Summary

A base di seta-collagene Engineered Modello 3D del tessuto neurale polarizzata

Published: October 23, 2015
doi:

Summary

Insight into the complex actions of the brain requires advanced research tools. Here we demonstrate a novel silk-collagen-based 3D engineered model of neural tissue resembling brain-like architecture. The model can be used to study neuronal network assembly, axonal guidance, cell-cell interactions and electrical activity.

Abstract

Despite huge efforts to decipher the anatomy, composition and function of the brain, it remains the least understood organ of the human body. To gain a deeper comprehension of the neural system scientists aim to simplistically reconstruct the tissue by assembling it in vitro from basic building blocks using a tissue engineering approach. Our group developed a tissue-engineered silk and collagen-based 3D brain-like model resembling the white and gray matter of the cortex. The model consists of silk porous sponge, which is pre-seeded with rat brain-derived neurons, immersed in soft collagen matrix. Polarized neuronal outgrowth and network formation is observed with separate axonal and cell body localization. This compartmental architecture allows for the unique development of niches mimicking native neural tissue, thus enabling research on neuronal network assembly, axonal guidance, cell-cell and cell-matrix interactions and electrical functions.

Introduction

Il sistema nervoso centrale (CNS) può essere influenzata da una varietà di disturbi che coinvolgono vascolare, strutturale, funzionale, infettiva o degenerativa. Si stima che 6,8 milioni di persone muoiono ogni anno a causa di disturbi neurologici, che rappresenta un crescente onere socioeconomico in tutto il mondo 1. Tuttavia, solo alcuni dei disturbi sono trattamenti disponibili. Pertanto, vi è una necessità critica per strategie terapeutiche innovative per i pazienti affetti da disturbi neurologici. Purtroppo, molte terapie CNS-mirate falliscono durante gli studi clinici, in parte a causa dell'utilizzo di modelli inadeguati di ricerca pre-clinica, che non consentono la valutazione degli impatti acuti e cronici con fisiologicamente rilevanti letture funzionali.

Nonostante i significativi sforzi di ricerca nel corso degli ultimi decenni, vi è una grande quantità sconosciuto circa la struttura e la funzione del sistema nervoso centrale. Al fine di acquisire maggiori conoscenze, i modelli animali sono spesso noied al modellare stati patologici, come i traumi cerebrali (TBI) o demenza, soprattutto in studi pre-clinici. Tuttavia, gli animali differiscono significativamente dagli esseri umani sia in anatomia del sistema nervoso centrale, nonché in funzione, l'espressione genica e metabolismo 2-4. D'altra parte, culture 2D in vitro sono il metodo comune per indagare la biologia cellulare e sono abitualmente utilizzati per la scoperta di farmaci. Tuttavia, le colture cellulari 2D mancano della complessità e rilevanza fisiologica rispetto al cervello umano 5-7. Mentre non vi è alcun sostituto per il basso costo e la semplicità di studi su colture cellulari in 2D o la complessità fornito da modelli animali, l'ingegneria dei tessuti 3D potrebbe generare modelli di ricerca migliorati per colmare il divario che esiste tra il 2D in vitro e in vivo approcci. Ingegneria dei tessuti 3D fornisce più fisiologicamente rilevanti condizioni sperimentali ottenuti da interazioni cellula-cellula 3D e segnali extracellulari forniti dalle impalcature biomateriale. Despite le prove significative dietro il valore delle culture in 3D, ci sono attualmente solo pochi modelli di tessuto 3D del sistema nervoso centrale, come staminali derivati ​​dalle cellule culture organoide 8-10, neurospheroids 11 e dispersi culture idrogel 12,13. Modalità tecniche avanzate che includono multilayer litografia 14, e la stampa 3D 15 sono stati utilizzati per lo studio del polmone, del fegato e tessuto renale. Tuttavia, vi è la mancanza di modelli 3D SNC che permettono la crescita neuronale compartimentato, come mimando l'architettura corticale e biologia. Separato crescita dei neuriti da corpi cellulari neuronali è stato precedentemente dimostrato nelle culture 2D utilizzando microfabbricazione 16,17 permettendo lo studio di tracciato del tratto assoni, flusso di calcio, l'architettura di rete e attività. Questa idea ci ha ispirato a sviluppare un tessuto neurale polarizzata 3D in cui i corpi cellulari e tratti assonali sono situati in diversi comparti che mimano l'architettura a strati del cervello 18 </sup>. Il nostro approccio è basato sull'uso di design unico scaffold seta alloggiante alta densità di cellule in un volume confinato e permette conseguenza di rete assonale fitta in un gel di collagene. Qui mostriamo l'intera procedura di assemblaggio del tessuto cerebrale simile tra cui la fabbricazione patibolo e la cultura neuronale.

