARN-ARN à l'échelle mondiale à l'aide de psoralène biotinylé
Journal JoVE
Génétique
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Journal JoVE Génétique
Mapping RNA-RNA Interactions Globally Using Biotinylated Psoralen
DOI:

11:32 min

May 24, 2017

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Chapitres

  • 00:05Titre
  • 01:12Treatment of HeLa Cells with Biotinylated Psoralen RNA Extraction, and Fragmentation
  • 02:25RNA Size Selection and Elution
  • 04:41Enrichment of RNA Crosslinking Regions
  • 05:57Proximity Ligation
  • 07:34Reverse Crosslinking of Biotinylated Psoralen, and Amplification of cDNA
  • 09:13The SPLASH Workflow and Representative Results
  • 10:50Conclusion

Summary

Traduction automatique

Ici, nous détaillons la méthode de l'équation de S de P soralen réticulé, L igated et S élués (SPLASH), ce qui permet une cartographie génomique des interactions intra-moléculaires et intermoleculaires d'ARN-ARN in vivo . SPLASH peut être appliqué pour étudier les interactions de l'ARN des organismes, y compris la levure, les bactéries et les humains.

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