Summary

Humano madre pluripotentes células Basado Toxicidad para el desarrollo de ensayos de la seguridad química Detección y biología de sistemas de generación de datos

Published: June 17, 2015
doi:

Summary

Los protocolos describen dos sistemas in vitro en las pruebas de toxicidad del desarrollo (UKK y UKN1) basado en células madre embrionarias humanas y estudios transcriptoma. Los sistemas de pruebas predicen riesgo de toxicidad para el desarrollo humano, y pueden contribuir a reducir los estudios en animales, los costos y el tiempo requerido para las pruebas de seguridad química.

Abstract

Protocolos eficientes para diferenciar células madre pluripotentes humanas a diversos tejidos en combinación con las tecnologías ómicas abrieron nuevos horizontes para las pruebas de toxicidad in vitro en las drogas potenciales. Para proporcionar una base científica sólida para este tipo de ensayos, será importante para obtener información cuantitativa sobre la evolución en el tiempo de desarrollo y sobre los mecanismos reguladores subyacentes de enfoques de biología de sistemas. Por lo tanto, dos ensayos se han sintonizado aquí por estos requisitos. En el sistema de prueba UKK, las células madre embrionarias humanas (células madre) (u otras células pluripotentes) se dejan a diferenciar de forma espontánea durante 14 días en cuerpos embrioides, para permitir la generación de las células de las tres capas germinales. Este sistema recapitula pasos clave del desarrollo temprano de embriones humanos, y puede predecir la toxicidad embrionaria temprana / teratogenicidad humano específico, si las células están expuestas a productos químicos durante la diferenciación. El sistema de prueba UKN1 se basa en la diferenciación de células madre a un population progenitor de neuroectodérmico (NEP) las células durante 6 días. Este sistema recapitula el desarrollo neuronal temprana y predice neurotoxicidad del desarrollo temprano y cambios epigenéticos provocadas por productos químicos. Ambos sistemas, en combinación con estudios de microarrays transcriptoma, son adecuados para la identificación de biomarcadores de toxicidad. Además, pueden ser utilizados en combinación para generar datos de entrada para el análisis de la biología de sistemas. Estos sistemas de prueba tienen ventajas sobre los estudios toxicológicos tradicionales que requieren grandes cantidades de animales. Los sistemas de pruebas pueden contribuir a una reducción de los costos de desarrollo de fármacos y la evaluación de la seguridad química. Su combinación arroja luz sobre todo en los compuestos que pueden influir en el desarrollo neurológico en concreto.