Protocol

Il protocollo di isolamento tessuto cerebrale è stato approvato dal Istituzionale Cura e Comitato uso degli animali Tufts University ed è conforme con il National Institutes of Health Guide per la cura e l'uso di animali da laboratorio (Institutional Animal Care and Use Committee B2011-45). 1. Silk Scaffold Preparazione Preparazione della soluzione da seta Bombyx mori bozzoli, come descritto in precedenza 19,20. Tagliare ogni bozzolo in 8 pezzi uguali con le forbici. Usare circa 11 bozzoli per 5 g di bozzoli frammentati. (15 min) Preparare 2 L di 0,02 M Na 2 CO 3 soluzione e portarla a bollore con un piatto caldo. (15 min) Pesare 5 g di bozzoli frammentate e lessateli in Na 2 CO 3 soluzione per 30 minuti. Mescolare la seta bollente ogni paio di minuti con una spatola. Questa fase, detta anche de-gommatura, purifica fibroina di seta da proteine ​​idrofili, sericins. (30 min) <li> Strizzare fibroina a mano e sciacquarlo con acqua distillata almeno tre volte per lavare qualsiasi sericina e prodotti chimici rimanente. (5 minuti) Posizionare la fibroina bagnato su una capsula di Petri e asciugare l'estratto fibroina nella cappa a flusso O / N. Il giorno dopo pesare la massa fibroina secca e posizionare il fibroina in un bicchiere di vetro. (15 min) Per sciogliere la fibroina in soluzione 9,3 M LiBr, calcolare il volume necessario (ml) di LiBr moltiplicando la massa della fibroina secca per 4. Versare lentamente soluzione LiBr sul fibroina di seta e immergere tutte le fibre di fibroina utilizzando una spatola. Coprire il becher per evitare l'evaporazione e posizionarlo a 60 ° C per 4 ore per consentire alle fibre di sciogliere. (15 min) Usando la siringa, raccogliere la soluzione fibroina dal bicchiere e caricarlo nei MWCO 3.500 cassette di dialisi. Eseguire la dialisi contro acqua distillata per 48 ore. Cambiare l'acqua ogni due ore. Utilizzando la siringa, raccogliere la soluzione da fibroinale cassette in 50 ml provette coniche e centrifughi due volte a 9.000 giri (~ 12,700 xg) a 4 ° C per 20 min. Versare il surnatante in una nuova provetta dopo ogni fase di centrifugazione e scartare il pellet. (40 min) Misurare la concentrazione della fibroina stimando il peso secco. Versare 1 ml di soluzione di seta in una barca pesare. Essiccare il campione in stufa a 60 ° C per 2 ore. Pesare il fibroina di seta secca e calcolare la concentrazione della soluzione di fibroina di seta moltiplicando il peso ottenuto per 100. La concentrazione previsto di soluzione seta è 6-9% (w / v). Regolare la concentrazione di seta al 6% (w / v) diluendo in acqua distillata. Fermata: La fibroina seta liquida può essere conservato a 4 ° C fino ad un mese in un contenitore chiuso. Preparazione di scaffold porosi di soluzione di seta. Setacciare la granulari NaCl per separare i granuli di dimensioni 500-600 micron, che verrà utilizzato nei passaggi successivi. Eliminare il granulos dimensioni di sotto di 500 micron e sopra 600 micron. (15 min) Versare 30 ml di soluzione di seta 6% nello stampo politetrafluoroetilene (PTFE) (Figura 1). Spargere delicatamente 60 g di NaCl setacciata sulla seta. Premere il contenitore per ottenere uno strato uniforme di sale. Incubare 48 ore a RT per polimerizzare la seta. Collocare lo stampo PTFE contenente scaffold in forno a 60 ° C per 1 ora per completare la polimerizzazione e far evaporare il liquido in eccesso. Posizionare il contenuto dello stampo PTFE