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使用生物素化补骨脂素全球定位RNA-RNA相互作用
Journal JoVE
Génétique
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Mapping RNA-RNA Interactions Globally Using Biotinylated Psoralen
DOI:

11:32 min

May 24, 2017

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Chapitres

  • 00:05Titre
  • 01:12Treatment of HeLa Cells with Biotinylated Psoralen RNA Extraction, and Fragmentation
  • 02:25RNA Size Selection and Elution
  • 04:41Enrichment of RNA Crosslinking Regions
  • 05:57Proximity Ligation
  • 07:34Reverse Crosslinking of Biotinylated Psoralen, and Amplification of cDNA
  • 09:13The SPLASH Workflow and Representative Results
  • 10:50Conclusion

Summary

Traduction automatique

在这里,我们详细介绍了P soralen交联,Ligated和S选择的H ybrids(SPLASH)的S等位基因的方法,使得能够在体内对分子内和分子间RNA-RNA相互作用进行基因组范围的映射。 SPLASH可用于研究包括酵母,细菌和人在内的生物体的RNA相互作用。

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