Introduction

La capacidad de las células madre embrionarias humanas (hESC) de diferenciarse en varios tipos de células se abrió una nueva era de las pruebas de toxicidad in vitro 1, el modelado de la enfermedad y la medicina regenerativa 2. Las células madre están dotados de la capacidad de auto-replicarse, para mantener su estado pluripotente, y para diferenciarse en células especializadas 3,4. Las propiedades de células madre (capacidad para diferenciar a todos los principales tipos de células) se encuentran también en otras células madre pluripotentes humanas, tales como células inducidas humanas pluripotenciales (hiPSC) o células generadas por transferencia nuclear 5. Por ejemplo, muchas diferentes líneas de células madre se han diferenciado en neuronas, células renales 6 7, las células de la cresta neural 8, 9-12 cardiomiocitos, o hepatocitos como las células 13,14. Por otra parte, células madre puede diferenciar de forma espontánea en las células de las tres capas germinales 15-18 en cuerpos embrioides (EBS) 19,20. Edesarrollo embrionario arly está regulada por la expresión diferencial de diversos genes relacionados con las diferentes capas germinales que ha sido capturado en el nivel de ARNm por transcriptómica utilizando la tecnología de microarrays 15. Estos esfuerzos dieron como resultado el establecimiento de modelos toxicológicos específicos de órganos basados ​​en células madre / hiPSC y análisis transcriptómica (para revisión ver 21,22). Estos modelos tienen ventajas sobre el uso tradicional de los animales de laboratorio para estudios toxicológicos, como estudios preclínicos utilizando animales de laboratorio no siempre son predictivos de la seguridad de las personas. Las toxicidades inducidas por las drogas encontradas en los pacientes suelen estar relacionados con los procesos metabólicos o de señalización que difieren entre humanos y animales de experimentación. La diferencia especie ha impedido la detección temprana fiable de toxicidad para el desarrollo en los seres humanos, y para los medicamentos de instancia como la talidomida y el dietilestilbestrol 23,24 25,26 fueron retirados del mercado debido a la teratogenicidad. ThaliDomide no ha demostrado ninguna toxicidad para el desarrollo en las ratas o ratones. Productos químicos ambientales como metil mercurio 27 resultaron en toxicidad para el desarrollo prenatal con respecto al sistema nervioso en varias especies, pero las manifestaciones humanas han sido difíciles de modelar en animales. Para abordar el problema de las cuestiones de especificidad de especie, los científicos que trabajan en diferentes proyectos basados ​​en células madre como ReProTect, ESNATS, DETECTIVE etc., están comprometidos en el desarrollo de diferentes modelos de toxicidad embrionaria, neurotoxicidad, cardiotoxicidad, hepatotoxicidad y nefrotoxicidad utilizando sustancias tóxicas humanos sospechosos de afectar a los humanos. En el marco del proyecto de consorcio europeo 'Embryonic Novel Alternativo de Prueba Estrategias basadas en células madre (ESNATS)' cinco sistemas de prueba se han establecido. Un sistema de prueba de la llamada UKK (niversitäts k linikum K OLN U) sistema de prueba capta parcialmente desarrollo temprano de embriones humanos. En este sistema células H9 embrionarias humanas se diferencian en tres capas germinales (ectodermo, endodermo y mesodermo) 15 y la capa de germen de firmas específicas han sido capturados por la transcriptómica perfil utilizando la plataforma de microarrays de Affymetrix. Varios tóxicos del desarrollo como la talidomida 28, ácido valproico, metil mercurio 16,17, o citosina arabinósido 15 se han probado en este sistema, y se han obtenido tóxica específica de firmas de genes. En un segundo sistema de ensayo, el llamado el (niversity U de K onsta n z) UKN1 sistema de prueba 1, las células H9 se diferencian a células progenitoras neuroectodérmico (NEP) durante 6 días. Prueba de ello es la alta expresión de genes marcadores neuronales como PAX6 y OTX2. Durante la diferenciación durante 6 días, las células NEP han estado expuestos a neuro-tóxicos del desarrollo tales como VPA, el mercurio de metilo. Perfiles específicos Tóxico-de-regulada transcriptómica han sido obtedefine así mediante el uso de la plataforma de microarrays de Affymetrix 16,29.

La nueva visión de la toxicología del siglo 21 prevé que los sistemas de pruebas no sólo se dan descripciones fenotípicas como histopatología en vivo, o cambios transcriptoma al final de las incubaciones de tóxico a largo plazo. Más bien sugiere que los ensayos proporcionan información mecanicista 3, y que esta información se pueden asignar a las llamadas vías de resultados adversos (AOP) que proporcionan una justificación científica para efectos peligrosos 30. Para proporcionar dicha información, los sistemas de ensayo aplicados tienen que ser altamente calidad controlada 31, como por ejemplo documentado por los procedimientos de operación estándar robustos. Por otra parte, los cambios dependientes del tiempo necesitan ser asignada con alta resolución. Esto requiere que los sistemas de ensayo con cambios sincronizados 32. Los sistemas de prueba UKN1 y UKK aquí descritos han sido optimizados para estos requisitos.

Protocol

El siguiente protocolo se realizó usando la línea de células madre embrionarias humanas (CMEH) H9. Esta línea celular se cultivaron de forma rutinaria en fibroblastos de ratón mitóticamente inactivadas embrionarias (MEFs) en medios de cultivo suplementados con células madre bFGF y luego cultivadas en medios de células madre en placas de Petri de 6 cm recubiertas con matriz de membrana basal, como Matrigel, para deshacerse de MEFs. Las células H9 de> 80% en placas confluentes se ut…

Representative Results

La exposición al mercurio de metilo en el sistema de prueba UKK El ensayo de citotoxicidad se realizó con H9 EBs para obtener un valor IC 10 (reducción de la viabilidad por 10%) para la citotoxicidad de mercurio de metilo (Figura 1). También se realizó un microarray basada (plataforma Affymetrix) estudio de biomarcadores. El H9 EBS haber estado expuesto al mercurio de metilo (0,25 y 1 M) durante 14 días. El día 14, las muestras se han recogido usando TRIzol…