in un bicchiere contenente 2 L di acqua distillata per 48 ore a percolare il sale. Cambiare l'acqua 2-3 volte al giorno. Rimuovere le impalcature spugna dagli stampi quando il sale è completamente colato fuori del punto finale:. Le spugne possono essere conservati immersi in acqua a 4 ° C in un contenitore chiuso per impedire scaffold disidratazione. Quando si è pronti, tagliare i ponteggi con diametro 5 mm biopsia. Pre-tagliare le impalcature per raggiungere circa 2 mm di altezza. PuNCH ​​il centro del ponteggio con il punzone di diametro biopsia 2 mm (Figura 2A). (1 ora) Autoclavare i ponteggi immersi in acqua per sterilizzarli (ciclo bagnato, 121 ° C, 20 min) del punto finale:. Le spugne possono essere conservati immersi in acqua a 4 ° C in un contenitore chiuso per impedire scaffold disidratazione. Prima della semina cellulare programmata, immergere i ponteggi in soluzione sterile 0,1 mg / ml di poli-D-lisina (PDL). Incubare per 1 ora a 37 ° C. Lavare i ponteggi 3x con tampone fosfato salino (PBS) per rimuovere PDL non vincolati. (30 min) 2. Isolamento di ratto neuroni corticali Sezionare cortecce da giorno embrionale 18 ratti (E18) Sprague-Dawley come precedentemente descritto da Pacifici e Peruzzi 27 dopo l'ottenimento del protocollo animale approvato. (2 ore) Incubare 10 cortecce in 5 ml di 0,25% tripsina con 0.3% DNasi I (da pancreas bovino) per 20 min a 37 ° C. Inattivare i tripsina aggiungendo uguale volume di 1 mg / ml di proteine ​​di soia. Triturare le cortecce con 10 ml pipetta Pasteur pipettando su e giù per 20 volte fino a quando viene generato una sospensione singola cellula. Sii gentile e evitare la formazione di bolle d'aria. (10 min) Centrifugare la sospensione cellulare a 127 xg per 5 min. Risospendere il pellet cellulare in 10 ml di terreno di coltura (Neurobasal medio, 1x B27 supplemento, 1x Glutamax, 1% di penicillina / streptomicina). Contare le cellule. La concentrazione cellulare è di circa 2×10 previsto 7 / ml. (20 min) 3. Costruire Montaggio e Cultura Ponteggio semina con le cellule. Spostare i ponteggi sterili e tutti gli utensili necessari all'interno di una cappa di coltura cellulare. Con pinza sterile posto i ponteggi in un piatto di coltura cellulare a 96 pozzetti attribuzione di un ponteggio per pozzetto. (10 min) Immergere i ponteggi in terreno di coltura cellulare per equilibrare loro prima di logge dei semiing. Incubare per 1 ora a 37 ° C. (10 min) Aspirare l'eccesso del mezzo dalle impalcature. Applicare 100 ml di sospensione cellulare / patibolo. (10 min) Incubare le cellule a 37 ° CO / N per permettere l'adesione delle cellule al ponteggio. La mattina seguente aspirare le cellule non iscritti e applicare 200 pl / pozzetto di terreno di coltura fresco. (10 min) Impalcatura embedding con matrice di collagene. (2 ore) Mettere 10x PBS, acqua, 1 N NaOH e coda di topo collagene sul ghiaccio. Preparare una soluzione di lavoro di collagene secondo le istruzioni del produttore. Mantenere in ghiaccio fino alle costruzioni cellulari-seeded sono pronti (fino a 1 ora). Rimuovere i costrutti di seta cellulari testa di serie dal termostato e aspirare l'eccesso di mezzo. Con pinza sterile trasferire i ponteggi nei pozzetti vuoti sulla piastra pozzo e immergono ogni impalcatura in 100 ml di 3 mg / ml soluzione di collagene. Posizionare la piastra di coltura tissutale indietroin incubatrice per 30 min per permettere la polimerizzazione del collagene. Applicare 100 ml di pre-riscaldato terreno di coltura cellulare / bene. Cultura i costrutti per uno settimana cambiando il mezzo ogni giorno sostituendo solo la metà del volume del mezzo. 4. Microscopia Analisi Vivo colorazione / morti (1 ora) Preparare soluzione stock di ioduro di propidio (PI) 1 mg / ml (1,5 mm) in acqua distillata. Preparare soluzione stock di diacetato fluoresceina (FDA) 2 mg / ml in acetone. Preparare la soluzione di lavoro contenente 10 micron e 0,15 micron PI FDA diluito in PBS. Pre-riscaldare la soluzione a 37 ° C in un bagno d'acqua. Lavare le cellule con PBS preriscaldata a rimuovere le esterasi siero. Aspirare il PBS. Applicare la soluzione preriscaldata lavorando sulle cellule per 2 minuti e lavare con PBS. Utilizzare microscopio epifluorescente all'immagine delle cellule (PI ex λ = 490 nm, em λ = 570 nm; FDA ex λ = 490 nm, em λ = 514 nm). La macchia rimane stabile nel 40 min. Colorazione prolungata può causare macchie aspecifica risultante da PI captazione da parte delle cellule e co-localizzazione di PI / FDA in cellule. Immunostaining Al punto di tempo desiderato della cultura fissare le cellule con 4% paraformaldeide (PFA) per 30 minuti a RT. A causa della tossicità dei fumi PFA la fase di fissaggio deve essere eseguito nella cappa. Lavare 3x ponteggi con PBS Fermata:. I costrutti PFA-fisse possono essere memorizzati in PBS a 4 ° C per diversi giorni prima di procedere con ulteriori passi. Incubare i ponteggi a 0,2% Triton, 0,25% di albumina sierica bovina (BSA) in PBS contenenti anticorpo primario O / N a 4 ° C. Il giorno seguente scartare la soluzione colorante e lavare i ponteggi 3 x 30 minuti con PBS per rimuovere l'anticorpo primario non legato. Incubare i campioni con anticorpo secondario diluito in 0,2% Triton, 0,25% BSA in PBS per 2ora a RT. Rimuovere la soluzione colorante e lavare i ponteggi 3 x 30 minuti con PBS per rimuovere l'anticorpo secondario non legato. Immagine i ponteggi utilizzando un microscopio confocale con obiettivo 20X prendendo 100 micron z-sezioni del campione con 1 micron passo. Per visualizzare le neuriti sottili la risoluzione dell'immagine dovrebbe essere di almeno 1.024 x 1.024 pixel. RNA, DNA e isolamento delle proteine Nota: RNA, DNA e l'isolamento delle proteine ​​viene eseguita utilizzando un commerciale DNA AllPrep / RNA / proteine ​​Mini Kit secondo le istruzioni del produttore. Con pinza sterile trasferire i ponteggi di piastra di coltura di una provetta sterile 2 ml. Mettere una impalcatura per provetta. Aggiungere 200 ml di tampone RLT a ciascuna provetta. Interrompere il costrutto frammentando con microscissors sterili. Per omogeneizzare il tessuto perturbato, trasferire il contenuto del tubo alla colonna di spin. Spin per 2 minuti a tutta velocità in una microcentrifuga.Il lisato viene omogeneizzata che passa attraverso la colonna di spin. Raccogliere il flusso attraverso ed utilizzare immediatamente per isolare l'RNA, DNA e proteine ​​seguendo il protocollo del produttore. Quantificare la resa degli acidi nucleici qualsiasi altro metodo compatibile (ad esempio, NanoDrop). Quantificare la resa proteica tramite BCA Protein Assay secondo le istruzioni del produttore. Misurare i risultati di test con lettore di micropiastre alla lunghezza d'onda 562 nm. Nota: La resa prevista di acidi nucleici e proteine ​​per costrutto in relazione alla densità cellulare è mostrato in Figura 4.