Discussion

Los enfoques tradicionales de ensayo toxicológico implican amplios estudios con animales que hacen tanto las pruebas costoso y requiere mucho tiempo. Por otra parte, debido a las diferencias interespecies los estudios de seguridad preclínicos en animales no son siempre válidos para predecir los efectos de toxicidad de los fármacos potenciales pertinentes para los seres humanos. Aunque los primates no humanos son más predecibles, todavía fuerte ética y demandas socioeconómicas están elevando rápidamente por las…

Divulgations

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

We thank M. Kapitza, Margit Henry, Tamara Rotshteyn, Susan Rohani and Cornelia Böttinger for excellent technical support. This work was supported by grants from the German Research Foundation (RTG 1331) and the German Ministry for Research (BMBF).

Materials

DMEM/F-12 Life Technologies 11320082 Dulbecco's Modified Eagle Medium:Nutrient Mixture F-12
KOSR Life Technologies 10828028 Knockout Serum Replacement
GlutaMAX Life Technologies 35050061 GlutaMAX supplement
NEAA Life Technologies 11140050 MEM Nonessential Amino Acids Solution
DPBS Life Technologies 14190-0144 Dulbecco's Phosphate-Buffered Saline, without calcium, without magnesium
mTeSR medium Stemcell Technologies 5850
Pluronic F-127 Sigma P2443-250G
V bottom plate VWR 734-0483 Plate,Microwell,V BTTM,96 Well,Sterile 1 * 50 ST
Vbottom plate lid VWR 634-0011 Lid, Microtitre plates, Cond. Ring 1 * 50 ST
Pen/Strep Life Technologies 15140-122 Penicillin- Streptomycin, Liquid
Distilled Water Life Technologies 15230-089. Sterile Distilled Water
Human FGF-2 (bFGF) Millipore GF003AF-100UG Fibroblast Growth Factor basic, human recombinant, animal-free
Filter 0.22 μm Millipore SCGPU02RE Stericup-GP, 0.22 μm, polyethersulfone, 250 ml, radio- sterilized
StemPro EZPassageTM Disposablte Invitrogen 23181010
BD MatrigelTM, hESC qualified Matrix Stemcell Technologies 354277 5 ml vial
DMSO Sigma D-2650
RNAlater Stabilization Solution Life Technologies AM7020 It stabilizes and protect the RNA integrity in unfrozen samples.
70 μm Cell Strainer Becton Dickinson 352350 Cell strainer with 70 μm Nylon mesh
35 μm Lid cell strainer, 5 ml tube Becton Dickinson 352235 5 ml polystyrene round bottom test tube, with a cell strainer cap (35 μm)
50 ml sterile Polypropylene tube Greiner Bio-One 227261 50 ml Polypropylene tube with conical bottom, Sterile
T75 flask Greiner Bio-One 658175 CELLSTAR Filter Cap Cell Culture 75 cm2 Flasks
TRIzol Life Technologies 10296010
96 well optical bottom plates Thermo Scientific 165305
CellTiter-Blue Promega G8081
Accutase PAA L11-007
Apotransferin Sigma-Aldrich T-2036
Dispase Worthington Biochemicals LS002104
Dorsomorphin Tocris Bioscience 3093
EDTA Roth 8043.2
FBS PAA A15-101
FGF-2 R&D Systems 233-FB
Gelatine Sigma-Aldrich G1890-100G
Glucose Sigma-Aldrich G7021-100G
GlutaMAX Gibco Invitrogen 35050-038
HEPES Gibco Invitrogen 15630-056
Insulin Sigma-Aldrich I-6634
Knockout DMEM Gibco Invitrogen 10829-018
Matrigel BD Biosciences 354234
Noggin R&D Systems 719-NG
PBS Biochrom AG L1825
Progesteron Sigma-Aldrich P7556
Putrescine Sigma-Aldrich P-5780
ROCK inhibitor Y-27632 Tocris Biosciences 1254
SB431542 Tocris Biosciences 1614
SDS Bio-Rad 161-0416
Selenium Sigma-Aldrich S-5261
β-Mercaptoethanol Gibco Invitrogen 31350-010
List of Kits
RNeasy Mini Kit (250) QIAGEN 74106
GeneChip Hybridization, Wash, and Stain Kit Affymetrix 900721, 22, 23 This kit provides all reagents required for hybridization wash and staining of microarrays.
Rnase-Free DNase Set QIAGEN 79254
List of equipment.
Inverted microscope Olympus IX71
Genechip Hybridisation Oven – 645 Affymetrix
Genechip Fluidics Station-450 Affymetrix
Affymetrix Gene-Chip Scanner-3000-7 G Affymetrix
Spectramax M5 Molecular Devices
List of softwares
Prism 4
Affymetrix GCOS
Partek Genomic Suite 6.25
Online tools for Functional annotation
DAVID
Onto-tools Intelligent Systems and Bioinformatics Laboratory