Representative Results

Solid spugne seta pretagliato alla forma di ciambella rappresentano un'idea unica e semplice da realizzare un'architettura compartmentalized simile tessuto neurale (Figura 2A). La struttura altamente porosa del ponteggio con la dimensione dei pori di circa 500 micron risultati in eccezionalmente elevata area superficiale permettono la semina e la crescita di alta densità cellulare in un piccolo volume (2×10 7 / ml) (Figura 2B). Inoltre, l'elevata porosità del patibolo permette per la diffusione illimitata di sostanze nutritive e di rifiuti con conseguente redditività superiore di colture cellulari dense un lasso di tempo prolungato. Dopo la semina i neuroni rapidamente ed uniformemente fissarle con la superficie dei pori ponteggio. Dopo l'adesione cellulare è completa e le cellule sono in equilibrio sul substrato di seta, l'impalcatura spugna è riempito con la matrice di collagene morbido per fornire un ambiente 3D per la formazione della rete assonale (Figura 3 </strong>). In assenza della matrice di collagene la compartimentazione di assoni e corpi cellulari non è possibile in quanto i neuroni crescono estensioni solo sulla superficie dei pori con conseguente reti miste come trovata con superfici 2D (Figura 3B). Al contrario, il gel di collagene fornisce un reticolo che supporta una vasta crescita degli assoni in 3D, mentre i corpi cellulari neuronali rimangono attaccate al ponteggio seta (Figura 3C). Questo modello di crescita porta a compartimentazione dei corpi cellulari e reti assonale puri (Figura 3D), che ricorda la materia grigia e bianca della corteccia del cervello. Oltre microscopia, i costrutti possono essere valutati con una varietà di altri metodi 18, a seconda della domanda dietro l'esperimento. Ad esempio, l'isolamento di DNA, RNA e di proteine ​​dei costrutti può essere facilmente realizzato utilizzando kit commerciali (Figura 4). La resa degli acidi nucleici e proteine ​​per costrutto dipende dal numero di cellule inizialmente seminate su scaffold seta. Più cellule seminate maggiore la resa di DNA, RNA e proteine. Figura 1. stampo in PTFE utilizzati per la preparazione di spugna di seta patibolo le dimensioni:.. 10 cm di diametro, 2 cm altezza Cliccate qui per vedere una versione più grande di questa figura. Figura 2. Modello 3D tessuto cerebrale-like. (A) poroso spugna seta patibolo. (B) Risultati in diretta colorazione / morti di neuroni al giorno 1 su semina sull'impalcatura di seta prima di collagene embedding (cellule verdi-live, le cellule rosse-morti). I pannelli sul lato destro mostrano la magnification di area catturata in cornici rosse. Cliccate qui per vedere una versione più grande di questa figura. Figura 3. neuronale escrescenza compartimenti stagni nel modello di tessuto cerebrale 3D-like (A) scompartimenti impalcature:. Red-cell vano corpo, vano Blu-assonale. (B) modello di crescita neuronale al giorno 1 su semina prima collagene incorporamento. (C). Escrescenza neuronale al giorno 7 su seminare nel vano corpo cellulare. (D) escrescenza neuronale al giorno 7 su semina nel compartimento assonale. Verde -. ΒIIITubulin Cliccate qui per vedere una versione più grande di questofigura. Figura 4. Rendimento atteso di (A) RNA e DNA, e (B) proteine ​​per costrutto in relazione alla quantità di cellule seminati per ponteggio (± SD, n = 5). Cliccate qui per vedere una versione più grande di questa figura .

Discussion

Here we described the guidelines to assemble a compartmentalized 3D brain-like tissue model. The model is characterized by dense polarized culture of neurons resulting in the development of two morphologically different compartments: one containing densely packed cell bodies, second containing pure axonal networks. Overall, the scaffold architecture and growth pattern mimic brain cortical tissue including the six laminar layers and white matter tracts21.