References

  1. Liu, W. W., Deng, Y. G., Liu, Y., Gong, W. R., Deng, W. B. Stem Cell Models for Drug Discovery and Toxicology Studies. Journal of Biochemical and Molecular Toxicology. 27 (1), 17-27 (2013).
  2. Zuba-Surma, E. K., Jozkowicz, A., Dulak, J. Stem Cells in Pharmaceutical Biotechnology. Current Pharmaceutical Biotechnology. 12 (11), 1760-1773 (2011).
  3. Leist, M., Hartung, T., Nicotera, P. The dawning of a new age of toxicology. ALTEX. 25 (2), 103-114 (2008).
  4. Kuegler, P. B., et al. Markers of murine embryonic and neural stem cells, neurons and astrocytes: reference points for developmental neurotoxicity testing. ALTEX. 27 (1), 17-42 (2010).
  5. Yamada, M., et al. Human oocytes reprogram adult somatic nuclei of a type 1 diabetic to diploid pluripotent stem cells. Nature. , (2014).
  6. Chambers, S. M., et al. Highly efficient neural conversion of human ES and iPS cells by dual inhibition of SMAD signaling. Nature Biotechnology. 27 (3), 275-280 (2009).
  7. Takasato, M., et al. Directing human embryonic stem cell differentiation towards a renal lineage generates a self-organizing kidney. Nature cell biology. 16 (1), 118-126 (2014).
  8. Zimmer, B., et al. Evaluation of Developmental Toxicants and Signaling Pathways in a Functional Test Based on the Migration of Human Neural Crest Cells. Environmental Health Perspectives. 120 (8), 1116-1122 (2012).
  9. Bosman, A., et al. Molecular and Functional Evidence of HCN4 and Caveolin-3 Interaction During Cardiomyocyte Differentiation from Human Embryonic Stem Cells. Stem Cells and Development. 22 (11), 1717-1727 (2013).
  10. Sartiani, L., et al. Developmental changes in cardiomyocytes differentiated from human embryonic stem cells: A molecular and electrophysiological approach. Stem Cells. 25 (5), 1136-1144 (2007).
  11. Xu, X. Q., et al. Chemically defined medium supporting cardiomyocyte differentiation of human embryonic stem cells. Differentiation. 76 (9), 958-970 (2008).
  12. Pal, R., Mamidi, M. K., Das, A. K., Bhonde, R. Comparative analysis of cardiomyocyte differentiation from human embryonic stem cells under 3-D and 2-D culture conditions. Journal of Bioscience and Bioengineering. 115 (2), 200-206 (2013).
  13. Subramanian, K., et al. Spheroid Culture for Enhanced Differentiation of Human Embryonic Stem Cells to Hepatocyte-Like Cells. Stem Cells and Development. 23 (2), 124-131 (2014).
  14. Sivertsson, L., Synnergren, J., Jensen, J., Bjorquist, P., Ingelman-Sundberg, M. Hepatic Differentiation and Maturation of Human Embryonic Stem Cells Cultured in a Perfused Three-Dimensional Bioreactor. Stem Cells and Development. 22 (4), 581-594 (2013).
  15. Jagtap, S., et al. Cytosine arabinoside induces ectoderm and inhibits mesoderm expression in human embryonic stem cells during multilineage differentiation. British Journal of Pharmacology. 162 (8), 1743-1756 (2011).
  16. Krug, A. K., et al. Human embryonic stem cell-derived test systems for developmental neurotoxicity: a transcriptomics approach. Archives of Toxicology. 87 (1), 123-143 (2013).
  17. Leist, M., et al. Test systems of developmental toxicity: state-of-the art and future perspectives. Archives of Toxicology. 87 (12), 2037-2042 (2013).
  18. Itskovitz-Eldor, J., et al. Differentiation of human embryonic stem cells into embryoid bodies compromising the three embryonic germ layers. Molecular medicine. 6 (2), 88-95 (2000).