The donut-shaped silk protein-based tissue model allows for modifications and tuning of mechanical properties, versatile structural forms, hydrogel fillers and cellular components. Thus, this tissue model establishes a base platform for a wide range of studies. Silk is a favorable candidate for biomaterial platforms due to its biocompatibility, aqueous-based processing, and robust mechanical and degradation properties22. The silk matrix also serves as a stable anchor to reduce collagen gel contraction over time in culture. The properties such as silk concentration and porosity of the scaffold used in this model have been previously adjusted to achieve optimal cell growth and mechanical properties resulting in brain-like tissue elasticity18,23,24. We suggest to keep these parameters constant to ensure the successful outcome and reproducibility of the experiments.

The 3D neuronal network formation was achieved by combining two types of biomaterials with different mechanical properties: a stiff scaffold to provide neuronal anchoring and a softer gel matrix to permit axon penetration and connectivity in 3D. Selective material preferences of the silk scaffold and soft hydrogel provide the underlying principle for compartmentalizing the neurons from the axonal connections. Due to the inert nature of the silk scaffold, functionalization with poly-D-lysine is required for neuronal attachment. However, other cell adhesion promoting factors can be applied such as RGD25 or fibronectin26. To achieve the 3D network formation the silk scaffold needs to be filled with hydrogel in a timely manner as soon as neurons are attached to the scaffold. Likewise, the collagen matrix filler can be replaced by other hydrogels, thus allowing the study of the influence of 3D extracellular environments on axonal network formation to serve as a platform to evaluate novel hydrogels in terms of neuronal compatibility. Additionally, apart from rat cortical neurons other neuronal sources such as hippocampal neurons or induced pluripotent cell (iPSc)-derived neurons can be utilized. Moreover, the tissue model can be used to study heterocellular interactions by including glial cells along with neurons and to build more complex brain-like tissue.

As shown previously, our model can be utilized to evaluate neuronal functionality in 3D microenvironment with a variety of assays such as cell viability, gene expression, LC-MS/MS and electrophysiology, thus demonstrating physiological relevance of the model18. Other methods, which are frequently utilized to evaluate 3D tissue-engineered constructs, such as immunostaining and microscopy8,9,11 can also be used to assess cell distribution and extent of axonal network formation. However, it has to be noted, that due to the high density of the collagen matrix, the penetration of antibodies and depth of the imaging is limited to few hundred micrometers. Moreover, the signal to noise ratio may be affected by nonspecific background fluorescence. This can be overcome by using lipophilic cell tracers and genetically expressed fluorescent proteins which diminish the need for immunostaining11. Alternatively, the imaging can be performed with 2-photon microscopy instead of usual one-photon technique, which may reduce the signal loss, photobleaching, and can be extended to several hundred micrometers of depth.

Summarizing, the silk and collagen-based brain-like tissue offers a robust platform to study neuronal networks in 3D and is a starting point for the development of more advanced models of neurological disorders in the future. Independent from the mode of evaluation, the relative simplicity of this tissue model supports its utility, success and reproducibility.

Divulgations

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

We thank the laboratory of Dr. Stephen Moss for providing embryonic rat brain tissues. M.D.T. designed the original protocol. This work was funded by National Institutes of Health P41 Tissue Engineering Resource Center Grant EB002520. K.C. was supported with Postdoctoral Fellowship from German Research Foundation (DFG) (CH 1400/2-1).