  19. Khoo, M. L. M., et al. Growth and differentiation of embryoid bodies derived from human embryonic stem cells: Effect of glucose and basic fibroblast growth factor. Biology of Reproduction. 73 (6), 1147-1156 (2005).
  20. Son, M. Y., Kim, H. J., Kim, M. J., Cho, S. Physical Passaging of Embryoid Bodies Generated from Human Pluripotent Stem Cells. Plos One. 6 (5), (2011).
  21. Winkler, J., Sotiriadou, I., Chen, S., Hescheler, J., Sachinidis, A. The potential of embryonic stem cells combined with -omics technologies as model systems for toxicology. Current medicinal chemistry. 16 (36), 4814-4827 (2009).
  22. Gunaseeli, I., Doss, M. X., Antzelevitch, C., Hescheler, J., Sachinidis, A. Induced pluripotent stem cells as a model for accelerated patient- and disease-specific drug discovery. Current medicinal chemistry. 17 (8), 759-766 (2010).
  23. Miller, M. T., Stromland, K. Teratogen update: Thalidomide: A review, with a focus on ocular findings and new potential uses. Teratology. 60 (5), 306-321 (1999).
  24. Newman, C. G. H. Teratogen Update – Clinical Aspects of Thalidomide Embryopathy – A Continuing Preoccupation. Teratology. 32 (1), 133-144 (1985).
  25. Stern, L. In vivo assessment of the teratogenic potential of drugs in humans. Obstetrics and gynecology. 58 (5 Suppl), 3S-8S (1981).
  26. Lynch, H. T., Reich, J. W. Diethylstilbestrol, Genetics, Teratogenesis, and Tumor Spectrum in Humans. Medical Hypotheses. 16 (3), 315-332 (1985).
  27. Satoh, H. Behavioral teratology of mercury and its compounds. Tohoku Journal of Experimental Medicine. 201 (1), 1-9 (2003).
  28. Meganathan, K., et al. Identification of Thalidomide-Specific Transcriptomics and Proteomics Signatures during Differentiation of Human Embryonic Stem Cells. Plos One. 7 (8), (2012).
  29. Balmer, N. V., et al. Epigenetic changes and disturbed neural development in a human embryonic stem cell-based model relating to the fetal valproate syndrome. Human Molecular Genetics. 21 (18), 4104-4114 (2012).
  30. Smirnova, L., Hogberg, H. T., Leist, M., Hartung, T. Developmental neurotoxicity – Challenges in the 21st Century and In Vitro Opportunities. ALTEX. 31 (2), 129-156 (2014).
  31. Leist, M., Efremova, L., Karreman, C. Food for thought … considerations and guidelines for basic test method descriptions in toxicology. ALTEX. 27 (4), 309-317 (2010).
  32. Zimmer, B., et al. Coordinated waves of gene expression during neuronal differentiation of embryonic stem cells as basis for novel approaches to developmental neurotoxicity testing. Cell Death and Differentiation. 18 (3), 383-395 (2011).
  33. Kraljevic, S., Stambrook, P. J., Pavelic, K. Accelerating drug discovery. EMBO Reports. 5 (9), 837-842 (2004).
check_url/fr/52333?article_type=t

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Citer Cet Article
Shinde, V., Klima, S., Sureshkumar, P. S., Meganathan, K., Jagtap, S., Rempel, E., Rahnenführer, J., Hengstler, J. G., Waldmann, T., Hescheler, J., Leist, M., Sachinidis, A. Human Pluripotent Stem Cell Based Developmental Toxicity Assays for Chemical Safety Screening and Systems Biology Data Generation. J. Vis. Exp. (100), e52333, doi:10.3791/52333 (2015).

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