Materials

Na2CO3 Sigma-Aldrich 223530
LiBr Sigma-Aldrich 213225
MWCO 3500 dialysis cassettes  Thermo Fisher 66110
Heating plate Fisher Scientific Isotemp
Centrifuge 5804 R Eppendorf
Sieve Fisher Scientific No. 270, No. 35, No. 30
PTFE mold made in house (Figure 1) 10 cm diameter, 2 cm height
NaCl Sigma-Aldrich 71382
Biopsy Punch 5mm World Precision Instrument 501909
Biopsy Punch 2mm World Precision Instrument 501908
poly-D-lysine Sigma-Aldrich P6407-5MG final concentration 10 ug/ml, dissolved in water
PBS Sigma-Aldrich D1283-500ML
Trypsin Sigma-Aldrich T4049-500ML
DNase Roche 10104159001 final concentration 0.3%
Soybean protein Sigma-Aldrich T6522-100MG final concentration 1 mg/ml
Neurobasal medium Gibco 21103049 warm up to 37°C before use
B27 supplement 50x Gibco 17504-044
Glutamax Gibco 35050-061
Penicilin Streptomycin Corning 30-002-CI
Collagen I, rat tail, 100 mg Corning 354236 final concentration 3 mg/ml
NaOH Sigma-Aldrich S2770 corrosive
Propidium Iodide Sigma-Aldrich P4170-10MG toxic
Fluorescein Diacetate Sigma-Aldrich F7378-5G
Olympus MVX10 Olympus
Paraformaldehyde Sigma-Aldrich P6148 toxic, final concentration 4%
Bovine Serum Albumin Sigma-Aldrich A7906-10G
anti-βIIITubulin antibody  Sigma-Aldrich T2200 rabbit 1:500
anti-rabbit Alexa-546 Molecular Probes A11010 goat 1:250
goat serum Sigma-Aldrich G9023-5ML
Leica SP2 confocal microscope Leica objective 20x
QIAshredder Qiagen 79654
AllPrep DNA/RNA/Protein Mini Kit Qiagen 80004
Ethyl alcohol, Pure Sigma-Aldrich E7023 
2-Mercaptoethanol Sigma-Aldrich 63689
NanoDrop 2000c/2000 UV-Vis Spectrophotometer Thermo Scientific
BCA protein assay Thermo Scientific 23225
Plate reader Spectramax M2 Molecular Devices absorbance 562 nm
Micro Scissors, Economy, Vannas-type TedPella 1346

References

  1. Dua, T., Janca, A., Kale, R., Montero, F., Muscetta, A., Peden, M. Chapter 1, Public health principles and neurological disorders. Neurological Disorders. , (2005).
  2. Ohtsuki, S., Hirayama, M., Ito, S., Uchida, Y., Tachikawa, M., Teresaki, T. Quantitative targeted proteomics for understanding the blood-brain barrier: towards pharmacoproteomics. Expert. Rev. Proteomic. 11 (3), 303-313 (2014).
  3. Hyder, F., Rothman, D. L., Bennett, M. R. Cortical energy demands of signaling and nonsignaling components in brain are conserved across mammalian species and activity levels. Proc Natl Acad Sci USA. 110 (9), 3549-3554 (2013).
  4. Wesseling, H., et al. A combined metabonomic and proteomic approach identifies frontal cortex changes in a chronic phencyclidine rat model in relation to human schizophrenia brain pathology. Neuropsychopharmacology. 38 (12), 2532-2544 (2013).
  5. Fawcett, J. W., Housden, E., Smith-Thomas, L., Meyer, R. L. The growth of axons in three-dimensional astrocyte cultures. Dev Biol. 135 (2), 449-458 (1989).
  6. Cullen, D. K., Simon, C. M., LaPlaca, M. C. Strain rate-dependent induction of reactive astrogliosis and cell death in three-dimensional neuronal-astrocytic co-cultures. Brain Res. 1158, 103-115 (2007).
  7. East, E., de Oliveira, D. B., Golding, J. P., Phillips, J. B. Alignment of astrocytes increases neuronal growth in three-dimensional collagen gels and is maintained following plastic compression to form a spinal cord repair conduit. Tissue Eng. Part A. 16 (10), 3173-3184 (2010).
  8. Dubois-Dauphin, M. L., Toni, N., Julien, S. D., Charvet, I., Sundstrom, L. E., Stoppini, L. The long-term survival of in vitro engineered nervous tissue derived from the specific neural differentiation of mouse embryonic stem cells. Biomaterials. 31 (27), 7032-7042 (2010).
  9. Lancaster, M. A., et al. Cerebral organoids model human brain development and microcephaly. Nature. 501 (7467), 373-379 (2013).
  10. Hogberg, H. T., et al. Toward a 3D model of human brain development for studying gene/environment interactions. Stem Cell Res Ther. 4, S4 (2013).
  11. Kato-Negishi, M., Morimoto, Y., Onoe, H., Takeuchi, S. Millimeter-sized neural building blocks for 3D heterogeneous neural network assembly. Adv Healthc Mater. 2 (12), 1564-1570 (2013).
  12. Watanabe, K., Nakamura, M., Okano, H., Toyama, Y. Establishment of three-dimensional culture of neural stem/progenitor cells in collagen type-1 gel. Restor Neurol Neurosci. 25 (2), 109-117 (2007).
  13. Aurand, E. R., Wagner, J. L., Shandas, R., Bjugstad, K. B. Hydrogel formulation determines cell fate of fetal and adult neural progenitor cells. Stem Cell Res. 12 (1), 11-23 (2014).
  14. Gurkan, U. A., et al. et al..Simple precision creation of digitally specified, spatially heterogeneous, engineered tissue architectures. Adv Mater. 25 (8), 1192-1198 (2013).
  15. Mironov, V., Boland, T., Trusk, T., Forgacs, G., Markwald, R. R. Organ printing: computer-aided jet-based 3D tissue engineering. Trends Biotechnol. 21 (4), 157-161 (2003).
  16. Taylor, A. M., Blurton-Jones, M., Rhee, S. W., Cribbs, D. H., Cotman, C. W., Jeon, N. L. A microfluidic culture platform for CNS axonal injury, regeneration and transport. Nature. 2 (8), 599-605 (2005).
  17. Tang-Schomer, M. D., Davies, P., Graziano, D., Thurber, A. E., Kaplan, D. L. Neural circuits with long-distance axon tracts for determining functional connectivity. J Neurosci Methods. 222, 82-90 (2014).
  18. Tang-Schomer, M. D., et al. Bioengineered functional brain-like cortical tissue. Proc Natl Acad Sci USA. 111 (38), 13811-13816 (2014).
  19. Rockwood, D. N., Preda, R. C., Yücel, T., Wang, X., Lovett, M. L., Kaplan, D. L. Materials fabrication from Bombyx mori silk fibroin. Nat Protoc. 6, 1612-1631 (2011).
  20. Lawrence, B. D., Pan, Z., Weber, M. D., Kaplan, D. L., Rosenblatt, M. I. Silk film culture system for in vitro analysis and biomaterial design. J. Vis. Exp. (62), e3646 (2012).
  21. Maddah, M., Grimson, W. E., Warfield, S. K., Wells, W. M. A unified framework for clustering and quantitative analysis of white matter fiber tracts. Med Image Anal. 12 (2), 191-202 (2008).
  22. Vepari, C., Kaplan, D. L. Silk as a biomaterial. Prog Polym Sci. 32 (8-9), 8-9 (2007).
  23. Yao, D., et al. Salt-leached silk scaffolds with tunable mechanical properties. Biomacromolecules. 13 (11), 3723-3729 (2012).
  24. Kim, U. J., Park, J., Kim, H. J., Wada, M., Kaplan, D. L. Three-dimensional aqueous-derived biomaterial scaffolds from silk fibroin. Biomaterials. 26 (15), 2775-2785 (2005).
  25. Gil, E. S., Mandal, B. B., Park, S. H., Marchant, J. K., Omentetto, F. G., Kaplan, D. L. Helicoidal multi-lamellar features of RGD-functionalized silk biomaterials for corneal tissue engineering. Biomaterials. 31 (34), 8953-8963 (2010).
  26. Hopkins, A. M., et al. Silk hydrogels as soft substrates for neural tissue engineering. Adv Funct Mater. 23 (41), 5140-5149 (2013).
  27. Pacifici, M., Peruzzi, F. Isolation and culture of rat embryonic neural cells: A quick protocol. Vis. Exp. (63), e3965 (2012).

Play Video

Citer Cet Article
Chwalek, K., Sood, D., Cantley, W. L., White, J. D., Tang-Schomer, M., Kaplan, D. L. Engineered 3D Silk-collagen-based Model of Polarized Neural Tissue. J. Vis. Exp. (104), e52970, doi:10.3791/52970 (2015).

View Video